Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G137800.1
Synonym Sb05g020250
Functional annotation expressed protein
UniProt C5Y3Q5
Pfam -
Panther DB PTHR35161 PTHR35161:SF1
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os02g04570.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a029588
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G242300 ZOS1-19 - C2H2 zinc finger protein, expressed -
2 Sobic.007G145300 zinc knuckle family protein, expressed -
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14 Sobic.001G100650 - -
15 Sobic.005G080075 - -
16 Sobic.002G313850 - -
17 Sobic.007G193000 expressed protein -
18 Sobic.009G073200 expressed protein -
19 Sobic.003G440100 EF hand family protein, expressed -
20 Sobic.003G008400 acetyltransferase, GNAT family protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic005G137800 Sobic005G137800 Sobic003G242300 Sobic003G242300 Sobic005G137800--Sobic003G242300 Sobic007G145300 Sobic007G145300 Sobic005G137800--Sobic007G145300 Sobic009G197350 Sobic009G197350 Sobic005G137800--Sobic009G197350 Sobic009G156700 Sobic009G156700 Sobic005G137800--Sobic009G156700 Sobic002G124766 Sobic002G124766 Sobic005G137800--Sobic002G124766 Sobic002G269800 Sobic002G269800 Sobic005G137800--Sobic002G269800 Sobic007G003300 Sobic007G003300 Sobic005G137800--Sobic007G003300 Sobic008G191800 Sobic008G191800 Sobic005G137800--Sobic008G191800 Sobic003G126700 Sobic003G126700 Sobic005G137800--Sobic003G126700 Sobic003G242300--Sobic005G137800 Sobic003G242300--Sobic007G145300 Sobic002G082350 Sobic002G082350 Sobic003G242300--Sobic002G082350 Sobic003G242300--Sobic009G197350 Sobic003G242300--Sobic009G156700 Sobic010G064050 Sobic010G064050 Sobic003G242300--Sobic010G064050 Sobic001G100650 Sobic001G100650 Sobic003G242300--Sobic001G100650 Sobic003G242300--Sobic008G191800 Sobic003G242300--Sobic002G124766 Sobic007G145300--Sobic009G197350 Sobic007G145300--Sobic009G156700 Sobic007G145300--Sobic002G269800 Sobic007G145300--Sobic002G124766 Sobic007G145300--Sobic003G126700 Sobic007G145300--Sobic007G003300 Sobic007G145300--Sobic002G082350 Sobic006G223700 Sobic006G223700 Sobic007G145300--Sobic006G223700 Sobic007G145300--Sobic010G064050 Sobic009G197350--Sobic009G156700 Sobic009G197350--Sobic007G145300 Sobic009G197350--Sobic002G269800 Sobic009G197350--Sobic003G126700 Sobic009G197350--Sobic002G124766 Sobic009G197350--Sobic007G003300 Sobic009G197350--Sobic006G223700 Sobic009G197350--Sobic002G082350 Sobic007G193000 Sobic007G193000 Sobic009G197350--Sobic007G193000 Sobic009G156700--Sobic009G156700 Sobic009G156700--Sobic007G145300 Sobic009G156700--Sobic002G269800 Sobic009G156700--Sobic003G126700 Sobic009G156700--Sobic002G124766 Sobic009G156700--Sobic007G003300 Sobic009G156700--Sobic006G223700 Sobic009G156700--Sobic002G082350 Sobic009G156700--Sobic007G193000 Sobic002G124766--Sobic009G156700 Sobic002G124766--Sobic009G197350 Sobic002G124766--Sobic007G145300 Sobic002G124766--Sobic002G269800 Sobic002G124766--Sobic003G126700 Sobic002G124766--Sobic007G003300 Sobic002G124766--Sobic006G223700 Sobic002G124766--Sobic002G082350 Sobic002G124766--Sobic007G193000 Sobic002G269800--Sobic003G126700 Sobic002G269800--Sobic009G156700 Sobic002G269800--Sobic009G197350 Sobic002G269800--Sobic007G145300 Sobic002G269800--Sobic006G223700 Sobic002G269800--Sobic002G124766 Sobic002G269800--Sobic007G193000 Sobic002G269800--Sobic007G003300 Sobic008G154200 Sobic008G154200 Sobic002G269800--Sobic008G154200 Sobic007G003300--Sobic007G145300 Sobic007G003300--Sobic009G197350 Sobic007G003300--Sobic009G156700 Sobic007G003300--Sobic002G269800 Sobic007G003300--Sobic002G124766 Sobic007G003300--Sobic003G126700 Sobic007G003300--Sobic002G082350 Sobic007G003300--Sobic006G223700 Sobic007G003300--Sobic007G193000 Sobic008G191800--Sobic002G082350 Sobic008G191800--Sobic010G064050 Sobic008G191800--Sobic001G100650 Sobic005G080075 Sobic005G080075 Sobic008G191800--Sobic005G080075 Sobic003G008400 Sobic003G008400 Sobic008G191800--Sobic003G008400 Sobic009G073200 Sobic009G073200 Sobic008G191800--Sobic009G073200 Sobic003G360500 Sobic003G360500 Sobic008G191800--Sobic003G360500 Sobic003G254400 Sobic003G254400 Sobic008G191800--Sobic003G254400 Sobic003G318600 Sobic003G318600 Sobic008G191800--Sobic003G318600 Sobic003G126700--Sobic002G269800 Sobic003G126700--Sobic006G223700 Sobic003G126700--Sobic009G156700 Sobic003G126700--Sobic009G197350 Sobic003G126700--Sobic007G145300 Sobic003G126700--Sobic008G154200 Sobic003G126700--Sobic002G124766 Sobic003G126700--Sobic007G193000 Sobic003G126700--Sobic007G003300
Octagon: transcription factors


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