Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G255000.1
Synonym ATNAM, NAM, Sb03g031000, NARS2, ANAC018
Functional annotation no apical meristem protein, putative, expressed
UniProt C5XGN1
Pfam PF02365
Panther DB PTHR31989 PTHR31989:SF52
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0006355; regulation of transcription, DNA-templated GO:0003677DNA binding


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G15510 : NAC domain containing protein 2
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g48446.1 : no apical meristem protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a038823
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.008G043000 tentative name(PubMedID : 31536532)@histone-like transcription factor and archaeal histone, putative, expressed K08066: NFYC, nuclear transcription factor Y, gamma
2 Sobic.009G225250 - -
3 Sobic.002G250700 DC1 domain-containing protein, putative, expressed -
4 Sobic.002G392550 - -
5 Sobic.005G002350 - -
6 Sobic.004G204700 OsFBX230 - F-box domain containing protein, expressed -
7 Sobic.008G172900 RGH1A, putative, expressed -
8 Sobic.009G080500 - -
9 Sobic.003G063801 - -
10 Sobic.002G064100 DNA-binding storekeeper protein-related, putative, expressed -
11 Sobic.005G181900 MBTB37 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Meprin and TRAF Homology MATH domain, expressed K10523: speckle-type POZ protein
12 Sobic.002G291850 - -
13 Sobic.010G174550 - -
14 Sobic.010G133100 expressed protein K14638: SLC15A3_4, solute carrier family 15 (peptide/histidine transporter), member 3/4
15 Sobic.009G067700 ZOS1-19 - C2H2 zinc finger protein, expressed -
16 Sobic.005G116250 - -
17 Sobic.002G369100 expressed protein -
18 Sobic.005G045400 - -
19 Sobic.006G022800 vignain precursor, putative, expressed -
20 Sobic.006G142365 - -


Gene co-expression network
sample Sobic003G255000 Sobic003G255000 Sobic008G043000 Sobic008G043000 Sobic003G255000--Sobic008G043000 Sobic009G225250 Sobic009G225250 Sobic003G255000--Sobic009G225250 Sobic002G250700 Sobic002G250700 Sobic003G255000--Sobic002G250700 Sobic002G392550 Sobic002G392550 Sobic003G255000--Sobic002G392550 Sobic005G002350 Sobic005G002350 Sobic003G255000--Sobic005G002350 Sobic004G204700 Sobic004G204700 Sobic003G255000--Sobic004G204700 Sobic008G172900 Sobic008G172900 Sobic003G255000--Sobic008G172900 Sobic009G080500 Sobic009G080500 Sobic003G255000--Sobic009G080500 Sobic003G063801 Sobic003G063801 Sobic003G255000--Sobic003G063801 Sobic008G043000--Sobic009G225250 Sobic008G043000--Sobic002G250700 Sobic008G043000--Sobic004G204700 Sobic008G043000--Sobic003G255000 Sobic008G043000--Sobic005G002350 Sobic008G043000--Sobic008G172900 Sobic002G064100 Sobic002G064100 Sobic008G043000--Sobic002G064100 Sobic008G043000--Sobic009G080500 Sobic002G291850 Sobic002G291850 Sobic008G043000--Sobic002G291850 Sobic009G225250--Sobic008G043000 Sobic009G225250--Sobic002G250700 Sobic009G225250--Sobic004G204700 Sobic009G225250--Sobic003G255000 Sobic009G225250--Sobic002G064100 Sobic009G225250--Sobic008G172900 Sobic009G067700 Sobic009G067700 Sobic009G225250--Sobic009G067700 Sobic009G225250--Sobic002G291850 Sobic009G225250--Sobic005G002350 Sobic002G250700--Sobic009G225250 Sobic002G250700--Sobic008G043000 Sobic002G250700--Sobic004G204700 Sobic002G250700--Sobic003G255000 Sobic002G250700--Sobic002G064100 Sobic002G250700--Sobic009G067700 Sobic002G250700--Sobic002G291850 Sobic002G250700--Sobic008G172900 Sobic002G250700--Sobic005G002350 Sobic002G392550--Sobic003G255000 Sobic002G392550--Sobic003G063801 Sobic002G392550--Sobic008G043000 Sobic002G392550--Sobic005G002350 Sobic002G392550--Sobic009G225250 Sobic002G392550--Sobic002G250700 Sobic002G392550--Sobic002G064100 Sobic010G133100 Sobic010G133100 Sobic002G392550--Sobic010G133100 Sobic002G392550--Sobic004G204700 Sobic005G002350--Sobic008G043000 Sobic005G002350--Sobic009G225250 Sobic005G002350--Sobic003G255000 Sobic005G002350--Sobic002G250700 Sobic005G002350--Sobic009G080500 Sobic005G002350--Sobic002G392550 Sobic005G002350--Sobic004G204700 Sobic005G002350--Sobic008G172900 Sobic002G369100 Sobic002G369100 Sobic005G002350--Sobic002G369100 Sobic004G204700--Sobic009G225250 Sobic004G204700--Sobic009G067700 Sobic004G204700--Sobic002G291850 Sobic004G204700--Sobic002G250700 Sobic004G204700--Sobic008G043000 Sobic009G062150 Sobic009G062150 Sobic004G204700--Sobic009G062150 Sobic010G142132 Sobic010G142132 Sobic004G204700--Sobic010G142132 Sobic001G183900 Sobic001G183900 Sobic004G204700--Sobic001G183900 Sobic009G128901 Sobic009G128901 Sobic004G204700--Sobic009G128901 Sobic008G172900--Sobic009G225250 Sobic008G172900--Sobic008G043000 Sobic008G172900--Sobic002G250700 Sobic008G172900--Sobic004G204700 Sobic008G172900--Sobic002G064100 Sobic008G172900--Sobic003G255000 Sobic008G172900--Sobic009G067700 Sobic008G172900--Sobic009G080500 Sobic008G172900--Sobic002G291850 Sobic009G080500--Sobic009G225250 Sobic009G080500--Sobic008G043000 Sobic009G080500--Sobic002G250700 Sobic009G080500--Sobic004G204700 Sobic009G080500--Sobic005G002350 Sobic009G080500--Sobic009G062150 Sobic009G080500--Sobic003G255000 Sobic009G080500--Sobic009G067700 Sobic009G080500--Sobic008G172900 Sobic003G063801--Sobic002G064100 Sobic003G063801--Sobic010G142132 Sobic003G063801--Sobic009G225250 Sobic002G146701 Sobic002G146701 Sobic003G063801--Sobic002G146701 Sobic003G063801--Sobic008G043000 Sobic003G063801--Sobic002G250700 Sobic003G063801--Sobic010G133100 Sobic003G063801--Sobic004G204700 Sobic003G063801--Sobic002G392550
Octagon: transcription factors


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