Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G340500.1
Synonym Sb03g038440
Functional annotation curculin-like lectin family protein, putative, expressed
UniProt A0A1B6Q6T1
Pfam PF01453
Panther DB PTHR32444 PTHR32444:SF6
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G51710 : D-mannose binding lectin protein with Apple-like carbohydrate-binding domain
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g61020.1 : curculin-like lectin family protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G461101 - -
2 Sobic.009G190100 expressed protein -
3 Sobic.008G157400 disease resistance protein RGA2, putative, expressed -
4 Sobic.008G133750 - -
5 Sobic.009G055700 splicing factor, arginine/serine-rich, putative, expressed K12896: splicing factor, arginine/serine-rich 7
6 Sobic.003G348300 expressed protein -
7 Sobic.008G053800 OsWAK24 - OsWAK receptor-like protein kinase, expressed -
8 Sobic.001G404950 - -
9 Sobic.002G082350 - -
10 Sobic.010G064050 - -
11 Sobic.001G100650 - -
12 Sobic.004G115950 - -
13 Sobic.005G080075 - -
14 Sobic.003G198850 - -
15 Sobic.003G008400 acetyltransferase, GNAT family protein, expressed -
16 Sobic.009G073200 expressed protein -
17 Sobic.007G145300 zinc knuckle family protein, expressed -
18 Sobic.003G254400 expressed protein -
19 Sobic.009G197350 - -
20 Sobic.009G156700 protein transport protein, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic003G340500 Sobic003G340500 Sobic001G461101 Sobic001G461101 Sobic003G340500--Sobic001G461101 Sobic009G190100 Sobic009G190100 Sobic003G340500--Sobic009G190100 Sobic008G157400 Sobic008G157400 Sobic003G340500--Sobic008G157400 Sobic008G133750 Sobic008G133750 Sobic003G340500--Sobic008G133750 Sobic009G055700 Sobic009G055700 Sobic003G340500--Sobic009G055700 Sobic003G348300 Sobic003G348300 Sobic003G340500--Sobic003G348300 Sobic008G053800 Sobic008G053800 Sobic003G340500--Sobic008G053800 Sobic001G404950 Sobic001G404950 Sobic003G340500--Sobic001G404950 Sobic002G082350 Sobic002G082350 Sobic003G340500--Sobic002G082350 Sobic001G461101--Sobic009G055700 Sobic001G461101--Sobic009G190100 Sobic001G461101--Sobic002G082350 Sobic007G145300 Sobic007G145300 Sobic001G461101--Sobic007G145300 Sobic010G064050 Sobic010G064050 Sobic001G461101--Sobic010G064050 Sobic001G100650 Sobic001G100650 Sobic001G461101--Sobic001G100650 Sobic009G197350 Sobic009G197350 Sobic001G461101--Sobic009G197350 Sobic009G156700 Sobic009G156700 Sobic001G461101--Sobic009G156700 Sobic005G080075 Sobic005G080075 Sobic001G461101--Sobic005G080075 Sobic009G190100--Sobic010G064050 Sobic009G190100--Sobic001G100650 Sobic009G190100--Sobic002G082350 Sobic009G190100--Sobic005G080075 Sobic009G190100--Sobic009G055700 Sobic003G008400 Sobic003G008400 Sobic009G190100--Sobic003G008400 Sobic003G254400 Sobic003G254400 Sobic009G190100--Sobic003G254400 Sobic009G073200 Sobic009G073200 Sobic009G190100--Sobic009G073200 Sobic003G318600 Sobic003G318600 Sobic009G190100--Sobic003G318600 Sobic008G157400--Sobic009G190100 Sobic007G203600 Sobic007G203600 Sobic008G157400--Sobic007G203600 Sobic008G157400--Sobic003G008400 Sobic008G157400--Sobic003G254400 Sobic008G157400--Sobic001G404950 Sobic008G157400--Sobic003G318600 Sobic008G157400--Sobic005G080075 Sobic003G360500 Sobic003G360500 Sobic008G157400--Sobic003G360500 Sobic008G157400--Sobic001G100650 Sobic008G133750--Sobic009G190100 Sobic008G133750--Sobic001G461101 SobicK004201 SobicK004201 Sobic008G133750--SobicK004201 Sobic008G133750--Sobic008G157400 Sobic004G092950 Sobic004G092950 Sobic008G133750--Sobic004G092950 Sobic002G117800 Sobic002G117800 Sobic008G133750--Sobic002G117800 Sobic008G133750--Sobic005G080075 Sobic008G133750--Sobic001G100650 Sobic008G133750--Sobic010G064050 Sobic009G055700--Sobic009G190100 Sobic009G055700--Sobic003G348300 Sobic009G055700--Sobic007G145300 Sobic009G055700--Sobic009G197350 Sobic009G055700--Sobic009G156700 Sobic002G269800 Sobic002G269800 Sobic009G055700--Sobic002G269800 Sobic009G055700--Sobic001G461101 Sobic002G124766 Sobic002G124766 Sobic009G055700--Sobic002G124766 Sobic003G126700 Sobic003G126700 Sobic009G055700--Sobic003G126700 Sobic003G348300--Sobic009G055700 Sobic003G348300--Sobic009G190100 Sobic003G348300--Sobic004G092950 Sobic003G348300--Sobic001G461101 Sobic003G348300--Sobic007G145300 Sobic010G252301 Sobic010G252301 Sobic003G348300--Sobic010G252301 Sobic003G361150 Sobic003G361150 Sobic003G348300--Sobic003G361150 Sobic003G348300--Sobic009G197350 Sobic003G348300--Sobic009G156700 Sobic004G023800 Sobic004G023800 Sobic008G053800--Sobic004G023800 Sobic003G198850 Sobic003G198850 Sobic008G053800--Sobic003G198850 Sobic003G288700 Sobic003G288700 Sobic008G053800--Sobic003G288700 Sobic008G056000 Sobic008G056000 Sobic008G053800--Sobic008G056000 Sobic008G053800--Sobic003G340500 Sobic001G440401 Sobic001G440401 Sobic008G053800--Sobic001G440401 Sobic006G065000 Sobic006G065000 Sobic008G053800--Sobic006G065000 Sobic002G246100 Sobic002G246100 Sobic008G053800--Sobic002G246100 Sobic003G024450 Sobic003G024450 Sobic008G053800--Sobic003G024450 Sobic003G383000 Sobic003G383000 Sobic001G404950--Sobic003G383000 Sobic001G404950--Sobic008G157400 Sobic001G404950--Sobic003G198850 Sobic001G404950--Sobic001G461101 Sobic001G072100 Sobic001G072100 Sobic001G404950--Sobic001G072100 Sobic001G404950--Sobic003G288700 Sobic004G115950 Sobic004G115950 Sobic001G404950--Sobic004G115950 Sobic001G404950--Sobic003G340500 Sobic001G404950--Sobic009G190100 Sobic002G082350--Sobic010G064050 Sobic002G082350--Sobic001G100650 Sobic002G082350--Sobic005G080075 Sobic002G082350--Sobic003G008400 Sobic002G082350--Sobic009G073200 Sobic002G082350--Sobic003G254400 Sobic008G191800 Sobic008G191800 Sobic002G082350--Sobic008G191800 Sobic002G313850 Sobic002G313850 Sobic002G082350--Sobic002G313850 Sobic002G082350--Sobic007G145300
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.