Gene annotation
Transcriptome id Sobic.007G077766.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5R8L3
Pfam PF01453 PF00069
Panther DB PTHR27002 PTHR27002:SF86
NCBI CDD KOG1187; Serine/threonine protein kinase
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0006468; protein phosphorylation GO:0005524ATP binding GO:0004672protein kinase activity


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G34300 : lectin protein kinase family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os04g23720.1 : lectin protein kinase family protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium PNT62597 , KQJ86471 , KQJ86470
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.009G174200 S-domain receptor-like protein kinase, putative, expressed -
2 Sobic.004G087750 - -
3 Sobic.004G019250 - -
4 Sobic.008G098032 - -
5 Sobic.004G342700 C2 domain containing protein, putative, expressed -
6 Sobic.008G176401 - -
7 Sobic.004G139800 - -
8 Sobic.003G014832 - -
9 Sobic.005G035850 - -
10 Sobic.001G310133 - -
11 Sobic.006G246800 MBTB56 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Meprin and TRAF Homology MATH domain, expressed K10523: speckle-type POZ protein
12 Sobic.004G355101 - -
13 Sobic.006G035950 - -
14 Sobic.002G268450 - -
15 Sobic.009G153333 - -
16 Sobic.003G152050 - -
17 Sobic.002G195066 - -
18 Sobic.005G214900 cytochrome P450, putative, expressed -
19 Sobic.010G238500 - -
20 Sobic.002G226600 - -


Gene co-expression network
sample Sobic007G077766 Sobic007G077766 Sobic009G174200 Sobic009G174200 Sobic007G077766--Sobic009G174200 Sobic004G087750 Sobic004G087750 Sobic007G077766--Sobic004G087750 Sobic004G019250 Sobic004G019250 Sobic007G077766--Sobic004G019250 Sobic008G098032 Sobic008G098032 Sobic007G077766--Sobic008G098032 Sobic004G342700 Sobic004G342700 Sobic007G077766--Sobic004G342700 Sobic008G176401 Sobic008G176401 Sobic007G077766--Sobic008G176401 Sobic004G139800 Sobic004G139800 Sobic007G077766--Sobic004G139800 Sobic003G014832 Sobic003G014832 Sobic007G077766--Sobic003G014832 Sobic005G035850 Sobic005G035850 Sobic007G077766--Sobic005G035850 Sobic009G174200--Sobic004G087750 Sobic009G174200--Sobic004G019250 Sobic009G174200--Sobic008G098032 Sobic009G174200--Sobic008G176401 Sobic009G174200--Sobic004G342700 Sobic009G174200--Sobic004G139800 Sobic009G174200--Sobic003G014832 Sobic009G174200--Sobic005G035850 Sobic001G310133 Sobic001G310133 Sobic009G174200--Sobic001G310133 Sobic004G087750--Sobic009G174200 Sobic004G087750--Sobic004G019250 Sobic004G087750--Sobic008G098032 Sobic004G087750--Sobic008G176401 Sobic004G087750--Sobic004G342700 Sobic004G087750--Sobic004G139800 Sobic004G087750--Sobic003G014832 Sobic004G087750--Sobic005G035850 Sobic004G087750--Sobic001G310133 Sobic004G019250--Sobic004G087750 Sobic004G019250--Sobic009G174200 Sobic004G019250--Sobic008G098032 Sobic004G019250--Sobic004G139800 Sobic004G019250--Sobic008G176401 Sobic004G019250--Sobic004G342700 Sobic004G019250--Sobic005G035850 Sobic004G019250--Sobic001G310133 Sobic004G019250--Sobic003G014832 Sobic008G098032--Sobic004G139800 Sobic008G098032--Sobic004G019250 Sobic008G098032--Sobic004G087750 Sobic008G098032--Sobic009G174200 Sobic008G098032--Sobic005G035850 Sobic008G098032--Sobic001G310133 Sobic008G098032--Sobic008G176401 Sobic005G214900 Sobic005G214900 Sobic008G098032--Sobic005G214900 Sobic008G098032--Sobic004G342700 Sobic004G342700--Sobic008G176401 Sobic006G246800 Sobic006G246800 Sobic004G342700--Sobic006G246800 Sobic004G342700--Sobic009G174200 Sobic004G342700--Sobic004G087750 Sobic004G342700--Sobic003G014832 Sobic004G355101 Sobic004G355101 Sobic004G342700--Sobic004G355101 Sobic006G035950 Sobic006G035950 Sobic004G342700--Sobic006G035950 Sobic004G342700--Sobic004G019250 Sobic002G268450 Sobic002G268450 Sobic004G342700--Sobic002G268450 Sobic008G176401--Sobic004G342700 Sobic008G176401--Sobic009G174200 Sobic008G176401--Sobic004G087750 Sobic008G176401--Sobic003G014832 Sobic008G176401--Sobic006G246800 Sobic008G176401--Sobic002G268450 Sobic008G176401--Sobic004G355101 Sobic008G176401--Sobic006G035950 Sobic008G176401--Sobic004G019250 Sobic004G139800--Sobic008G098032 Sobic004G139800--Sobic005G035850 Sobic004G139800--Sobic004G019250 Sobic004G139800--Sobic001G310133 Sobic004G139800--Sobic004G087750 Sobic004G139800--Sobic009G174200 Sobic004G139800--Sobic005G214900 Sobic003G152050 Sobic003G152050 Sobic004G139800--Sobic003G152050 Sobic003G003900 Sobic003G003900 Sobic004G139800--Sobic003G003900 Sobic003G014832--Sobic004G342700 Sobic003G014832--Sobic008G176401 Sobic003G014832--Sobic006G246800 Sobic003G014832--Sobic004G355101 Sobic003G014832--Sobic009G174200 Sobic003G014832--Sobic004G087750 Sobic003G014832--Sobic006G035950 Sobic003G014832--Sobic002G268450 Sobic003G014832--Sobic004G019250 Sobic005G035850--Sobic004G139800 Sobic005G035850--Sobic001G310133 Sobic005G035850--Sobic008G098032 Sobic005G035850--Sobic005G214900 Sobic005G035850--Sobic003G003900 Sobic005G035850--Sobic004G019250 Sobic002G113066 Sobic002G113066 Sobic005G035850--Sobic002G113066 Sobic005G035850--Sobic004G087750 Sobic005G035850--Sobic009G174200
Octagon: transcription factors


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