Gene annotation
Transcriptome id Sobic.009G080500.2
Synonym Sb09g006920
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5R2H1
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os05g12440.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.009G225250 - -
2 Sobic.008G043000 tentative name(PubMedID : 31536532)@histone-like transcription factor and archaeal histone, putative, expressed K08066: NFYC, nuclear transcription factor Y, gamma
3 Sobic.002G250700 DC1 domain-containing protein, putative, expressed -
4 Sobic.004G204700 OsFBX230 - F-box domain containing protein, expressed -
5 Sobic.005G002350 - -
6 Sobic.009G062150 - -
7 Sobic.003G255000 no apical meristem protein, putative, expressed -
8 Sobic.009G067700 ZOS1-19 - C2H2 zinc finger protein, expressed -
9 Sobic.008G172900 RGH1A, putative, expressed -
10 Sobic.002G064100 DNA-binding storekeeper protein-related, putative, expressed -
11 Sobic.002G291850 - -
12 Sobic.010G142132 - -
13 Sobic.002G369100 expressed protein -
14 Sobic.002G099500 expressed protein -
15 Sobic.006G204850 - -
16 Sobic.003G262000 plant-specific domain TIGR01568 family protein, expressed -
17 Sobic.008G153801 - -
18 Sobic.003G178101 - K09490: HSPA5, endoplasmic reticulum chaperone BiP
19 Sobic.003G384650 - -
20 Sobic.001G107150 - -


Gene co-expression network
sample Sobic009G080500 Sobic009G080500 Sobic009G225250 Sobic009G225250 Sobic009G080500--Sobic009G225250 Sobic008G043000 Sobic008G043000 Sobic009G080500--Sobic008G043000 Sobic002G250700 Sobic002G250700 Sobic009G080500--Sobic002G250700 Sobic004G204700 Sobic004G204700 Sobic009G080500--Sobic004G204700 Sobic005G002350 Sobic005G002350 Sobic009G080500--Sobic005G002350 Sobic009G062150 Sobic009G062150 Sobic009G080500--Sobic009G062150 Sobic003G255000 Sobic003G255000 Sobic009G080500--Sobic003G255000 Sobic009G067700 Sobic009G067700 Sobic009G080500--Sobic009G067700 Sobic008G172900 Sobic008G172900 Sobic009G080500--Sobic008G172900 Sobic009G225250--Sobic008G043000 Sobic009G225250--Sobic002G250700 Sobic009G225250--Sobic004G204700 Sobic009G225250--Sobic003G255000 Sobic002G064100 Sobic002G064100 Sobic009G225250--Sobic002G064100 Sobic009G225250--Sobic008G172900 Sobic009G225250--Sobic009G067700 Sobic002G291850 Sobic002G291850 Sobic009G225250--Sobic002G291850 Sobic009G225250--Sobic005G002350 Sobic008G043000--Sobic009G225250 Sobic008G043000--Sobic002G250700 Sobic008G043000--Sobic004G204700 Sobic008G043000--Sobic003G255000 Sobic008G043000--Sobic005G002350 Sobic008G043000--Sobic008G172900 Sobic008G043000--Sobic002G064100 Sobic008G043000--Sobic009G080500 Sobic008G043000--Sobic002G291850 Sobic002G250700--Sobic009G225250 Sobic002G250700--Sobic008G043000 Sobic002G250700--Sobic004G204700 Sobic002G250700--Sobic003G255000 Sobic002G250700--Sobic002G064100 Sobic002G250700--Sobic009G067700 Sobic002G250700--Sobic002G291850 Sobic002G250700--Sobic008G172900 Sobic002G250700--Sobic005G002350 Sobic004G204700--Sobic009G225250 Sobic004G204700--Sobic009G067700 Sobic004G204700--Sobic002G291850 Sobic004G204700--Sobic002G250700 Sobic004G204700--Sobic008G043000 Sobic004G204700--Sobic009G062150 Sobic010G142132 Sobic010G142132 Sobic004G204700--Sobic010G142132 Sobic001G183900 Sobic001G183900 Sobic004G204700--Sobic001G183900 Sobic009G128901 Sobic009G128901 Sobic004G204700--Sobic009G128901 Sobic005G002350--Sobic008G043000 Sobic005G002350--Sobic009G225250 Sobic005G002350--Sobic003G255000 Sobic005G002350--Sobic002G250700 Sobic005G002350--Sobic009G080500 Sobic002G392550 Sobic002G392550 Sobic005G002350--Sobic002G392550 Sobic005G002350--Sobic004G204700 Sobic005G002350--Sobic008G172900 Sobic002G369100 Sobic002G369100 Sobic005G002350--Sobic002G369100 Sobic008G153801 Sobic008G153801 Sobic009G062150--Sobic008G153801 Sobic006G204850 Sobic006G204850 Sobic009G062150--Sobic006G204850 Sobic003G426750 Sobic003G426750 Sobic009G062150--Sobic003G426750 Sobic009G062150--Sobic009G067700 Sobic005G017632 Sobic005G017632 Sobic009G062150--Sobic005G017632 Sobic001G018700 Sobic001G018700 Sobic009G062150--Sobic001G018700 Sobic003G255000--Sobic008G043000 Sobic003G255000--Sobic009G225250 Sobic003G255000--Sobic002G250700 Sobic003G255000--Sobic002G392550 Sobic003G255000--Sobic005G002350 Sobic003G255000--Sobic004G204700 Sobic003G255000--Sobic008G172900 Sobic003G255000--Sobic009G080500 Sobic003G063801 Sobic003G063801 Sobic003G255000--Sobic003G063801 Sobic008G106550 Sobic008G106550 Sobic009G067700--Sobic008G106550 Sobic009G067700--Sobic001G018700 Sobic008G172900--Sobic009G225250 Sobic008G172900--Sobic008G043000 Sobic008G172900--Sobic002G250700 Sobic008G172900--Sobic004G204700 Sobic008G172900--Sobic002G064100 Sobic008G172900--Sobic003G255000 Sobic008G172900--Sobic009G067700 Sobic008G172900--Sobic009G080500 Sobic008G172900--Sobic002G291850
Octagon: transcription factors


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