Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G001066.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5S439
Pfam PF00098
Panther DB PTHR23002 PTHR23002:SF63
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0008270; zinc ion binding GO:0003676nucleic acid binding


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G55340 : phragmoplastin interacting protein 1
RAP-DB (Rice) LOC_Os04g45890.1 : retrotransposon protein, putative, unclassified, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G242300 ZOS1-19 - C2H2 zinc finger protein, expressed -
2 Sobic.009G244450 - -
3 Sobic.003G386350 - -
4 Sobic.001G137050 - -
5 Sobic.003G440100 EF hand family protein, expressed -
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7 Sobic.002G223050 - -
8 Sobic.001G250800 ulp1 protease family, C-terminal catalytic domain containing protein, expressed -
9 Sobic.003G318350 - -
10 Sobic.007G145300 zinc knuckle family protein, expressed -
11 Sobic.009G197350 - -
12 Sobic.009G156700 protein transport protein, putative, expressed -
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14 Sobic.010G046200 NBS-LRR type disease resistance protein, putative, expressed -
15 Sobic.007G003300 - -
16 Sobic.001G205600 expressed protein -
17 Sobic.003G126700 NB-ARC domain containing protein, expressed -
18 Sobic.003G331550 - -
19 Sobic.002G124766 - -
20 Sobic.002G082350 - -


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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