Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G020350.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5S3Z4
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) Zm00025a008960
Brachypodium -
Barley HORVU1Hr1G070720.5 , HORVU1Hr1G070720.4 , HORVU1Hr1G070720.6 , HORVU1Hr1G070720.1 , HORVU1Hr1G070720.3 , HORVU1Hr1G070720.2
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G232300 "domain confirmed by Pfam database, expression not supported"(PubMedID : 20499123)@OsSAUR15 - Auxin-responsive SAUR gene family member -
2 Sobic.005G119250 - -
3 Sobic.008G122250 - -
4 Sobic.002G190600 - -
5 Sobic.008G007500 HIT zinc finger domain containing protein, expressed -
6 Sobic.010G018200 expressed protein -
7 Sobic.009G147450 - -
8 Sobic.005G065050 - -
9 Sobic.008G029000 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@WRKY40, expressed -
10 Sobic.001G423666 - -
11 Sobic.010G124400 - -
12 Sobic.003G081200 expressed protein -
13 Sobic.005G187800 - -
14 Sobic.003G003300 expressed protein -
15 Sobic.004G230000 expressed protein -
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18 Sobic.004G230000 expressed protein -
19 Sobic.004G230000 expressed protein -
20 Sobic.004G230000 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic001G020350 Sobic001G020350 Sobic002G232300 Sobic002G232300 Sobic001G020350--Sobic002G232300 Sobic005G119250 Sobic005G119250 Sobic001G020350--Sobic005G119250 Sobic008G122250 Sobic008G122250 Sobic001G020350--Sobic008G122250 Sobic002G190600 Sobic002G190600 Sobic001G020350--Sobic002G190600 Sobic008G007500 Sobic008G007500 Sobic001G020350--Sobic008G007500 Sobic010G018200 Sobic010G018200 Sobic001G020350--Sobic010G018200 Sobic009G147450 Sobic009G147450 Sobic001G020350--Sobic009G147450 Sobic005G065050 Sobic005G065050 Sobic001G020350--Sobic005G065050 Sobic008G029000 Sobic008G029000 Sobic001G020350--Sobic008G029000 Sobic004G351000 Sobic004G351000 Sobic002G232300--Sobic004G351000 Sobic004G230000 Sobic004G230000 Sobic002G232300--Sobic004G230000 Sobic005G119250--Sobic002G190600 Sobic003G192500 Sobic003G192500 Sobic005G119250--Sobic003G192500 Sobic006G202900 Sobic006G202900 Sobic005G119250--Sobic006G202900 Sobic005G119250--Sobic008G122250 Sobic005G119250--Sobic005G065050 Sobic010G193100 Sobic010G193100 Sobic005G119250--Sobic010G193100 Sobic005G119250--Sobic001G020350 Sobic010G124400 Sobic010G124400 Sobic005G119250--Sobic010G124400 Sobic005G119250--Sobic008G029000 Sobic008G122250--Sobic010G124400 Sobic008G122250--Sobic005G119250 Sobic008G122250--Sobic001G020350 Sobic008G122250--Sobic002G190600 Sobic008G122250--Sobic005G065050 Sobic001G505066 Sobic001G505066 Sobic008G122250--Sobic001G505066 Sobic008G122250--Sobic009G147450 Sobic007G202360 Sobic007G202360 Sobic008G122250--Sobic007G202360 Sobic008G122250--Sobic010G018200 Sobic002G190600--Sobic003G192500 Sobic002G190600--Sobic005G065050 Sobic002G190600--Sobic001G505066 Sobic002G190600--Sobic005G119250 Sobic002G190600--Sobic007G202360 Sobic002G190600--Sobic006G202900 Sobic002G190600--Sobic008G007500 Sobic002G190600--Sobic010G193100 Sobic001G423666 Sobic001G423666 Sobic002G190600--Sobic001G423666 Sobic005G187800 Sobic005G187800 Sobic008G007500--Sobic005G187800 Sobic008G007500--Sobic008G029000 Sobic004G091900 Sobic004G091900 Sobic008G007500--Sobic004G091900 Sobic008G007500--Sobic006G202900 Sobic008G007500--Sobic002G190600 Sobic008G007500--Sobic010G018200 Sobic008G007500--Sobic010G193100 Sobic003G003300 Sobic003G003300 Sobic008G007500--Sobic003G003300 Sobic002G087700 Sobic002G087700 Sobic008G007500--Sobic002G087700 Sobic010G018200--Sobic008G029000 Sobic010G018200--Sobic005G065050 Sobic010G018200--Sobic009G147450 Sobic010G018200--Sobic003G003300 Sobic004G024350 Sobic004G024350 Sobic010G018200--Sobic004G024350 Sobic010G018200--Sobic004G230000 Sobic009G147450--Sobic005G065050 Sobic003G081200 Sobic003G081200 Sobic009G147450--Sobic003G081200 Sobic009G147450--Sobic010G018200 Sobic009G147450--Sobic004G024350 Sobic009G147450--Sobic001G423666 Sobic009G147450--Sobic004G230000 Sobic005G065050--Sobic009G147450 Sobic005G065050--Sobic010G018200 Sobic005G065050--Sobic002G190600 Sobic005G065050--Sobic001G505066 Sobic005G065050--Sobic001G423666 Sobic005G065050--Sobic007G202360 Sobic005G065050--Sobic004G024350 Sobic005G065050--Sobic006G202900 Sobic005G065050--Sobic008G029000 Sobic008G029000--Sobic010G018200 Sobic008G029000--Sobic003G003300 Sobic008G029000--Sobic006G202900 Sobic008G029000--Sobic005G187800 Sobic008G029000--Sobic008G007500 Sobic001G259850 Sobic001G259850 Sobic008G029000--Sobic001G259850 Sobic008G029000--Sobic004G351000 Sobic008G029000--Sobic010G193100 Sobic005G199151 Sobic005G199151 Sobic008G029000--Sobic005G199151
Octagon: transcription factors


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