Gene annotation
Transcriptome id Sobic.007G086400.1
Synonym XTH22, Sb07g007460, TCH4
Functional annotation glycosyl hydrolases family 16, putative, expressed
UniProt C5YJE7
Pfam PF06955 PF00722
Panther DB PTHR31062 PTHR31062:SF46
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0016762; xyloglucan:xyloglucosyl transferase activity GO:0006073cellular glucan metabolic process GO:0005618cell wall GO:0005975carbohydrate metabolic process GO:0004553hydrolase activity, hydrolyzing O-glycosyl compounds


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G57560 : Xyloglucan endotransglucosylase/hydrolase family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os08g14210.1 : glycosyl hydrolases family 16, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a054967
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.006G113100 heavy metal associated domain containing protein, expressed -
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19 Sobic.001G018700 RD26, putative, expressed -
20 Sobic.001G018700 RD26, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic007G086400 Sobic007G086400 Sobic006G113100 Sobic006G113100 Sobic007G086400--Sobic006G113100 Sobic002G064450 Sobic002G064450 Sobic007G086400--Sobic002G064450 Sobic009G185601 Sobic009G185601 Sobic007G086400--Sobic009G185601 Sobic001G374301 Sobic001G374301 Sobic007G086400--Sobic001G374301 Sobic005G120466 Sobic005G120466 Sobic007G086400--Sobic005G120466 Sobic006G075650 Sobic006G075650 Sobic007G086400--Sobic006G075650 Sobic003G053001 Sobic003G053001 Sobic007G086400--Sobic003G053001 Sobic004G098650 Sobic004G098650 Sobic007G086400--Sobic004G098650 Sobic003G405400 Sobic003G405400 Sobic007G086400--Sobic003G405400 Sobic006G113100--Sobic007G086400 Sobic006G113100--Sobic001G374301 Sobic001G236950 Sobic001G236950 Sobic006G113100--Sobic001G236950 Sobic006G113100--Sobic002G064450 Sobic001G436850 Sobic001G436850 Sobic006G113100--Sobic001G436850 Sobic001G097300 Sobic001G097300 Sobic006G113100--Sobic001G097300 Sobic004G123801 Sobic004G123801 Sobic006G113100--Sobic004G123801 Sobic006G113100--Sobic003G405400 Sobic006G113100--Sobic004G098650 Sobic002G064450--Sobic004G098650 Sobic009G072066 Sobic009G072066 Sobic002G064450--Sobic009G072066 Sobic002G064450--Sobic004G123801 Sobic002G064450--Sobic003G053001 Sobic001G018700 Sobic001G018700 Sobic002G064450--Sobic001G018700 Sobic009G185601--Sobic001G097300 Sobic001G146450 Sobic001G146450 Sobic009G185601--Sobic001G146450 Sobic009G185601--Sobic001G374301 Sobic009G185601--Sobic005G120466 Sobic009G185601--Sobic007G086400 Sobic004G093300 Sobic004G093300 Sobic009G185601--Sobic004G093300 Sobic009G185601--Sobic001G018700 Sobic001G374301--Sobic001G018700 Sobic001G328850 Sobic001G328850 Sobic005G120466--Sobic001G328850 Sobic003G178101 Sobic003G178101 Sobic005G120466--Sobic003G178101 Sobic003G384650 Sobic003G384650 Sobic005G120466--Sobic003G384650 Sobic001G211101 Sobic001G211101 Sobic005G120466--Sobic001G211101 Sobic005G120466--Sobic006G075650 Sobic001G185700 Sobic001G185700 Sobic005G120466--Sobic001G185700 Sobic005G120466--Sobic003G405400 Sobic005G120466--Sobic001G018700 Sobic006G075650--Sobic003G405400 Sobic006G075650--Sobic001G211101 Sobic001G539100 Sobic001G539100 Sobic006G075650--Sobic001G539100 Sobic006G075650--Sobic003G178101 Sobic009G019301 Sobic009G019301 Sobic006G075650--Sobic009G019301 Sobic005G062300 Sobic005G062300 Sobic006G075650--Sobic005G062300 Sobic006G075650--Sobic003G384650 Sobic002G099500 Sobic002G099500 Sobic006G075650--Sobic002G099500 Sobic002G218350 Sobic002G218350 Sobic006G075650--Sobic002G218350 Sobic003G053001--Sobic002G064450 Sobic003G053001--Sobic004G123801 Sobic004G171350 Sobic004G171350 Sobic003G053001--Sobic004G171350 Sobic003G053001--Sobic004G098650 Sobic003G053001--Sobic003G178101 Sobic001G030800 Sobic001G030800 Sobic003G053001--Sobic001G030800 Sobic003G053001--Sobic009G072066 Sobic003G053001--Sobic003G384650 Sobic003G053001--Sobic001G018700 Sobic004G098650--Sobic002G064450 Sobic004G098650--Sobic009G072066 Sobic004G098650--Sobic003G053001 Sobic006G204850 Sobic006G204850 Sobic004G098650--Sobic006G204850 Sobic004G098650--Sobic004G123801 Sobic008G153801 Sobic008G153801 Sobic004G098650--Sobic008G153801 Sobic004G098650--Sobic001G018700 Sobic003G405400--Sobic001G539100 Sobic003G405400--Sobic001G018700
Octagon: transcription factors


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