Gene annotation
Transcriptome id Sobic.006G022800.1
Synonym SAG12
Functional annotation vignain precursor, putative, expressed
UniProt A0A1Z5RBV9
Pfam PF08246 PF00112
Panther DB PTHR12411 PTHR12411:SF348
NCBI CDD KOG1543; Cysteine proteinase Cathepsin L
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0008234; cysteine-type peptidase activity GO:0006508proteolysis


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G45890 : senescence-associated gene 12
RAP-DB (Rice) LOC_Os04g13090.1 : vignain precursor, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G154800 ubiquitin, putative, expressed -
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19 Sobic.003G197700 OsFBX12 - F-box domain containing protein, expressed -
20 Sobic.006G204850 - -


Gene co-expression network
sample Sobic006G022800 Sobic006G022800 Sobic001G154800 Sobic001G154800 Sobic006G022800--Sobic001G154800 Sobic003G358500 Sobic003G358500 Sobic006G022800--Sobic003G358500 Sobic002G069700 Sobic002G069700 Sobic006G022800--Sobic002G069700 Sobic010G101350 Sobic010G101350 Sobic006G022800--Sobic010G101350 Sobic009G062150 Sobic009G062150 Sobic006G022800--Sobic009G062150 Sobic009G067700 Sobic009G067700 Sobic006G022800--Sobic009G067700 Sobic002G291850 Sobic002G291850 Sobic006G022800--Sobic002G291850 Sobic001G218300 Sobic001G218300 Sobic006G022800--Sobic001G218300 Sobic002G304200 Sobic002G304200 Sobic006G022800--Sobic002G304200 Sobic003G426750 Sobic003G426750 Sobic001G154800--Sobic003G426750 Sobic008G153801 Sobic008G153801 Sobic001G154800--Sobic008G153801 Sobic001G154800--Sobic002G069700 Sobic001G154800--Sobic003G358500 Sobic006G204850 Sobic006G204850 Sobic001G154800--Sobic006G204850 Sobic001G154800--Sobic010G101350 Sobic009G110300 Sobic009G110300 Sobic001G154800--Sobic009G110300 Sobic001G154800--Sobic009G062150 Sobic007G023650 Sobic007G023650 Sobic001G154800--Sobic007G023650 Sobic003G358500--Sobic007G023650 Sobic003G358500--Sobic002G069700 Sobic005G193900 Sobic005G193900 Sobic003G358500--Sobic005G193900 Sobic003G358500--Sobic009G110300 Sobic009G196500 Sobic009G196500 Sobic003G358500--Sobic009G196500 Sobic010G140300 Sobic010G140300 Sobic003G358500--Sobic010G140300 Sobic008G082450 Sobic008G082450 Sobic003G358500--Sobic008G082450 Sobic003G358500--Sobic001G218300 Sobic001G040900 Sobic001G040900 Sobic003G358500--Sobic001G040900 Sobic002G069700--Sobic010G101350 Sobic002G069700--Sobic009G110300 Sobic002G069700--Sobic003G358500 Sobic002G069700--Sobic001G218300 Sobic002G069700--Sobic007G023650 Sobic002G069700--Sobic009G196500 Sobic004G177050 Sobic004G177050 Sobic002G069700--Sobic004G177050 Sobic010G197632 Sobic010G197632 Sobic002G069700--Sobic010G197632 Sobic002G069700--Sobic005G193900 Sobic010G101350--Sobic002G069700 Sobic010G101350--Sobic009G110300 Sobic010G101350--Sobic003G358500 Sobic010G101350--Sobic004G177050 Sobic010G101350--Sobic001G218300 Sobic010G101350--Sobic007G023650 Sobic010G101350--Sobic010G197632 Sobic010G101350--Sobic001G154800 Sobic010G101350--Sobic009G196500 Sobic009G062150--Sobic008G153801 Sobic009G062150--Sobic006G204850 Sobic009G062150--Sobic003G426750 Sobic009G062150--Sobic009G067700 Sobic005G017632 Sobic005G017632 Sobic009G062150--Sobic005G017632 Sobic001G018700 Sobic001G018700 Sobic009G062150--Sobic001G018700 Sobic008G106550 Sobic008G106550 Sobic009G067700--Sobic008G106550 Sobic009G067700--Sobic001G018700 Sobic002G291850--Sobic009G067700 Sobic002G291850--Sobic008G106550 Sobic009G128901 Sobic009G128901 Sobic002G291850--Sobic009G128901 Sobic004G204700 Sobic004G204700 Sobic002G291850--Sobic004G204700 Sobic002G291850--Sobic001G018700 Sobic005G062300 Sobic005G062300 Sobic001G218300--Sobic005G062300 Sobic001G211101 Sobic001G211101 Sobic001G218300--Sobic001G211101 Sobic001G218300--Sobic007G023650 Sobic003G178101 Sobic003G178101 Sobic001G218300--Sobic003G178101 Sobic006G075650 Sobic006G075650 Sobic001G218300--Sobic006G075650 Sobic001G218300--Sobic005G193900 Sobic001G218300--Sobic002G069700 Sobic001G218300--Sobic009G110300 Sobic001G218300--Sobic009G196500 Sobic002G304200--Sobic008G106550 Sobic007G078400 Sobic007G078400 Sobic002G304200--Sobic007G078400 Sobic002G218350 Sobic002G218350 Sobic002G304200--Sobic002G218350 Sobic010G158300 Sobic010G158300 Sobic002G304200--Sobic010G158300 Sobic006G190950 Sobic006G190950 Sobic002G304200--Sobic006G190950 Sobic002G304200--Sobic009G067700 Sobic002G026600 Sobic002G026600 Sobic002G304200--Sobic002G026600 Sobic001G338200 Sobic001G338200 Sobic002G304200--Sobic001G338200 Sobic010G090550 Sobic010G090550 Sobic002G304200--Sobic010G090550
Octagon: transcription factors


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