Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G196950.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5S6F7
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G426750 - -
2 Sobic.007G002400 - -
3 Sobic.008G153801 - -
4 Sobic.006G204850 - -
5 Sobic.009G185601 - -
6 Sobic.009G062150 - -
7 Sobic.001G097300 CHCH domain containing protein, expressed -
8 Sobic.005G017632 - -
9 Sobic.002G400050 - -
10 Sobic.004G093300 interferon-related developmental regulator family protein, putative, expressed -
11 Sobic.001G146450 - -
12 Sobic.001G374301 - -
13 Sobic.001G436850 - -
14 Sobic.004G098650 - -
15 Sobic.001G154800 ubiquitin, putative, expressed -
16 Sobic.010G140300 - -
17 Sobic.008G082450 - -
18 Sobic.006G089200 expressed protein -
19 Sobic.005G120466 - -
20 Sobic.001G018700 RD26, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic001G196950 Sobic001G196950 Sobic003G426750 Sobic003G426750 Sobic001G196950--Sobic003G426750 Sobic007G002400 Sobic007G002400 Sobic001G196950--Sobic007G002400 Sobic008G153801 Sobic008G153801 Sobic001G196950--Sobic008G153801 Sobic006G204850 Sobic006G204850 Sobic001G196950--Sobic006G204850 Sobic009G185601 Sobic009G185601 Sobic001G196950--Sobic009G185601 Sobic009G062150 Sobic009G062150 Sobic001G196950--Sobic009G062150 Sobic001G097300 Sobic001G097300 Sobic001G196950--Sobic001G097300 Sobic005G017632 Sobic005G017632 Sobic001G196950--Sobic005G017632 Sobic002G400050 Sobic002G400050 Sobic001G196950--Sobic002G400050 Sobic003G426750--Sobic008G153801 Sobic003G426750--Sobic006G204850 Sobic003G426750--Sobic009G062150 Sobic003G426750--Sobic005G017632 Sobic003G426750--Sobic002G400050 Sobic003G426750--Sobic001G196950 Sobic004G098650 Sobic004G098650 Sobic003G426750--Sobic004G098650 Sobic001G018700 Sobic001G018700 Sobic003G426750--Sobic001G018700 Sobic007G002400--Sobic001G196950 Sobic004G093300 Sobic004G093300 Sobic007G002400--Sobic004G093300 Sobic007G002400--Sobic009G185601 Sobic007G002400--Sobic001G097300 Sobic007G086400 Sobic007G086400 Sobic007G002400--Sobic007G086400 Sobic006G175100 Sobic006G175100 Sobic007G002400--Sobic006G175100 Sobic003G437900 Sobic003G437900 Sobic007G002400--Sobic003G437900 Sobic008G122200 Sobic008G122200 Sobic007G002400--Sobic008G122200 Sobic005G120466 Sobic005G120466 Sobic007G002400--Sobic005G120466 Sobic008G153801--Sobic006G204850 Sobic008G153801--Sobic003G426750 Sobic008G153801--Sobic005G017632 Sobic008G153801--Sobic009G062150 Sobic008G153801--Sobic001G018700 Sobic006G204850--Sobic008G153801 Sobic006G204850--Sobic005G017632 Sobic006G204850--Sobic001G018700 Sobic009G185601--Sobic001G097300 Sobic001G146450 Sobic001G146450 Sobic009G185601--Sobic001G146450 Sobic001G374301 Sobic001G374301 Sobic009G185601--Sobic001G374301 Sobic009G185601--Sobic005G120466 Sobic009G185601--Sobic007G086400 Sobic009G185601--Sobic004G093300 Sobic009G185601--Sobic001G018700 Sobic009G062150--Sobic008G153801 Sobic009G062150--Sobic006G204850 Sobic009G062150--Sobic003G426750 Sobic009G067700 Sobic009G067700 Sobic009G062150--Sobic009G067700 Sobic009G062150--Sobic005G017632 Sobic009G062150--Sobic001G018700 Sobic001G097300--Sobic009G185601 Sobic001G183900 Sobic001G183900 Sobic001G097300--Sobic001G183900 Sobic003G072100 Sobic003G072100 Sobic001G097300--Sobic003G072100 Sobic001G097300--Sobic001G146450 Sobic004G246950 Sobic004G246950 Sobic001G097300--Sobic004G246950 Sobic001G436850 Sobic001G436850 Sobic001G097300--Sobic001G436850 Sobic006G089200 Sobic006G089200 Sobic001G097300--Sobic006G089200 Sobic003G094850 Sobic003G094850 Sobic001G097300--Sobic003G094850 Sobic001G097300--Sobic001G018700 Sobic005G017632--Sobic001G018700 Sobic002G034900 Sobic002G034900 Sobic002G400050--Sobic002G034900 Sobic003G095750 Sobic003G095750 Sobic002G400050--Sobic003G095750 Sobic009G196500 Sobic009G196500 Sobic002G400050--Sobic009G196500 Sobic003G075632 Sobic003G075632 Sobic002G400050--Sobic003G075632 Sobic002G400050--Sobic008G153801 Sobic002G400050--Sobic006G204850 Sobic009G037400 Sobic009G037400 Sobic002G400050--Sobic009G037400 Sobic002G400050--Sobic003G426750 Sobic002G400050--Sobic005G017632
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.