Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G346800.1
Synonym OMT1, ATOMT1
Functional annotation O-methyltransferase, putative, expressed
UniProt A0A1B6QMP9
Pfam PF08100
Panther DB PTHR11746 PTHR11746:SF106
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G54160 : O-methyltransferase 1
RAP-DB (Rice) LOC_Os08g06100.1 : O-methyltransferase, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a030079
Brachypodium -
Barley -
Wheat TraesCSU02G152500 , TraesCS5D02G528600
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G313850 - -
2 Sobic.008G191800 B3 DNA binding domain containing protein, expressed -
3 Sobic.005G057500 Leucine Rich Repeat family protein, expressed -
4 Sobic.010G064050 - -
5 Sobic.001G100650 - -
6 Sobic.005G080075 - -
7 Sobic.002G082350 - -
8 Sobic.003G318600 - -
9 Sobic.003G008400 acetyltransferase, GNAT family protein, expressed -
10 Sobic.003G254400 expressed protein -
11 Sobic.009G073200 expressed protein -
12 Sobic.002G124766 - -
13 Sobic.003G360500 glycosyl transferase, putative, expressed K00750: GYG1, glycogenin
14 Sobic.007G145300 zinc knuckle family protein, expressed -
15 Sobic.001G413400 matrix attachment region binding protein, putative, expressed -
16 Sobic.009G197350 - -
17 Sobic.009G156700 protein transport protein, putative, expressed -
18 Sobic.009G025950 - -
19 Sobic.009G082050 - -
20 Sobic.007G003300 - -


Gene co-expression network
sample Sobic001G346800 Sobic001G346800 Sobic002G313850 Sobic002G313850 Sobic001G346800--Sobic002G313850 Sobic008G191800 Sobic008G191800 Sobic001G346800--Sobic008G191800 Sobic005G057500 Sobic005G057500 Sobic001G346800--Sobic005G057500 Sobic010G064050 Sobic010G064050 Sobic001G346800--Sobic010G064050 Sobic001G100650 Sobic001G100650 Sobic001G346800--Sobic001G100650 Sobic005G080075 Sobic005G080075 Sobic001G346800--Sobic005G080075 Sobic002G082350 Sobic002G082350 Sobic001G346800--Sobic002G082350 Sobic003G318600 Sobic003G318600 Sobic001G346800--Sobic003G318600 Sobic003G008400 Sobic003G008400 Sobic001G346800--Sobic003G008400 Sobic002G313850--Sobic002G082350 Sobic002G313850--Sobic010G064050 Sobic002G313850--Sobic001G100650 Sobic002G313850--Sobic005G080075 Sobic002G313850--Sobic003G008400 Sobic009G073200 Sobic009G073200 Sobic002G313850--Sobic009G073200 Sobic001G413400 Sobic001G413400 Sobic002G313850--Sobic001G413400 Sobic003G254400 Sobic003G254400 Sobic002G313850--Sobic003G254400 Sobic002G313850--Sobic008G191800 Sobic008G191800--Sobic002G082350 Sobic008G191800--Sobic010G064050 Sobic008G191800--Sobic001G100650 Sobic008G191800--Sobic005G080075 Sobic008G191800--Sobic003G008400 Sobic008G191800--Sobic009G073200 Sobic003G360500 Sobic003G360500 Sobic008G191800--Sobic003G360500 Sobic008G191800--Sobic003G254400 Sobic008G191800--Sobic003G318600 Sobic005G057500--Sobic003G008400 Sobic005G057500--Sobic003G254400 Sobic005G057500--Sobic005G080075 Sobic005G057500--Sobic003G318600 Sobic005G057500--Sobic001G100650 Sobic005G057500--Sobic010G064050 Sobic005G057500--Sobic008G191800 Sobic005G057500--Sobic003G360500 Sobic005G057500--Sobic002G082350 Sobic010G064050--Sobic001G100650 Sobic010G064050--Sobic005G080075 Sobic010G064050--Sobic002G082350 Sobic010G064050--Sobic003G008400 Sobic010G064050--Sobic003G254400 Sobic010G064050--Sobic009G073200 Sobic010G064050--Sobic003G318600 Sobic010G064050--Sobic003G360500 Sobic010G064050--Sobic002G313850 Sobic001G100650--Sobic001G100650 Sobic001G100650--Sobic005G080075 Sobic001G100650--Sobic002G082350 Sobic001G100650--Sobic003G008400 Sobic001G100650--Sobic003G254400 Sobic001G100650--Sobic009G073200 Sobic001G100650--Sobic003G318600 Sobic001G100650--Sobic003G360500 Sobic001G100650--Sobic002G313850 Sobic005G080075--Sobic001G100650 Sobic005G080075--Sobic010G064050 Sobic005G080075--Sobic003G008400 Sobic005G080075--Sobic002G082350 Sobic005G080075--Sobic003G254400 Sobic005G080075--Sobic009G073200 Sobic005G080075--Sobic003G318600 Sobic005G080075--Sobic003G360500 Sobic005G080075--Sobic001G413400 Sobic002G082350--Sobic010G064050 Sobic002G082350--Sobic001G100650 Sobic002G082350--Sobic005G080075 Sobic002G082350--Sobic003G008400 Sobic002G082350--Sobic009G073200 Sobic002G082350--Sobic003G254400 Sobic002G082350--Sobic008G191800 Sobic002G082350--Sobic002G313850 Sobic007G145300 Sobic007G145300 Sobic002G082350--Sobic007G145300 Sobic003G318600--Sobic003G008400 Sobic003G318600--Sobic003G254400 Sobic003G318600--Sobic005G080075 Sobic003G318600--Sobic001G100650 Sobic003G318600--Sobic010G064050 Sobic003G318600--Sobic002G082350 Sobic003G318600--Sobic003G360500 Sobic003G318600--Sobic009G073200 Sobic003G318600--Sobic001G413400 Sobic003G008400--Sobic005G080075 Sobic003G008400--Sobic003G254400 Sobic003G008400--Sobic001G100650 Sobic003G008400--Sobic010G064050 Sobic003G008400--Sobic003G318600 Sobic003G008400--Sobic002G082350 Sobic003G008400--Sobic003G360500 Sobic003G008400--Sobic009G073200 Sobic003G008400--Sobic001G413400
Octagon: transcription factors


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