Gene annotation
Transcriptome id Sobic.010G237400.1
Synonym Sb10g027880
Functional annotation ZmEBE-1 protein, putative, expressed
UniProt C5Z8B6
Pfam PF03080
Panther DB PTHR31589 PTHR31589:SF8
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT4G17505 : Protein of Unknown Function (DUF239)
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g61800.1 : ZmEBE-1 protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G369800 - -
2 Sobic.009G059800 lysine-rich arabinogalactan protein 19 precursor, putative, expressed -
3 Sobic.009G059932 - -
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5 Sobic.009G059866 - -
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7 Sobic.004G056500 - -
8 Sobic.010G144600 - -
9 Sobic.003G175300 expressed protein -
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12 Sobic.002G023500 expressed protein -
13 Sobic.007G035900 expressed protein -
14 Sobic.009G019550 - -
15 Sobic.007G014300 DEF6 - Defensin and Defensin-like DEFL family, expressed -
16 Sobic.004G316000 DEFL74 - Defensin and Defensin-like DEFL family, expressed -
17 Sobic.006G239600 - -
18 Sobic.001G123650 - -
19 Sobic.001G123650 - -
20 Sobic.001G123650 - -


Gene co-expression network
sample Sobic010G237400 Sobic010G237400 Sobic003G369800 Sobic003G369800 Sobic010G237400--Sobic003G369800 Sobic009G059800 Sobic009G059800 Sobic010G237400--Sobic009G059800 Sobic009G059932 Sobic009G059932 Sobic010G237400--Sobic009G059932 Sobic002G102800 Sobic002G102800 Sobic010G237400--Sobic002G102800 Sobic009G059866 Sobic009G059866 Sobic010G237400--Sobic009G059866 Sobic007G218400 Sobic007G218400 Sobic010G237400--Sobic007G218400 Sobic004G056500 Sobic004G056500 Sobic010G237400--Sobic004G056500 Sobic010G144600 Sobic010G144600 Sobic010G237400--Sobic010G144600 Sobic003G175300 Sobic003G175300 Sobic010G237400--Sobic003G175300 Sobic003G369800--Sobic010G237400 Sobic003G369800--Sobic003G175300 Sobic003G369800--Sobic009G059800 Sobic003G369800--Sobic002G102800 Sobic003G369800--Sobic009G059932 Sobic003G369800--Sobic004G056500 Sobic003G369800--Sobic010G144600 Sobic003G369800--Sobic009G059866 Sobic003G369800--Sobic007G218400 Sobic009G059800--Sobic009G059932 Sobic009G059800--Sobic010G237400 Sobic009G059800--Sobic009G059866 Sobic009G059800--Sobic007G218400 Sobic009G059800--Sobic002G102800 Sobic009G059800--Sobic004G056500 Sobic009G059800--Sobic003G369800 Sobic009G059800--Sobic010G144600 Sobic004G254300 Sobic004G254300 Sobic009G059800--Sobic004G254300 Sobic009G059932--Sobic009G059866 Sobic009G059932--Sobic002G102800 Sobic009G059932--Sobic004G056500 Sobic009G059932--Sobic009G059800 Sobic009G059932--Sobic007G218400 Sobic009G059932--Sobic010G237400 Sobic009G059932--Sobic010G144600 Sobic009G059932--Sobic003G369800 Sobic009G059932--Sobic004G254300 Sobic002G102800--Sobic004G056500 Sobic002G102800--Sobic009G059932 Sobic002G102800--Sobic009G059866 Sobic002G102800--Sobic010G144600 Sobic002G102800--Sobic009G059800 Sobic002G102800--Sobic007G218400 Sobic002G102800--Sobic010G237400 Sobic003G175700 Sobic003G175700 Sobic002G102800--Sobic003G175700 Sobic007G014300 Sobic007G014300 Sobic002G102800--Sobic007G014300 Sobic009G059866--Sobic009G059932 Sobic009G059866--Sobic002G102800 Sobic009G059866--Sobic004G056500 Sobic009G059866--Sobic007G218400 Sobic009G059866--Sobic009G059800 Sobic009G059866--Sobic010G144600 Sobic009G059866--Sobic010G237400 Sobic009G059866--Sobic003G369800 Sobic009G059866--Sobic003G175700 Sobic007G218400--Sobic009G059932 Sobic007G218400--Sobic009G059866 Sobic007G218400--Sobic009G059800 Sobic007G218400--Sobic002G102800 Sobic007G218400--Sobic004G056500 Sobic007G218400--Sobic010G237400 Sobic007G218400--Sobic010G144600 Sobic007G218400--Sobic003G369800 Sobic007G218400--Sobic004G254300 Sobic004G056500--Sobic002G102800 Sobic004G056500--Sobic009G059932 Sobic004G056500--Sobic009G059866 Sobic004G056500--Sobic010G144600 Sobic004G056500--Sobic009G059800 Sobic002G023500 Sobic002G023500 Sobic004G056500--Sobic002G023500 Sobic004G056500--Sobic007G218400 Sobic004G056500--Sobic003G175700 Sobic004G056500--Sobic010G237400 Sobic010G144600--Sobic003G175700 Sobic010G144600--Sobic007G014300 Sobic010G144600--Sobic002G102800 Sobic010G144600--Sobic004G056500 Sobic006G239600 Sobic006G239600 Sobic010G144600--Sobic006G239600 Sobic001G123650 Sobic001G123650 Sobic010G144600--Sobic001G123650 Sobic007G035900 Sobic007G035900 Sobic003G175300--Sobic007G035900 Sobic003G175300--Sobic003G175700 Sobic003G175300--Sobic010G144600 Sobic003G175300--Sobic003G369800 Sobic003G175300--Sobic006G239600 Sobic003G175300--Sobic002G023500 Sobic003G175300--Sobic007G014300 Sobic003G175300--Sobic001G123650
Octagon: transcription factors


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