Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G048300.1
Synonym Sb04g004130
Functional annotation -
UniProt A0A194YMQ8
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.004G048300


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G179300 DEF9 - Defensin and Defensin-like DEFL family, expressed -
2 Sobic.008G070100 CRP7 - Cysteine-rich family protein precursor, expressed -
3 Sobic.007G040900 expressed protein -
4 Sobic.003G010000 cytochrome P450, putative, expressed -
5 Sobic.004G316200 DEFL71 - Defensin and Defensin-like DEFL family, expressed -
6 Sobic.005G174800 - -
7 Sobic.006G144201 - -
8 Sobic.010G258900 - -
9 Sobic.008G182100 - -
10 Sobic.008G069000 protein kinase family protein, putative, expressed K14500: BR-signaling kinase
11 Sobic.003G330800 LTPL29 - Protease inhibitor/seed storage/LTP family protein precursor, expressed -
12 Sobic.008G069600 CRP10 - Cysteine-rich family protein precursor, expressed -
13 Sobic.005G058400 - -
14 Sobic.004G008700 - -
15 Sobic.010G191301 - -
16 Sobic.003G099800 expressed protein -
17 Sobic.007G036400 expressed protein -
18 Sobic.001G266300 POEI3 - Pollen Ole e I allergen and extensin family protein precursor, expressed -
19 Sobic.002G332500 - -
20 Sobic.003G167566 - -


Gene co-expression network
sample Sobic004G048300 Sobic004G048300 Sobic003G179300 Sobic003G179300 Sobic004G048300--Sobic003G179300 Sobic008G070100 Sobic008G070100 Sobic004G048300--Sobic008G070100 Sobic007G040900 Sobic007G040900 Sobic004G048300--Sobic007G040900 Sobic003G010000 Sobic003G010000 Sobic004G048300--Sobic003G010000 Sobic004G316200 Sobic004G316200 Sobic004G048300--Sobic004G316200 Sobic005G174800 Sobic005G174800 Sobic004G048300--Sobic005G174800 Sobic006G144201 Sobic006G144201 Sobic004G048300--Sobic006G144201 Sobic010G258900 Sobic010G258900 Sobic004G048300--Sobic010G258900 Sobic008G182100 Sobic008G182100 Sobic004G048300--Sobic008G182100 Sobic003G179300--Sobic008G070100 Sobic003G179300--Sobic007G040900 Sobic003G179300--Sobic010G258900 Sobic003G179300--Sobic008G182100 Sobic003G179300--Sobic004G048300 Sobic003G179300--Sobic003G010000 Sobic003G330800 Sobic003G330800 Sobic003G179300--Sobic003G330800 Sobic003G179300--Sobic004G316200 Sobic003G179300--Sobic006G144201 Sobic008G070100--Sobic003G179300 Sobic008G070100--Sobic004G316200 Sobic008G070100--Sobic006G144201 Sobic008G070100--Sobic004G048300 Sobic008G070100--Sobic003G010000 Sobic008G070100--Sobic008G182100 Sobic008G070100--Sobic003G330800 Sobic008G070100--Sobic010G258900 Sobic008G070100--Sobic005G174800 Sobic007G040900--Sobic003G179300 Sobic007G040900--Sobic010G258900 Sobic007G040900--Sobic008G182100 Sobic007G040900--Sobic004G048300 Sobic007G040900--Sobic008G070100 Sobic007G040900--Sobic003G330800 Sobic007G040900--Sobic004G316200 Sobic007G040900--Sobic003G010000 Sobic003G099800 Sobic003G099800 Sobic007G040900--Sobic003G099800 Sobic003G010000--Sobic006G144201 Sobic003G010000--Sobic003G179300 Sobic003G010000--Sobic008G070100 Sobic003G010000--Sobic005G174800 Sobic005G058400 Sobic005G058400 Sobic003G010000--Sobic005G058400 Sobic003G010000--Sobic004G048300 Sobic003G010000--Sobic003G330800 Sobic008G069600 Sobic008G069600 Sobic003G010000--Sobic008G069600 Sobic003G010000--Sobic004G316200 Sobic004G316200--Sobic008G070100 Sobic004G316200--Sobic008G182100 Sobic004G316200--Sobic003G330800 Sobic004G316200--Sobic003G179300 Sobic004G316200--Sobic010G258900 Sobic010G191301 Sobic010G191301 Sobic004G316200--Sobic010G191301 Sobic004G316200--Sobic006G144201 Sobic002G332500 Sobic002G332500 Sobic004G316200--Sobic002G332500 Sobic004G316200--Sobic003G010000 Sobic005G174800--Sobic005G058400 Sobic005G174800--Sobic006G144201 Sobic005G174800--Sobic003G010000 Sobic005G174800--Sobic008G070100 Sobic005G174800--Sobic008G069600 Sobic003G167566 Sobic003G167566 Sobic005G174800--Sobic003G167566 Sobic005G174800--Sobic004G048300 Sobic005G174800--Sobic003G179300 Sobic001G266300 Sobic001G266300 Sobic005G174800--Sobic001G266300 Sobic006G144201--Sobic005G058400 Sobic006G144201--Sobic003G010000 Sobic006G144201--Sobic005G174800 Sobic006G144201--Sobic008G070100 Sobic006G144201--Sobic008G069600 Sobic006G144201--Sobic004G316200 Sobic006G144201--Sobic001G266300 Sobic006G144201--Sobic003G179300 Sobic006G144201--Sobic004G048300 Sobic010G258900--Sobic008G182100 Sobic010G258900--Sobic003G330800 Sobic010G258900--Sobic003G179300 Sobic010G258900--Sobic010G191301 Sobic010G258900--Sobic002G332500 Sobic010G258900--Sobic007G040900 Sobic010G258900--Sobic004G316200 Sobic010G258900--Sobic008G070100 Sobic003G139400 Sobic003G139400 Sobic010G258900--Sobic003G139400 Sobic008G182100--Sobic010G258900 Sobic008G182100--Sobic003G330800 Sobic008G182100--Sobic010G191301 Sobic008G182100--Sobic002G332500 Sobic008G182100--Sobic003G179300 Sobic008G182100--Sobic004G316200 Sobic008G182100--Sobic008G070100 Sobic008G182100--Sobic007G040900 Sobic008G182100--Sobic003G139400
Octagon: transcription factors


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