Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G181900.1
Synonym BPM1, ATBPM1
Functional annotation MBTB37 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Meprin and TRAF Homology MATH domain, expressed
UniProt A0A1Z5RJ67
Pfam PF00917
Panther DB PTHR26379 PTHR26379:SF144
NCBI CDD KOG1987; Speckle-type POZ protein SPOP and related proteins with TRAF, MATH and BTB/POZ domains
KEGG Orthology K10523; speckle-type POZ protein
Gene Ontology GO:0005515; protein binding


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G19000 : BTB-POZ and MATH domain 1
RAP-DB (Rice) LOC_Os11g40680.1 : MBTB64 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Meprin and TRAF Homology MATH domain, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.005G181900


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.008G043000 tentative name(PubMedID : 31536532)@histone-like transcription factor and archaeal histone, putative, expressed K08066: NFYC, nuclear transcription factor Y, gamma
2 Sobic.009G225250 - -
3 Sobic.002G250700 DC1 domain-containing protein, putative, expressed -
4 Sobic.004G204700 OsFBX230 - F-box domain containing protein, expressed -
5 Sobic.006G142365 - -
6 Sobic.002G291850 - -
7 Sobic.003G255000 no apical meristem protein, putative, expressed -
8 Sobic.002G385000 expressed protein -
9 Sobic.008G172900 RGH1A, putative, expressed -
10 Sobic.005G002350 - -
11 Sobic.002G064100 DNA-binding storekeeper protein-related, putative, expressed -
12 Sobic.002G369100 expressed protein -
13 Sobic.001G457966 - -
14 Sobic.009G080500 - -
15 Sobic.009G128901 - -
16 Sobic.009G067700 ZOS1-19 - C2H2 zinc finger protein, expressed -
17 Sobic.009G062150 - -
18 Sobic.010G229050 - -
19 Sobic.010G142132 - -
20 Sobic.002G151900 - -


Gene co-expression network
sample Sobic005G181900 Sobic005G181900 Sobic008G043000 Sobic008G043000 Sobic005G181900--Sobic008G043000 Sobic009G225250 Sobic009G225250 Sobic005G181900--Sobic009G225250 Sobic002G250700 Sobic002G250700 Sobic005G181900--Sobic002G250700 Sobic004G204700 Sobic004G204700 Sobic005G181900--Sobic004G204700 Sobic006G142365 Sobic006G142365 Sobic005G181900--Sobic006G142365 Sobic002G291850 Sobic002G291850 Sobic005G181900--Sobic002G291850 Sobic003G255000 Sobic003G255000 Sobic005G181900--Sobic003G255000 Sobic002G385000 Sobic002G385000 Sobic005G181900--Sobic002G385000 Sobic008G172900 Sobic008G172900 Sobic005G181900--Sobic008G172900 Sobic008G043000--Sobic009G225250 Sobic008G043000--Sobic002G250700 Sobic008G043000--Sobic004G204700 Sobic008G043000--Sobic003G255000 Sobic005G002350 Sobic005G002350 Sobic008G043000--Sobic005G002350 Sobic008G043000--Sobic008G172900 Sobic002G064100 Sobic002G064100 Sobic008G043000--Sobic002G064100 Sobic009G080500 Sobic009G080500 Sobic008G043000--Sobic009G080500 Sobic008G043000--Sobic002G291850 Sobic009G225250--Sobic008G043000 Sobic009G225250--Sobic002G250700 Sobic009G225250--Sobic004G204700 Sobic009G225250--Sobic003G255000 Sobic009G225250--Sobic002G064100 Sobic009G225250--Sobic008G172900 Sobic009G067700 Sobic009G067700 Sobic009G225250--Sobic009G067700 Sobic009G225250--Sobic002G291850 Sobic009G225250--Sobic005G002350 Sobic002G250700--Sobic009G225250 Sobic002G250700--Sobic008G043000 Sobic002G250700--Sobic004G204700 Sobic002G250700--Sobic003G255000 Sobic002G250700--Sobic002G064100 Sobic002G250700--Sobic009G067700 Sobic002G250700--Sobic002G291850 Sobic002G250700--Sobic008G172900 Sobic002G250700--Sobic005G002350 Sobic004G204700--Sobic009G225250 Sobic004G204700--Sobic009G067700 Sobic004G204700--Sobic002G291850 Sobic004G204700--Sobic002G250700 Sobic004G204700--Sobic008G043000 Sobic009G062150 Sobic009G062150 Sobic004G204700--Sobic009G062150 Sobic010G142132 Sobic010G142132 Sobic004G204700--Sobic010G142132 Sobic001G183900 Sobic001G183900 Sobic004G204700--Sobic001G183900 Sobic009G128901 Sobic009G128901 Sobic004G204700--Sobic009G128901 Sobic006G142365--Sobic002G291850 Sobic006G142365--Sobic010G142132 Sobic006G142365--Sobic002G064100 Sobic002G044200 Sobic002G044200 Sobic006G142365--Sobic002G044200 Sobic006G142365--Sobic009G128901 Sobic006G142365--Sobic004G204700 Sobic006G142365--Sobic009G225250 Sobic005G067000 Sobic005G067000 Sobic006G142365--Sobic005G067000 Sobic006G142365--Sobic009G067700 Sobic002G291850--Sobic009G067700 Sobic008G106550 Sobic008G106550 Sobic002G291850--Sobic008G106550 Sobic002G291850--Sobic009G128901 Sobic002G291850--Sobic004G204700 Sobic001G018700 Sobic001G018700 Sobic002G291850--Sobic001G018700 Sobic003G255000--Sobic008G043000 Sobic003G255000--Sobic009G225250 Sobic003G255000--Sobic002G250700 Sobic002G392550 Sobic002G392550 Sobic003G255000--Sobic002G392550 Sobic003G255000--Sobic005G002350 Sobic003G255000--Sobic004G204700 Sobic003G255000--Sobic008G172900 Sobic003G255000--Sobic009G080500 Sobic003G063801 Sobic003G063801 Sobic003G255000--Sobic003G063801 Sobic002G385000--Sobic005G181900 Sobic002G067400 Sobic002G067400 Sobic002G385000--Sobic002G067400 Sobic002G385000--Sobic002G250700 Sobic002G385000--Sobic004G204700 Sobic002G385000--Sobic008G043000 Sobic002G385000--Sobic009G225250 Sobic002G385000--Sobic002G291850 Sobic002G385000--Sobic006G142365 Sobic002G385000--Sobic002G064100 Sobic008G172900--Sobic009G225250 Sobic008G172900--Sobic008G043000 Sobic008G172900--Sobic002G250700 Sobic008G172900--Sobic004G204700 Sobic008G172900--Sobic002G064100 Sobic008G172900--Sobic003G255000 Sobic008G172900--Sobic009G067700 Sobic008G172900--Sobic009G080500 Sobic008G172900--Sobic002G291850
Octagon: transcription factors


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