Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G172900.2,Sobic.008G172900.1
Synonym
Functional annotation RGH1A, putative, expressed
UniProt A0A1B6PEB5 , A0A1Z5R7C0
Pfam PF00931
Panther DB PTHR23155 PTHR23155:SF484
NCBI CDD KOG4658; Apoptotic ATPase
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G46530 : NB-ARC domain-containing disease resistance protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os11g43700.1 : RGH1A, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium KQJ86321 , KQJ86320
Barley HORVU6Hr1G028220.2 , HORVU6Hr1G028220.3 , HORVU6Hr1G028220.1 , HORVU6Hr1G028220.6 , HORVU6Hr1G028220.7 , HORVU6Hr1G028220.4 , HORVU6Hr1G028220.5
Wheat TraesCS7D02G542300
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.009G225250 - -
2 Sobic.008G043000 tentative name(PubMedID : 31536532)@histone-like transcription factor and archaeal histone, putative, expressed K08066: NFYC, nuclear transcription factor Y, gamma
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10 Sobic.005G002350 - -
11 Sobic.009G062150 - -
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14 Sobic.004G099650 - -
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20 Sobic.003G066200 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic008G172900 Sobic008G172900 Sobic009G225250 Sobic009G225250 Sobic008G172900--Sobic009G225250 Sobic008G043000 Sobic008G043000 Sobic008G172900--Sobic008G043000 Sobic002G250700 Sobic002G250700 Sobic008G172900--Sobic002G250700 Sobic004G204700 Sobic004G204700 Sobic008G172900--Sobic004G204700 Sobic002G064100 Sobic002G064100 Sobic008G172900--Sobic002G064100 Sobic003G255000 Sobic003G255000 Sobic008G172900--Sobic003G255000 Sobic009G067700 Sobic009G067700 Sobic008G172900--Sobic009G067700 Sobic009G080500 Sobic009G080500 Sobic008G172900--Sobic009G080500 Sobic002G291850 Sobic002G291850 Sobic008G172900--Sobic002G291850 Sobic009G225250--Sobic008G043000 Sobic009G225250--Sobic002G250700 Sobic009G225250--Sobic004G204700 Sobic009G225250--Sobic003G255000 Sobic009G225250--Sobic002G064100 Sobic009G225250--Sobic008G172900 Sobic009G225250--Sobic009G067700 Sobic009G225250--Sobic002G291850 Sobic005G002350 Sobic005G002350 Sobic009G225250--Sobic005G002350 Sobic008G043000--Sobic009G225250 Sobic008G043000--Sobic002G250700 Sobic008G043000--Sobic004G204700 Sobic008G043000--Sobic003G255000 Sobic008G043000--Sobic005G002350 Sobic008G043000--Sobic008G172900 Sobic008G043000--Sobic002G064100 Sobic008G043000--Sobic009G080500 Sobic008G043000--Sobic002G291850 Sobic002G250700--Sobic009G225250 Sobic002G250700--Sobic008G043000 Sobic002G250700--Sobic004G204700 Sobic002G250700--Sobic003G255000 Sobic002G250700--Sobic002G064100 Sobic002G250700--Sobic009G067700 Sobic002G250700--Sobic002G291850 Sobic002G250700--Sobic008G172900 Sobic002G250700--Sobic005G002350 Sobic004G204700--Sobic009G225250 Sobic004G204700--Sobic009G067700 Sobic004G204700--Sobic002G291850 Sobic004G204700--Sobic002G250700 Sobic004G204700--Sobic008G043000 Sobic009G062150 Sobic009G062150 Sobic004G204700--Sobic009G062150 Sobic010G142132 Sobic010G142132 Sobic004G204700--Sobic010G142132 Sobic001G183900 Sobic001G183900 Sobic004G204700--Sobic001G183900 Sobic009G128901 Sobic009G128901 Sobic004G204700--Sobic009G128901 Sobic002G064100--Sobic010G142132 Sobic002G064100--Sobic004G204700 Sobic002G064100--Sobic009G225250 Sobic002G064100--Sobic009G067700 Sobic002G064100--Sobic002G250700 Sobic002G064100--Sobic008G043000 Sobic002G064100--Sobic009G128901 Sobic002G064100--Sobic002G291850 Sobic006G176300 Sobic006G176300 Sobic002G064100--Sobic006G176300 Sobic003G255000--Sobic008G043000 Sobic003G255000--Sobic009G225250 Sobic003G255000--Sobic002G250700 Sobic002G392550 Sobic002G392550 Sobic003G255000--Sobic002G392550 Sobic003G255000--Sobic005G002350 Sobic003G255000--Sobic004G204700 Sobic003G255000--Sobic008G172900 Sobic003G255000--Sobic009G080500 Sobic003G063801 Sobic003G063801 Sobic003G255000--Sobic003G063801 Sobic008G106550 Sobic008G106550 Sobic009G067700--Sobic008G106550 Sobic001G018700 Sobic001G018700 Sobic009G067700--Sobic001G018700 Sobic009G080500--Sobic009G225250 Sobic009G080500--Sobic008G043000 Sobic009G080500--Sobic002G250700 Sobic009G080500--Sobic004G204700 Sobic009G080500--Sobic005G002350 Sobic009G080500--Sobic009G062150 Sobic009G080500--Sobic003G255000 Sobic009G080500--Sobic009G067700 Sobic009G080500--Sobic008G172900 Sobic002G291850--Sobic009G067700 Sobic002G291850--Sobic008G106550 Sobic002G291850--Sobic009G128901 Sobic002G291850--Sobic004G204700 Sobic002G291850--Sobic001G018700
Octagon: transcription factors


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