Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G029350.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1W0VVM5
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.006G022800 vignain precursor, putative, expressed -
2 Sobic.010G174550 - -
3 Sobic.001G185100 expressed protein -
4 Sobic.010G203800 cytochrome P450, putative, expressed -
5 Sobic.008G043000 tentative name(PubMedID : 31536532)@histone-like transcription factor and archaeal histone, putative, expressed K08066: NFYC, nuclear transcription factor Y, gamma
6 Sobic.010G101350 - -
7 Sobic.009G225250 - -
8 Sobic.003G430700 heavy-metal-associated domain-containing protein, putative, expressed -
9 Sobic.003G255000 no apical meristem protein, putative, expressed -
10 Sobic.002G250700 DC1 domain-containing protein, putative, expressed -
11 Sobic.001G154800 ubiquitin, putative, expressed -
12 Sobic.002G069700 expressed protein -
13 Sobic.003G358500 - -
14 Sobic.005G002350 - -
15 Sobic.009G080500 - -
16 Sobic.004G204700 OsFBX230 - F-box domain containing protein, expressed -
17 Sobic.002G391501 - K00430: peroxidase
18 Sobic.002G357500 - -
19 Sobic.004G177050 - -
20 Sobic.008G172900 RGH1A, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic003G029350 Sobic003G029350 Sobic006G022800 Sobic006G022800 Sobic003G029350--Sobic006G022800 Sobic010G174550 Sobic010G174550 Sobic003G029350--Sobic010G174550 Sobic001G185100 Sobic001G185100 Sobic003G029350--Sobic001G185100 Sobic010G203800 Sobic010G203800 Sobic003G029350--Sobic010G203800 Sobic008G043000 Sobic008G043000 Sobic003G029350--Sobic008G043000 Sobic010G101350 Sobic010G101350 Sobic003G029350--Sobic010G101350 Sobic009G225250 Sobic009G225250 Sobic003G029350--Sobic009G225250 Sobic003G430700 Sobic003G430700 Sobic003G029350--Sobic003G430700 Sobic003G255000 Sobic003G255000 Sobic003G029350--Sobic003G255000 Sobic001G154800 Sobic001G154800 Sobic006G022800--Sobic001G154800 Sobic003G358500 Sobic003G358500 Sobic006G022800--Sobic003G358500 Sobic002G069700 Sobic002G069700 Sobic006G022800--Sobic002G069700 Sobic006G022800--Sobic010G101350 Sobic009G062150 Sobic009G062150 Sobic006G022800--Sobic009G062150 Sobic009G067700 Sobic009G067700 Sobic006G022800--Sobic009G067700 Sobic002G291850 Sobic002G291850 Sobic006G022800--Sobic002G291850 Sobic001G218300 Sobic001G218300 Sobic006G022800--Sobic001G218300 Sobic002G304200 Sobic002G304200 Sobic006G022800--Sobic002G304200 Sobic010G174550--Sobic008G043000 Sobic010G174550--Sobic003G255000 Sobic010G174550--Sobic009G225250 Sobic002G250700 Sobic002G250700 Sobic010G174550--Sobic002G250700 Sobic010G174550--Sobic006G022800 Sobic004G204700 Sobic004G204700 Sobic010G174550--Sobic004G204700 Sobic010G174550--Sobic003G029350 Sobic009G080500 Sobic009G080500 Sobic010G174550--Sobic009G080500 Sobic002G392550 Sobic002G392550 Sobic010G174550--Sobic002G392550 Sobic004G196600 Sobic004G196600 Sobic001G185100--Sobic004G196600 Sobic005G116250 Sobic005G116250 Sobic001G185100--Sobic005G116250 Sobic002G028000 Sobic002G028000 Sobic001G185100--Sobic002G028000 Sobic001G396050 Sobic001G396050 Sobic001G185100--Sobic001G396050 Sobic008G043800 Sobic008G043800 Sobic001G185100--Sobic008G043800 Sobic005G088600 Sobic005G088600 Sobic001G185100--Sobic005G088600 Sobic010G133100 Sobic010G133100 Sobic001G185100--Sobic010G133100 Sobic001G185100--Sobic003G029350 Sobic001G185100--Sobic003G255000 Sobic002G391501 Sobic002G391501 Sobic010G203800--Sobic002G391501 Sobic010G203800--Sobic010G101350 Sobic001G026950 Sobic001G026950 Sobic010G203800--Sobic001G026950 Sobic010G203800--Sobic002G069700 Sobic008G141501 Sobic008G141501 Sobic010G203800--Sobic008G141501 Sobic004G177050 Sobic004G177050 Sobic010G203800--Sobic004G177050 Sobic007G195201 Sobic007G195201 Sobic010G203800--Sobic007G195201 Sobic010G203800--Sobic001G154800 Sobic009G110300 Sobic009G110300 Sobic010G203800--Sobic009G110300 Sobic008G043000--Sobic009G225250 Sobic008G043000--Sobic002G250700 Sobic008G043000--Sobic004G204700 Sobic008G043000--Sobic003G255000 Sobic005G002350 Sobic005G002350 Sobic008G043000--Sobic005G002350 Sobic008G172900 Sobic008G172900 Sobic008G043000--Sobic008G172900 Sobic002G064100 Sobic002G064100 Sobic008G043000--Sobic002G064100 Sobic008G043000--Sobic009G080500 Sobic008G043000--Sobic002G291850 Sobic010G101350--Sobic002G069700 Sobic010G101350--Sobic009G110300 Sobic010G101350--Sobic003G358500 Sobic010G101350--Sobic004G177050 Sobic010G101350--Sobic001G218300 Sobic007G023650 Sobic007G023650 Sobic010G101350--Sobic007G023650 Sobic010G197632 Sobic010G197632 Sobic010G101350--Sobic010G197632 Sobic010G101350--Sobic001G154800 Sobic009G196500 Sobic009G196500 Sobic010G101350--Sobic009G196500 Sobic009G225250--Sobic008G043000 Sobic009G225250--Sobic002G250700 Sobic009G225250--Sobic004G204700 Sobic009G225250--Sobic003G255000 Sobic009G225250--Sobic002G064100 Sobic009G225250--Sobic008G172900 Sobic009G225250--Sobic009G067700 Sobic009G225250--Sobic002G291850 Sobic009G225250--Sobic005G002350 Sobic003G430700--Sobic004G177050 Sobic003G430700--Sobic002G069700 Sobic003G430700--Sobic010G101350 Sobic003G430700--Sobic003G358500 Sobic003G430700--Sobic009G196500 Sobic001G110150 Sobic001G110150 Sobic003G430700--Sobic001G110150 Sobic001G321300 Sobic001G321300 Sobic003G430700--Sobic001G321300 Sobic003G430700--Sobic001G154800 Sobic003G430700--Sobic009G110300 Sobic003G255000--Sobic008G043000 Sobic003G255000--Sobic009G225250 Sobic003G255000--Sobic002G250700 Sobic003G255000--Sobic002G392550 Sobic003G255000--Sobic005G002350 Sobic003G255000--Sobic004G204700 Sobic003G255000--Sobic008G172900 Sobic003G255000--Sobic009G080500 Sobic003G063801 Sobic003G063801 Sobic003G255000--Sobic003G063801
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.