Gene annotation
Transcriptome id Sobic.010G222000.2
Synonym BPM1, ATBPM1, Sb10g026730
Functional annotation BTB/POZ domain containing protein, expressed
UniProt A0A1W0VUB5
Pfam PF00651
Panther DB PTHR26379 PTHR26379:SF176
NCBI CDD -
KEGG Orthology K10523; speckle-type POZ protein
Gene Ontology GO:0005515; protein binding


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G19000 : BTB-POZ and MATH domain 1
RAP-DB (Rice) LOC_Os06g45720.1 : BTB/POZ domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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13 Sobic.001G413400 matrix attachment region binding protein, putative, expressed -
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18 Sobic.001G101650 - -
19 Sobic.001G074500 - -
20 Sobic.005G057500 Leucine Rich Repeat family protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic010G222000 Sobic010G222000 Sobic007G003300 Sobic007G003300 Sobic010G222000--Sobic007G003300 Sobic006G037050 Sobic006G037050 Sobic010G222000--Sobic006G037050 Sobic005G080075 Sobic005G080075 Sobic010G222000--Sobic005G080075 Sobic001G100650 Sobic001G100650 Sobic010G222000--Sobic001G100650 Sobic010G064050 Sobic010G064050 Sobic010G222000--Sobic010G064050 Sobic003G008400 Sobic003G008400 Sobic010G222000--Sobic003G008400 Sobic002G082350 Sobic002G082350 Sobic010G222000--Sobic002G082350 Sobic003G254400 Sobic003G254400 Sobic010G222000--Sobic003G254400 Sobic008G191800 Sobic008G191800 Sobic010G222000--Sobic008G191800 Sobic007G145300 Sobic007G145300 Sobic007G003300--Sobic007G145300 Sobic009G197350 Sobic009G197350 Sobic007G003300--Sobic009G197350 Sobic009G156700 Sobic009G156700 Sobic007G003300--Sobic009G156700 Sobic002G269800 Sobic002G269800 Sobic007G003300--Sobic002G269800 Sobic002G124766 Sobic002G124766 Sobic007G003300--Sobic002G124766 Sobic003G126700 Sobic003G126700 Sobic007G003300--Sobic003G126700 Sobic007G003300--Sobic002G082350 Sobic006G223700 Sobic006G223700 Sobic007G003300--Sobic006G223700 Sobic007G193000 Sobic007G193000 Sobic007G003300--Sobic007G193000 Sobic002G142550 Sobic002G142550 Sobic006G037050--Sobic002G142550 Sobic010G236950 Sobic010G236950 Sobic006G037050--Sobic010G236950 Sobic005G107250 Sobic005G107250 Sobic006G037050--Sobic005G107250 Sobic010G165925 Sobic010G165925 Sobic006G037050--Sobic010G165925 Sobic001G369701 Sobic001G369701 Sobic006G037050--Sobic001G369701 Sobic007G003250 Sobic007G003250 Sobic006G037050--Sobic007G003250 Sobic010G116200 Sobic010G116200 Sobic006G037050--Sobic010G116200 Sobic003G025500 Sobic003G025500 Sobic006G037050--Sobic003G025500 Sobic010G180300 Sobic010G180300 Sobic006G037050--Sobic010G180300 Sobic005G080075--Sobic001G100650 Sobic005G080075--Sobic010G064050 Sobic005G080075--Sobic003G008400 Sobic005G080075--Sobic002G082350 Sobic005G080075--Sobic003G254400 Sobic009G073200 Sobic009G073200 Sobic005G080075--Sobic009G073200 Sobic003G318600 Sobic003G318600 Sobic005G080075--Sobic003G318600 Sobic003G360500 Sobic003G360500 Sobic005G080075--Sobic003G360500 Sobic001G413400 Sobic001G413400 Sobic005G080075--Sobic001G413400 Sobic001G100650--Sobic001G100650 Sobic001G100650--Sobic005G080075 Sobic001G100650--Sobic002G082350 Sobic001G100650--Sobic003G008400 Sobic001G100650--Sobic003G254400 Sobic001G100650--Sobic009G073200 Sobic001G100650--Sobic003G318600 Sobic001G100650--Sobic003G360500 Sobic002G313850 Sobic002G313850 Sobic001G100650--Sobic002G313850 Sobic010G064050--Sobic001G100650 Sobic010G064050--Sobic005G080075 Sobic010G064050--Sobic002G082350 Sobic010G064050--Sobic003G008400 Sobic010G064050--Sobic003G254400 Sobic010G064050--Sobic009G073200 Sobic010G064050--Sobic003G318600 Sobic010G064050--Sobic003G360500 Sobic010G064050--Sobic002G313850 Sobic003G008400--Sobic005G080075 Sobic003G008400--Sobic003G254400 Sobic003G008400--Sobic001G100650 Sobic003G008400--Sobic010G064050 Sobic003G008400--Sobic003G318600 Sobic003G008400--Sobic002G082350 Sobic003G008400--Sobic003G360500 Sobic003G008400--Sobic009G073200 Sobic003G008400--Sobic001G413400 Sobic002G082350--Sobic010G064050 Sobic002G082350--Sobic001G100650 Sobic002G082350--Sobic005G080075 Sobic002G082350--Sobic003G008400 Sobic002G082350--Sobic009G073200 Sobic002G082350--Sobic003G254400 Sobic002G082350--Sobic008G191800 Sobic002G082350--Sobic002G313850 Sobic002G082350--Sobic007G145300 Sobic003G254400--Sobic003G008400 Sobic003G254400--Sobic005G080075 Sobic003G254400--Sobic001G100650 Sobic003G254400--Sobic010G064050 Sobic003G254400--Sobic003G318600 Sobic003G254400--Sobic002G082350 Sobic003G254400--Sobic003G360500 Sobic003G254400--Sobic009G073200 Sobic003G254400--Sobic001G413400 Sobic008G191800--Sobic002G082350 Sobic008G191800--Sobic010G064050 Sobic008G191800--Sobic001G100650 Sobic008G191800--Sobic005G080075 Sobic008G191800--Sobic003G008400 Sobic008G191800--Sobic009G073200 Sobic008G191800--Sobic003G360500 Sobic008G191800--Sobic003G254400 Sobic008G191800--Sobic003G318600
Octagon: transcription factors


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