Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G069100.1
Synonym Sb08g005890
Functional annotation expressed protein
UniProt C5YTF7 , C6JS67
Pfam PF12776
Panther DB PTHR33068 PTHR33068:SF6
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G05800 : -
RAP-DB (Rice) LOC_Os03g21100.1 : transposon protein, putative, CACTA, En/Spm sub-class, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.006G142925 - -
2 Sobic.002G069300 DNA binding protein, putative, expressed -
3 Sobic.010G143666 - -
4 Sobic.009G019400 - -
5 Sobic.009G239400 LTPL29 - Protease inhibitor/seed storage/LTP family protein precursor, expressed -
6 Sobic.007G127900 DUF581 domain containing protein, expressed -
7 Sobic.003G281000 - -
8 Sobic.002G344800 - -
9 Sobic.002G202050 - -
10 Sobic.002G202050 - -
11 Sobic.002G202050 - -
12 Sobic.002G202050 - -
13 Sobic.006G247200 AMP-binding enzyme, putative, expressed -
14 Sobic.002G014100 OsFBX212 - F-box domain containing protein, expressed -
15 Sobic.002G382200 - -
16 Sobic.004G178550 - -
17 Sobic.005G133750 - -
18 Sobic.001G480900 glyoxalase family protein, putative, expressed -
19 Sobic.010G133275 - -
20 Sobic.003G111700 - -


Gene co-expression network
sample Sobic008G069100 Sobic008G069100 Sobic006G142925 Sobic006G142925 Sobic008G069100--Sobic006G142925 Sobic002G069300 Sobic002G069300 Sobic008G069100--Sobic002G069300 Sobic010G143666 Sobic010G143666 Sobic008G069100--Sobic010G143666 Sobic009G019400 Sobic009G019400 Sobic008G069100--Sobic009G019400 Sobic009G239400 Sobic009G239400 Sobic008G069100--Sobic009G239400 Sobic007G127900 Sobic007G127900 Sobic008G069100--Sobic007G127900 Sobic003G281000 Sobic003G281000 Sobic008G069100--Sobic003G281000 Sobic002G344800 Sobic002G344800 Sobic008G069100--Sobic002G344800 Sobic002G202050 Sobic002G202050 Sobic008G069100--Sobic002G202050 Sobic006G142925--Sobic002G069300 Sobic006G142925--Sobic009G239400 Sobic006G142925--Sobic010G143666 Sobic006G142925--Sobic008G069100 Sobic006G142925--Sobic003G281000 Sobic006G142925--Sobic009G019400 Sobic003G165401 Sobic003G165401 Sobic006G142925--Sobic003G165401 Sobic002G014100 Sobic002G014100 Sobic006G142925--Sobic002G014100 Sobic006G142925--Sobic002G202050 Sobic002G069300--Sobic006G142925 Sobic002G069300--Sobic010G143666 Sobic002G069300--Sobic002G014100 Sobic002G069300--Sobic003G281000 Sobic002G069300--Sobic002G202050 Sobic006G247200 Sobic006G247200 Sobic002G069300--Sobic006G247200 Sobic010G143666--Sobic002G202050 Sobic010G143666--Sobic002G014100 Sobic010G143666--Sobic006G247200 Sobic010G143666--Sobic002G069300 Sobic010G143666--Sobic003G281000 Sobic010G143666--Sobic002G344800 Sobic002G114200 Sobic002G114200 Sobic009G019400--Sobic002G114200 Sobic009G019400--Sobic010G143666 Sobic009G019400--Sobic003G281000 Sobic009G019400--Sobic002G069300 Sobic006G049633 Sobic006G049633 Sobic009G019400--Sobic006G049633 Sobic003G229900 Sobic003G229900 Sobic009G019400--Sobic003G229900 Sobic009G019400--Sobic008G069100 Sobic009G019400--Sobic002G202050 Sobic009G239400--Sobic006G142925 Sobic009G239400--Sobic007G127900 Sobic009G239400--Sobic008G069100 Sobic009G239400--Sobic002G069300 Sobic004G020150 Sobic004G020150 Sobic009G239400--Sobic004G020150 Sobic009G239400--Sobic009G019400 Sobic004G102600 Sobic004G102600 Sobic009G239400--Sobic004G102600 Sobic009G239400--Sobic010G143666 Sobic009G239400--Sobic003G165401 Sobic007G127900--Sobic009G239400 Sobic007G127900--Sobic004G102600 Sobic007G127900--Sobic008G069100 Sobic007G127900--Sobic006G142925 Sobic007G127900--Sobic002G069300 Sobic007G127900--Sobic009G019400 Sobic007G127900--Sobic004G020150 Sobic007G127900--Sobic010G143666 Sobic008G140500 Sobic008G140500 Sobic007G127900--Sobic008G140500 Sobic004G296750 Sobic004G296750 Sobic003G281000--Sobic004G296750 Sobic003G281000--Sobic010G143666 Sobic001G480900 Sobic001G480900 Sobic003G281000--Sobic001G480900 Sobic003G281000--Sobic002G014100 Sobic003G281000--Sobic002G202050 Sobic003G281000--Sobic006G247200 Sobic002G344800--Sobic002G202050 Sobic002G344800--Sobic006G247200 Sobic002G344800--Sobic002G014100 Sobic002G344800--Sobic010G143666 Sobic002G382200 Sobic002G382200 Sobic002G344800--Sobic002G382200 Sobic004G178550 Sobic004G178550 Sobic002G344800--Sobic004G178550 Sobic002G202050--Sobic002G202050 Sobic002G202050--Sobic006G247200 Sobic002G202050--Sobic002G344800 Sobic002G202050--Sobic002G014100 Sobic002G202050--Sobic010G143666 Sobic002G202050--Sobic002G382200 Sobic005G133750 Sobic005G133750 Sobic002G202050--Sobic005G133750
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.