Gene annotation
Transcriptome id Sobic.009G028700.2
Synonym Sb09g002410
Functional annotation OsFBX115 - F-box domain containing protein, expressed
UniProt A0A1Z5R0R4
Pfam PF00646
Panther DB PTHR32133 PTHR32133:SF119
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0005515; protein binding


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G17490 : F-box and associated interaction domains-containing protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os04g08460.1 : OsFBX115 - F-box domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium PNT77919 , KQK21122 , KQK22956 , KQK22955 , PNT77916 , PNT77917 , PNT77918 , PNT77185 , KQK22926 , KQJ81771
Barley -
Wheat TraesCS4B02G337800
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G152050 - -
2 Sobic.008G098032 - -
3 Sobic.004G139800 - -
4 Sobic.004G087750 - -
5 Sobic.009G174200 S-domain receptor-like protein kinase, putative, expressed -
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9 Sobic.005G123000 gibberellin response modulator protein, putative, expressed -
10 Sobic.001G310133 - -
11 Sobic.004G342700 C2 domain containing protein, putative, expressed -
12 Sobic.008G176401 - -
13 Sobic.003G014832 - -
14 Sobic.009G080233 - -
15 Sobic.008G163750 - -
16 Sobic.006G246800 MBTB56 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Meprin and TRAF Homology MATH domain, expressed K10523: speckle-type POZ protein
17 Sobic.003G003900 - -
18 Sobic.009G153333 - -
19 Sobic.004G355101 - -
20 Sobic.002G268450 - -


Gene co-expression network
sample Sobic009G028700 Sobic009G028700 Sobic003G152050 Sobic003G152050 Sobic009G028700--Sobic003G152050 Sobic008G098032 Sobic008G098032 Sobic009G028700--Sobic008G098032 Sobic004G139800 Sobic004G139800 Sobic009G028700--Sobic004G139800 Sobic004G087750 Sobic004G087750 Sobic009G028700--Sobic004G087750 Sobic009G174200 Sobic009G174200 Sobic009G028700--Sobic009G174200 Sobic004G019250 Sobic004G019250 Sobic009G028700--Sobic004G019250 Sobic005G035850 Sobic005G035850 Sobic009G028700--Sobic005G035850 Sobic005G214900 Sobic005G214900 Sobic009G028700--Sobic005G214900 Sobic005G123000 Sobic005G123000 Sobic009G028700--Sobic005G123000 Sobic003G152050--Sobic005G035850 Sobic003G152050--Sobic004G139800 Sobic003G152050--Sobic008G098032 Sobic001G310133 Sobic001G310133 Sobic003G152050--Sobic001G310133 Sobic003G152050--Sobic005G214900 Sobic003G152050--Sobic004G019250 Sobic003G152050--Sobic004G087750 Sobic003G152050--Sobic009G174200 Sobic003G003900 Sobic003G003900 Sobic003G152050--Sobic003G003900 Sobic008G098032--Sobic004G139800 Sobic008G098032--Sobic004G019250 Sobic008G098032--Sobic004G087750 Sobic008G098032--Sobic009G174200 Sobic008G098032--Sobic005G035850 Sobic008G098032--Sobic001G310133 Sobic008G176401 Sobic008G176401 Sobic008G098032--Sobic008G176401 Sobic008G098032--Sobic005G214900 Sobic004G342700 Sobic004G342700 Sobic008G098032--Sobic004G342700 Sobic004G139800--Sobic008G098032 Sobic004G139800--Sobic005G035850 Sobic004G139800--Sobic004G019250 Sobic004G139800--Sobic001G310133 Sobic004G139800--Sobic004G087750 Sobic004G139800--Sobic009G174200 Sobic004G139800--Sobic005G214900 Sobic004G139800--Sobic003G152050 Sobic004G139800--Sobic003G003900 Sobic004G087750--Sobic009G174200 Sobic004G087750--Sobic004G019250 Sobic004G087750--Sobic008G098032 Sobic004G087750--Sobic008G176401 Sobic004G087750--Sobic004G342700 Sobic004G087750--Sobic004G139800 Sobic003G014832 Sobic003G014832 Sobic004G087750--Sobic003G014832 Sobic004G087750--Sobic005G035850 Sobic004G087750--Sobic001G310133 Sobic009G174200--Sobic004G087750 Sobic009G174200--Sobic004G019250 Sobic009G174200--Sobic008G098032 Sobic009G174200--Sobic008G176401 Sobic009G174200--Sobic004G342700 Sobic009G174200--Sobic004G139800 Sobic009G174200--Sobic003G014832 Sobic009G174200--Sobic005G035850 Sobic009G174200--Sobic001G310133 Sobic004G019250--Sobic004G087750 Sobic004G019250--Sobic009G174200 Sobic004G019250--Sobic008G098032 Sobic004G019250--Sobic004G139800 Sobic004G019250--Sobic008G176401 Sobic004G019250--Sobic004G342700 Sobic004G019250--Sobic005G035850 Sobic004G019250--Sobic001G310133 Sobic004G019250--Sobic003G014832 Sobic005G035850--Sobic004G139800 Sobic005G035850--Sobic001G310133 Sobic005G035850--Sobic008G098032 Sobic005G035850--Sobic005G214900 Sobic005G035850--Sobic003G003900 Sobic005G035850--Sobic004G019250 Sobic002G113066 Sobic002G113066 Sobic005G035850--Sobic002G113066 Sobic005G035850--Sobic004G087750 Sobic005G035850--Sobic009G174200 Sobic005G214900--Sobic005G035850 Sobic005G214900--Sobic003G003900 Sobic005G214900--Sobic002G113066 Sobic005G214900--Sobic001G310133 Sobic005G214900--Sobic004G139800 Sobic003G077001 Sobic003G077001 Sobic005G214900--Sobic003G077001 Sobic005G214900--Sobic008G098032 Sobic008G163750 Sobic008G163750 Sobic005G214900--Sobic008G163750 Sobic005G214900--Sobic003G152050 Sobic005G123000--Sobic009G028700 Sobic005G123000--Sobic005G214900 Sobic009G080233 Sobic009G080233 Sobic005G123000--Sobic009G080233 Sobic005G123000--Sobic003G152050 Sobic005G123000--Sobic004G139800 Sobic005G123000--Sobic008G098032 Sobic005G123000--Sobic005G035850 Sobic005G123000--Sobic004G087750 Sobic005G123000--Sobic009G174200
Octagon: transcription factors


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