Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G154800.1
Synonym Sb01g013450
Functional annotation ubiquitin, putative, expressed
UniProt A0A1B6QJ44
Pfam PF03145
Panther DB PTHR10315 PTHR10315:SF43
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0007275; multicellular organism development GO:0006511ubiquitin-dependent protein catabolic process GO:0005634nucleus


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G37870 : Protein with RING/U-box and TRAF-like domains
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g03410.1 : ubiquitin, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G426750 - -
2 Sobic.008G153801 - -
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18 Sobic.010G197632 - -
19 Sobic.001G018700 RD26, putative, expressed -
20 Sobic.001G018700 RD26, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic001G154800 Sobic001G154800 Sobic003G426750 Sobic003G426750 Sobic001G154800--Sobic003G426750 Sobic008G153801 Sobic008G153801 Sobic001G154800--Sobic008G153801 Sobic002G069700 Sobic002G069700 Sobic001G154800--Sobic002G069700 Sobic003G358500 Sobic003G358500 Sobic001G154800--Sobic003G358500 Sobic006G204850 Sobic006G204850 Sobic001G154800--Sobic006G204850 Sobic010G101350 Sobic010G101350 Sobic001G154800--Sobic010G101350 Sobic009G110300 Sobic009G110300 Sobic001G154800--Sobic009G110300 Sobic009G062150 Sobic009G062150 Sobic001G154800--Sobic009G062150 Sobic007G023650 Sobic007G023650 Sobic001G154800--Sobic007G023650 Sobic003G426750--Sobic008G153801 Sobic003G426750--Sobic006G204850 Sobic003G426750--Sobic009G062150 Sobic005G017632 Sobic005G017632 Sobic003G426750--Sobic005G017632 Sobic002G400050 Sobic002G400050 Sobic003G426750--Sobic002G400050 Sobic001G196950 Sobic001G196950 Sobic003G426750--Sobic001G196950 Sobic004G098650 Sobic004G098650 Sobic003G426750--Sobic004G098650 Sobic001G018700 Sobic001G018700 Sobic003G426750--Sobic001G018700 Sobic008G153801--Sobic006G204850 Sobic008G153801--Sobic003G426750 Sobic008G153801--Sobic005G017632 Sobic008G153801--Sobic009G062150 Sobic008G153801--Sobic001G018700 Sobic002G069700--Sobic010G101350 Sobic002G069700--Sobic009G110300 Sobic002G069700--Sobic003G358500 Sobic001G218300 Sobic001G218300 Sobic002G069700--Sobic001G218300 Sobic002G069700--Sobic007G023650 Sobic009G196500 Sobic009G196500 Sobic002G069700--Sobic009G196500 Sobic004G177050 Sobic004G177050 Sobic002G069700--Sobic004G177050 Sobic010G197632 Sobic010G197632 Sobic002G069700--Sobic010G197632 Sobic005G193900 Sobic005G193900 Sobic002G069700--Sobic005G193900 Sobic003G358500--Sobic007G023650 Sobic003G358500--Sobic002G069700 Sobic003G358500--Sobic005G193900 Sobic003G358500--Sobic009G110300 Sobic003G358500--Sobic009G196500 Sobic010G140300 Sobic010G140300 Sobic003G358500--Sobic010G140300 Sobic008G082450 Sobic008G082450 Sobic003G358500--Sobic008G082450 Sobic003G358500--Sobic001G218300 Sobic001G040900 Sobic001G040900 Sobic003G358500--Sobic001G040900 Sobic006G204850--Sobic008G153801 Sobic006G204850--Sobic005G017632 Sobic006G204850--Sobic001G018700 Sobic010G101350--Sobic002G069700 Sobic010G101350--Sobic009G110300 Sobic010G101350--Sobic003G358500 Sobic010G101350--Sobic004G177050 Sobic010G101350--Sobic001G218300 Sobic010G101350--Sobic007G023650 Sobic010G101350--Sobic010G197632 Sobic010G101350--Sobic001G154800 Sobic010G101350--Sobic009G196500 Sobic009G110300--Sobic002G069700 Sobic009G110300--Sobic007G023650 Sobic001G236950 Sobic001G236950 Sobic009G110300--Sobic001G236950 Sobic009G110300--Sobic003G358500 Sobic009G110300--Sobic005G193900 Sobic009G110300--Sobic009G196500 Sobic009G110300--Sobic001G218300 Sobic009G110300--Sobic001G018700 Sobic009G062150--Sobic008G153801 Sobic009G062150--Sobic006G204850 Sobic009G062150--Sobic003G426750 Sobic009G067700 Sobic009G067700 Sobic009G062150--Sobic009G067700 Sobic009G062150--Sobic005G017632 Sobic009G062150--Sobic001G018700 Sobic007G023650--Sobic005G193900 Sobic007G023650--Sobic010G140300 Sobic007G023650--Sobic008G082450 Sobic007G023650--Sobic001G040900 Sobic010G090550 Sobic010G090550 Sobic007G023650--Sobic010G090550 Sobic007G023650--Sobic001G018700
Octagon: transcription factors


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