Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G250700.1
Synonym Sb02g028650
Functional annotation DC1 domain-containing protein, putative, expressed
UniProt A0A1W0W5M2
Pfam PF03107
Panther DB PTHR13871 PTHR13871:SF43
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G20990 : Cysteine/Histidine-rich C1 domain family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os09g31980.1 : DC1 domain-containing protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a014230
Brachypodium KQJ90790 , PNT64849
Barley HORVU5Hr1G073980.1 , HORVU5Hr1G073980.2 , HORVU5Hr1G073980.3
Wheat TraesCS5A02G269600 , TraesCS5B02G270100 , TraesCS5D02G277700
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.009G225250 - -
2 Sobic.008G043000 tentative name(PubMedID : 31536532)@histone-like transcription factor and archaeal histone, putative, expressed K08066: NFYC, nuclear transcription factor Y, gamma
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6 Sobic.009G067700 ZOS1-19 - C2H2 zinc finger protein, expressed -
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10 Sobic.009G062150 - -
11 Sobic.009G080500 - -
12 Sobic.002G369100 expressed protein -
13 Sobic.010G142132 - -
14 Sobic.009G128901 - -
15 Sobic.003G063801 - -
16 Sobic.005G181900 MBTB37 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Meprin and TRAF Homology MATH domain, expressed K10523: speckle-type POZ protein
17 Sobic.006G142365 - -
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19 Sobic.001G018700 RD26, putative, expressed -
20 Sobic.001G018700 RD26, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic002G250700 Sobic002G250700 Sobic009G225250 Sobic009G225250 Sobic002G250700--Sobic009G225250 Sobic008G043000 Sobic008G043000 Sobic002G250700--Sobic008G043000 Sobic004G204700 Sobic004G204700 Sobic002G250700--Sobic004G204700 Sobic003G255000 Sobic003G255000 Sobic002G250700--Sobic003G255000 Sobic002G064100 Sobic002G064100 Sobic002G250700--Sobic002G064100 Sobic009G067700 Sobic009G067700 Sobic002G250700--Sobic009G067700 Sobic002G291850 Sobic002G291850 Sobic002G250700--Sobic002G291850 Sobic008G172900 Sobic008G172900 Sobic002G250700--Sobic008G172900 Sobic005G002350 Sobic005G002350 Sobic002G250700--Sobic005G002350 Sobic009G225250--Sobic008G043000 Sobic009G225250--Sobic002G250700 Sobic009G225250--Sobic004G204700 Sobic009G225250--Sobic003G255000 Sobic009G225250--Sobic002G064100 Sobic009G225250--Sobic008G172900 Sobic009G225250--Sobic009G067700 Sobic009G225250--Sobic002G291850 Sobic009G225250--Sobic005G002350 Sobic008G043000--Sobic009G225250 Sobic008G043000--Sobic002G250700 Sobic008G043000--Sobic004G204700 Sobic008G043000--Sobic003G255000 Sobic008G043000--Sobic005G002350 Sobic008G043000--Sobic008G172900 Sobic008G043000--Sobic002G064100 Sobic009G080500 Sobic009G080500 Sobic008G043000--Sobic009G080500 Sobic008G043000--Sobic002G291850 Sobic004G204700--Sobic009G225250 Sobic004G204700--Sobic009G067700 Sobic004G204700--Sobic002G291850 Sobic004G204700--Sobic002G250700 Sobic004G204700--Sobic008G043000 Sobic009G062150 Sobic009G062150 Sobic004G204700--Sobic009G062150 Sobic010G142132 Sobic010G142132 Sobic004G204700--Sobic010G142132 Sobic001G183900 Sobic001G183900 Sobic004G204700--Sobic001G183900 Sobic009G128901 Sobic009G128901 Sobic004G204700--Sobic009G128901 Sobic003G255000--Sobic008G043000 Sobic003G255000--Sobic009G225250 Sobic003G255000--Sobic002G250700 Sobic002G392550 Sobic002G392550 Sobic003G255000--Sobic002G392550 Sobic003G255000--Sobic005G002350 Sobic003G255000--Sobic004G204700 Sobic003G255000--Sobic008G172900 Sobic003G255000--Sobic009G080500 Sobic003G063801 Sobic003G063801 Sobic003G255000--Sobic003G063801 Sobic002G064100--Sobic010G142132 Sobic002G064100--Sobic004G204700 Sobic002G064100--Sobic009G225250 Sobic002G064100--Sobic009G067700 Sobic002G064100--Sobic002G250700 Sobic002G064100--Sobic008G043000 Sobic002G064100--Sobic009G128901 Sobic002G064100--Sobic002G291850 Sobic006G176300 Sobic006G176300 Sobic002G064100--Sobic006G176300 Sobic008G106550 Sobic008G106550 Sobic009G067700--Sobic008G106550 Sobic001G018700 Sobic001G018700 Sobic009G067700--Sobic001G018700 Sobic002G291850--Sobic009G067700 Sobic002G291850--Sobic008G106550 Sobic002G291850--Sobic009G128901 Sobic002G291850--Sobic004G204700 Sobic002G291850--Sobic001G018700 Sobic008G172900--Sobic009G225250 Sobic008G172900--Sobic008G043000 Sobic008G172900--Sobic002G250700 Sobic008G172900--Sobic004G204700 Sobic008G172900--Sobic002G064100 Sobic008G172900--Sobic003G255000 Sobic008G172900--Sobic009G067700 Sobic008G172900--Sobic009G080500 Sobic008G172900--Sobic002G291850 Sobic005G002350--Sobic008G043000 Sobic005G002350--Sobic009G225250 Sobic005G002350--Sobic003G255000 Sobic005G002350--Sobic002G250700 Sobic005G002350--Sobic009G080500 Sobic005G002350--Sobic002G392550 Sobic005G002350--Sobic004G204700 Sobic005G002350--Sobic008G172900 Sobic002G369100 Sobic002G369100 Sobic005G002350--Sobic002G369100
Octagon: transcription factors


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