Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G154200.1
Synonym SRL2, PIF4, Sb08g020330
Functional annotation helix-loop-helix DNA-binding domain containing protein, expressed
UniProt A0A1B6PDV6
Pfam PF00010
Panther DB PTHR12565 PTHR12565:SF134
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G20180 : phytochrome interacting factor 3-like 5
RAP-DB (Rice) LOC_Os12g40590.1 : helix-loop-helix DNA-binding domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a004582 , Zm00025a004583
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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20 Sobic.009G197350 - -


Gene co-expression network
sample Sobic008G154200 Sobic008G154200 Sobic003G064000 Sobic003G064000 Sobic008G154200--Sobic003G064000 Sobic003G372950 Sobic003G372950 Sobic008G154200--Sobic003G372950 Sobic004G286450 Sobic004G286450 Sobic008G154200--Sobic004G286450 Sobic006G223700 Sobic006G223700 Sobic008G154200--Sobic006G223700 Sobic006G167850 Sobic006G167850 Sobic008G154200--Sobic006G167850 Sobic003G126700 Sobic003G126700 Sobic008G154200--Sobic003G126700 Sobic005G057600 Sobic005G057600 Sobic008G154200--Sobic005G057600 Sobic001G443850 Sobic001G443850 Sobic008G154200--Sobic001G443850 Sobic002G269800 Sobic002G269800 Sobic008G154200--Sobic002G269800 Sobic003G064000--Sobic003G372950 Sobic003G064000--Sobic008G154200 Sobic003G064000--Sobic004G286450 Sobic003G064000--Sobic005G057600 Sobic003G064000--Sobic006G167850 Sobic003G064000--Sobic006G223700 Sobic003G064000--Sobic001G443850 Sobic005G229232 Sobic005G229232 Sobic003G064000--Sobic005G229232 Sobic003G064000--Sobic003G126700 Sobic003G372950--Sobic003G064000 Sobic003G372950--Sobic008G154200 Sobic003G372950--Sobic004G286450 Sobic003G372950--Sobic005G057600 Sobic003G372950--Sobic006G167850 Sobic001G062200 Sobic001G062200 Sobic003G372950--Sobic001G062200 Sobic003G372950--Sobic001G443850 Sobic003G372950--Sobic006G223700 Sobic007G154001 Sobic007G154001 Sobic003G372950--Sobic007G154001 Sobic004G286450--Sobic003G372950 Sobic004G286450--Sobic003G064000 Sobic004G286450--Sobic008G154200 Sobic004G286450--Sobic005G057600 Sobic004G286450--Sobic006G167850 Sobic004G286450--Sobic001G062200 Sobic004G286450--Sobic001G443850 Sobic004G286450--Sobic006G223700 Sobic004G286450--Sobic007G154001 Sobic006G223700--Sobic003G126700 Sobic006G223700--Sobic002G269800 Sobic006G223700--Sobic008G154200 Sobic009G156700 Sobic009G156700 Sobic006G223700--Sobic009G156700 Sobic009G197350 Sobic009G197350 Sobic006G223700--Sobic009G197350 Sobic006G223700--Sobic003G064000 Sobic007G145300 Sobic007G145300 Sobic006G223700--Sobic007G145300 Sobic007G193000 Sobic007G193000 Sobic006G223700--Sobic007G193000 Sobic002G124766 Sobic002G124766 Sobic006G223700--Sobic002G124766 Sobic006G167850--Sobic008G154200 Sobic006G167850--Sobic003G064000 Sobic006G167850--Sobic003G372950 Sobic006G167850--Sobic004G286450 Sobic006G167850--Sobic006G223700 Sobic006G167850--Sobic005G057600 Sobic006G167850--Sobic003G126700 Sobic006G167850--Sobic001G062200 Sobic006G167850--Sobic001G443850 Sobic003G126700--Sobic002G269800 Sobic003G126700--Sobic006G223700 Sobic003G126700--Sobic009G156700 Sobic003G126700--Sobic009G197350 Sobic003G126700--Sobic007G145300 Sobic003G126700--Sobic008G154200 Sobic003G126700--Sobic002G124766 Sobic003G126700--Sobic007G193000 Sobic007G003300 Sobic007G003300 Sobic003G126700--Sobic007G003300 Sobic005G057600--Sobic003G372950 Sobic005G057600--Sobic004G286450 Sobic005G057600--Sobic003G064000 Sobic007G059800 Sobic007G059800 Sobic005G057600--Sobic007G059800 Sobic005G057600--Sobic001G062200 Sobic005G057600--Sobic008G154200 Sobic004G201200 Sobic004G201200 Sobic005G057600--Sobic004G201200 Sobic005G181700 Sobic005G181700 Sobic005G057600--Sobic005G181700 Sobic008G166000 Sobic008G166000 Sobic005G057600--Sobic008G166000 Sobic001G443850--Sobic008G154200 Sobic001G443850--Sobic003G372950 Sobic001G443850--Sobic003G064000 Sobic001G443850--Sobic004G286450 Sobic001G443850--Sobic005G229232 Sobic001G443850--Sobic005G057600 Sobic001G443850--Sobic006G167850 Sobic001G443850--Sobic006G223700 Sobic001G443850--Sobic007G154001 Sobic002G269800--Sobic003G126700 Sobic002G269800--Sobic009G156700 Sobic002G269800--Sobic009G197350 Sobic002G269800--Sobic007G145300 Sobic002G269800--Sobic006G223700 Sobic002G269800--Sobic002G124766 Sobic002G269800--Sobic007G193000 Sobic002G269800--Sobic007G003300 Sobic002G269800--Sobic008G154200
Octagon: transcription factors


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