Gene annotation
Transcriptome id Sobic.006G059900.1
Synonym Sb06g014810, IPT3, ATIPT3
Functional annotation "ZmIPT2(Ortholog in maize:Weng et al., 2013)" (PubMedID : 31659896)
IPP transferase, putative, expressed
UniProt C5YFB2
Pfam PF01715
Panther DB PTHR11088 PTHR11088:SF37
NCBI CDD KOG1384; tRNA delta(2)-isopentenylpyrophosphate transferase
KEGG Orthology K10760; adenylate dimethylallyltransferase (cytokinin synthase)
Gene Ontology GO:0008033; tRNA processing


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G63110 : isopentenyltransferase 3
RAP-DB (Rice) LOC_Os03g24240.1 : IPP transferase, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G438700 AWPM-19-like membrane family protein, putative, expressed -
2 Sobic.004G313800 - -
3 Sobic.008G013100 expressed protein -
4 Sobic.005G223200 - -
5 Sobic.003G105600 no apical meristem protein, putative, expressed -
6 Sobic.001G326000 expressed protein -
7 Sobic.006G154300 Up-reguralion under heat(PubMedID : 24916767)@Up-reguralion under combine stress of drought and heat(PubMedID : 24916767)@KUN1 - Kunitz-type trypsin inhibitor precursor, expressed -
8 Sobic.007G156300 similar to Abscisic acid 8'-hydroxylase 2(PubMedID : 29862293)@cytochrome P450, putative, expressed -
9 Sobic.009G010150 - -
10 Sobic.006G031600 expressed protein -
11 Sobic.010G142300 - -
12 Sobic.009G022700 - -
13 Sobic.005G187100 - -
14 Sobic.009G186400 SSA1 - 2S albumin seed storage family protein precursor, expressed -
15 Sobic.009G009900 SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during dark-induced senescence.(PubMedID : 27586543)@inhibitor I family protein, putative, expressed -
16 Sobic.002G274900 harpin-induced protein 1 domain containing protein, expressed -
17 Sobic.007G001600 LTPL151 - Protease inhibitor/seed storage/LTP family protein precursor, expressed -
18 Sobic.009G010000 expressed protein -
19 Sobic.002G077500 LTPL169 - Protease inhibitor/seed storage/LTP family protein precursor, expressed -
20 Sobic.003G392500 cytochrome P450, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic006G059900 Sobic006G059900 Sobic003G438700 Sobic003G438700 Sobic006G059900--Sobic003G438700 Sobic004G313800 Sobic004G313800 Sobic006G059900--Sobic004G313800 Sobic008G013100 Sobic008G013100 Sobic006G059900--Sobic008G013100 Sobic005G223200 Sobic005G223200 Sobic006G059900--Sobic005G223200 Sobic003G105600 Sobic003G105600 Sobic006G059900--Sobic003G105600 Sobic001G326000 Sobic001G326000 Sobic006G059900--Sobic001G326000 Sobic006G154300 Sobic006G154300 Sobic006G059900--Sobic006G154300 Sobic007G156300 Sobic007G156300 Sobic006G059900--Sobic007G156300 Sobic009G010150 Sobic009G010150 Sobic006G059900--Sobic009G010150 Sobic003G438700--Sobic004G313800 Sobic003G438700--Sobic006G154300 Sobic003G438700--Sobic009G010150 Sobic002G274900 Sobic002G274900 Sobic003G438700--Sobic002G274900 Sobic007G001600 Sobic007G001600 Sobic003G438700--Sobic007G001600 Sobic003G438700--Sobic006G059900 Sobic003G226000 Sobic003G226000 Sobic003G438700--Sobic003G226000 Sobic003G438700--Sobic005G223200 Sobic009G009900 Sobic009G009900 Sobic003G438700--Sobic009G009900 Sobic004G313800--Sobic003G438700 Sobic004G313800--Sobic006G154300 Sobic004G313800--Sobic009G010150 Sobic004G313800--Sobic005G223200 Sobic004G313800--Sobic009G009900 Sobic009G010000 Sobic009G010000 Sobic004G313800--Sobic009G010000 Sobic004G313800--Sobic007G001600 Sobic003G392500 Sobic003G392500 Sobic004G313800--Sobic003G392500 Sobic004G313800--Sobic007G156300 Sobic008G013100--Sobic003G105600 Sobic008G013100--Sobic006G059900 Sobic009G022700 Sobic009G022700 Sobic008G013100--Sobic009G022700 Sobic008G013100--Sobic001G326000 Sobic008G013100--Sobic003G438700 Sobic009G186400 Sobic009G186400 Sobic008G013100--Sobic009G186400 Sobic003G323000 Sobic003G323000 Sobic008G013100--Sobic003G323000 Sobic008G013100--Sobic004G313800 Sobic005G187100 Sobic005G187100 Sobic008G013100--Sobic005G187100 Sobic010G142300 Sobic010G142300 Sobic005G223200--Sobic010G142300 Sobic005G223200--Sobic004G313800 Sobic006G031600 Sobic006G031600 Sobic005G223200--Sobic006G031600 Sobic006G034275 Sobic006G034275 Sobic005G223200--Sobic006G034275 Sobic005G223200--Sobic007G156300 Sobic005G223200--Sobic003G392500 Sobic005G223200--Sobic009G009900 Sobic005G223200--Sobic009G010000 Sobic005G223200--Sobic006G154300 Sobic003G105600--Sobic009G186400 Sobic003G105600--Sobic001G326000 Sobic002G077500 Sobic002G077500 Sobic003G105600--Sobic002G077500 Sobic003G105600--Sobic008G013100 Sobic003G105600--Sobic009G022700 Sobic003G105600--Sobic007G156300 Sobic003G105600--Sobic006G059900 SobicK043500 SobicK043500 Sobic003G105600--SobicK043500 Sobic005G112066 Sobic005G112066 Sobic003G105600--Sobic005G112066 Sobic001G326000--Sobic002G077500 Sobic001G326000--Sobic007G156300 Sobic001G326000--Sobic005G112066 Sobic001G326000--Sobic009G186400 Sobic001G326000--Sobic003G105600 Sobic001G326000--Sobic006G031600 Sobic001G326000--Sobic004G313800 Sobic001G326000--Sobic005G223200 Sobic002G344900 Sobic002G344900 Sobic001G326000--Sobic002G344900 Sobic006G154300--Sobic009G010150 Sobic006G154300--Sobic002G274900 Sobic006G154300--Sobic007G001600 Sobic006G154300--Sobic004G313800 Sobic006G154300--Sobic003G226000 Sobic006G154300--Sobic003G438700 Sobic005G199300 Sobic005G199300 Sobic006G154300--Sobic005G199300 Sobic006G154300--Sobic009G010000 Sobic006G154300--Sobic009G009900 Sobic007G156300--Sobic006G031600 Sobic007G156300--Sobic001G326000 Sobic007G156300--Sobic005G223200 Sobic007G156300--Sobic004G313800 Sobic007G156300--Sobic003G392500 Sobic007G156300--Sobic005G112066 Sobic007G156300--Sobic002G077500 Sobic007G156300--Sobic010G142300 Sobic007G156300--Sobic009G009900 Sobic009G010150--Sobic006G154300 Sobic009G010150--Sobic002G274900 Sobic009G010150--Sobic007G001600 Sobic009G010150--Sobic003G226000 Sobic009G010150--Sobic005G199300 Sobic009G010150--Sobic009G010000 Sobic009G010150--Sobic004G313800 Sobic007G036600 Sobic007G036600 Sobic009G010150--Sobic007G036600 Sobic009G010150--Sobic003G438700
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.