Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G193700.1
Synonym Sb05g025050
Functional annotation -
UniProt A0A1B6PTI3 , Q8LJZ4
Pfam PF01559
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
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Barley -
Wheat -
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cDNA sequences
Sobic.005G193700


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G158600 MYB family transcription factor, putative, expressed -
2 Sobic.001G253400 AP2 domain containing protein, expressed -
3 Sobic.006G051750 - -
4 Sobic.002G409250 - -
5 Sobic.003G091400 seven in absentia protein family domain containing protein, expressed -
6 Sobic.006G015750 - -
7 Sobic.003G135000 major facilitator superfamily antiporter, putative, expressed -
8 Sobic.004G261000 expressed protein -
9 Sobic.002G078800 LTPL169 - Protease inhibitor/seed storage/LTP family protein precursor, expressed -
10 Sobic.004G099750 - -
11 Sobic.005G153200 - -
12 Sobic.001G259250 - -
13 Sobic.006G178400 monocopper oxidase, putative, expressed -
14 Sobic.004G142000 - -
15 Sobic.007G034900 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence./late senescence marker during developmental senescence(PubMedID : 27586543)@cytochrome P450, putative, expressed -
16 Sobic.001G175501 - -
17 Sobic.009G040000 myb-like DNA-binding domain, SHAQKYF class family protein, expressed -
18 Sobic.010G200200 AP2 domain containing protein, expressed -
19 Sobic.006G080500 helix-loop-helix DNA-binding domain containing protein, expressed -
20 Sobic.005G056300 no apical meristem protein, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic005G193700 Sobic005G193700 Sobic001G158600 Sobic001G158600 Sobic005G193700--Sobic001G158600 Sobic001G253400 Sobic001G253400 Sobic005G193700--Sobic001G253400 Sobic006G051750 Sobic006G051750 Sobic005G193700--Sobic006G051750 Sobic002G409250 Sobic002G409250 Sobic005G193700--Sobic002G409250 Sobic003G091400 Sobic003G091400 Sobic005G193700--Sobic003G091400 Sobic006G015750 Sobic006G015750 Sobic005G193700--Sobic006G015750 Sobic003G135000 Sobic003G135000 Sobic005G193700--Sobic003G135000 Sobic004G261000 Sobic004G261000 Sobic005G193700--Sobic004G261000 Sobic002G078800 Sobic002G078800 Sobic005G193700--Sobic002G078800 Sobic001G158600--Sobic001G253400 Sobic001G158600--Sobic005G193700 Sobic001G158600--Sobic006G051750 Sobic001G158600--Sobic004G261000 Sobic001G158600--Sobic003G135000 Sobic004G099750 Sobic004G099750 Sobic001G158600--Sobic004G099750 Sobic007G034900 Sobic007G034900 Sobic001G158600--Sobic007G034900 Sobic001G158600--Sobic002G409250 Sobic005G153200 Sobic005G153200 Sobic001G158600--Sobic005G153200 Sobic001G253400--Sobic001G158600 Sobic001G253400--Sobic005G193700 Sobic001G253400--Sobic006G051750 Sobic009G040000 Sobic009G040000 Sobic001G253400--Sobic009G040000 Sobic001G253400--Sobic002G409250 Sobic001G253400--Sobic003G091400 Sobic001G253400--Sobic006G015750 Sobic001G253400--Sobic004G261000 Sobic001G253400--Sobic003G135000 Sobic006G051750--Sobic004G261000 Sobic006G051750--Sobic005G153200 Sobic001G259250 Sobic001G259250 Sobic006G051750--Sobic001G259250 Sobic006G051750--Sobic001G158600 Sobic004G142000 Sobic004G142000 Sobic006G051750--Sobic004G142000 Sobic006G051750--Sobic001G253400 Sobic006G051750--Sobic005G193700 Sobic006G051750--Sobic004G099750 Sobic010G200200 Sobic010G200200 Sobic006G051750--Sobic010G200200 Sobic002G409250--Sobic003G091400 Sobic002G409250--Sobic006G015750 Sobic002G409250--Sobic002G078800 Sobic002G409250--Sobic005G193700 Sobic002G409250--Sobic001G253400 Sobic006G178400 Sobic006G178400 Sobic002G409250--Sobic006G178400 Sobic002G192600 Sobic002G192600 Sobic002G409250--Sobic002G192600 Sobic006G080500 Sobic006G080500 Sobic002G409250--Sobic006G080500 Sobic002G409250--Sobic003G135000 Sobic003G091400--Sobic006G015750 Sobic003G091400--Sobic002G409250 Sobic003G091400--Sobic002G078800 Sobic003G091400--Sobic005G193700 Sobic003G091400--Sobic006G178400 Sobic003G091400--Sobic002G192600 Sobic003G091400--Sobic001G253400 Sobic003G091400--Sobic006G080500 Sobic003G091400--Sobic003G135000 Sobic006G015750--Sobic003G091400 Sobic006G015750--Sobic002G409250 Sobic006G015750--Sobic002G078800 Sobic006G015750--Sobic002G192600 Sobic006G015750--Sobic005G193700 Sobic006G015750--Sobic006G178400 Sobic006G015750--Sobic001G253400 Sobic006G015750--Sobic006G080500 Sobic009G052400 Sobic009G052400 Sobic006G015750--Sobic009G052400 Sobic005G056300 Sobic005G056300 Sobic003G135000--Sobic005G056300 Sobic003G135000--Sobic006G080500 Sobic003G135000--Sobic006G178400 Sobic003G135000--Sobic002G078800 Sobic003G135000--Sobic001G158600 Sobic003G135000--Sobic005G193700 Sobic003G135000--Sobic001G253400 Sobic003G135000--Sobic002G409250 Sobic003G135000--Sobic003G091400 Sobic004G261000--Sobic006G051750 Sobic004G261000--Sobic005G153200 Sobic004G261000--Sobic001G259250 Sobic004G261000--Sobic001G158600 Sobic004G261000--Sobic007G034900 Sobic004G261000--Sobic004G142000 Sobic009G116500 Sobic009G116500 Sobic004G261000--Sobic009G116500 Sobic004G261000--Sobic010G200200 Sobic008G081700 Sobic008G081700 Sobic004G261000--Sobic008G081700 Sobic002G078800--Sobic006G015750 Sobic002G078800--Sobic003G091400 Sobic002G078800--Sobic002G409250 Sobic002G078800--Sobic002G192600 Sobic002G078800--Sobic006G080500 Sobic002G078800--Sobic006G178400 Sobic002G078800--Sobic009G052400 Sobic002G078800--Sobic003G135000 Sobic002G078800--Sobic005G193700
Octagon: transcription factors


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