Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G369100.1
Synonym
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1B6QFE7
Pfam -
Panther DB PTHR33333 PTHR33333:SF6
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os07g41400.1 : EGG APPARATUS-1, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.009G019301 - -
2 Sobic.004G204700 OsFBX230 - F-box domain containing protein, expressed -
3 Sobic.001G539100 - -
4 Sobic.003G405400 OsFBX188 - F-box domain containing protein, expressed -
5 Sobic.009G067700 ZOS1-19 - C2H2 zinc finger protein, expressed -
6 Sobic.009G225250 - -
7 Sobic.006G075650 - -
8 Sobic.009G062150 - -
9 Sobic.002G291850 - -
10 Sobic.003G090100 seven in absentia protein family domain containing protein, expressed -
11 Sobic.005G207900 zinc knuckle family protein, expressed -
12 Sobic.002G218350 - -
13 Sobic.010G142132 - -
14 Sobic.002G250700 DC1 domain-containing protein, putative, expressed -
15 Sobic.003G262000 plant-specific domain TIGR01568 family protein, expressed -
16 Sobic.007G146800 late embryogenesis abundant protein, putative, expressed -
17 Sobic.008G043000 tentative name(PubMedID : 31536532)@histone-like transcription factor and archaeal histone, putative, expressed K08066: NFYC, nuclear transcription factor Y, gamma
18 Sobic.005G193900 DNA binding protein, putative, expressed -
19 Sobic.008G028850 - -
20 Sobic.001G018700 RD26, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic002G369100 Sobic002G369100 Sobic009G019301 Sobic009G019301 Sobic002G369100--Sobic009G019301 Sobic004G204700 Sobic004G204700 Sobic002G369100--Sobic004G204700 Sobic001G539100 Sobic001G539100 Sobic002G369100--Sobic001G539100 Sobic003G405400 Sobic003G405400 Sobic002G369100--Sobic003G405400 Sobic009G067700 Sobic009G067700 Sobic002G369100--Sobic009G067700 Sobic009G225250 Sobic009G225250 Sobic002G369100--Sobic009G225250 Sobic006G075650 Sobic006G075650 Sobic002G369100--Sobic006G075650 Sobic009G062150 Sobic009G062150 Sobic002G369100--Sobic009G062150 Sobic002G291850 Sobic002G291850 Sobic002G369100--Sobic002G291850 Sobic009G019301--Sobic001G539100 Sobic009G019301--Sobic003G405400 Sobic009G019301--Sobic006G075650 Sobic002G218350 Sobic002G218350 Sobic009G019301--Sobic002G218350 Sobic005G193900 Sobic005G193900 Sobic009G019301--Sobic005G193900 Sobic007G146800 Sobic007G146800 Sobic009G019301--Sobic007G146800 Sobic001G018700 Sobic001G018700 Sobic009G019301--Sobic001G018700 Sobic004G204700--Sobic009G225250 Sobic004G204700--Sobic009G067700 Sobic004G204700--Sobic002G291850 Sobic002G250700 Sobic002G250700 Sobic004G204700--Sobic002G250700 Sobic008G043000 Sobic008G043000 Sobic004G204700--Sobic008G043000 Sobic004G204700--Sobic009G062150 Sobic010G142132 Sobic010G142132 Sobic004G204700--Sobic010G142132 Sobic001G183900 Sobic001G183900 Sobic004G204700--Sobic001G183900 Sobic009G128901 Sobic009G128901 Sobic004G204700--Sobic009G128901 Sobic001G539100--Sobic003G405400 Sobic001G539100--Sobic009G019301 Sobic001G030800 Sobic001G030800 Sobic001G539100--Sobic001G030800 Sobic001G539100--Sobic002G218350 Sobic001G539100--Sobic005G193900 Sobic001G539100--Sobic001G018700 Sobic003G405400--Sobic001G539100 Sobic003G405400--Sobic001G018700 Sobic008G106550 Sobic008G106550 Sobic009G067700--Sobic008G106550 Sobic009G067700--Sobic001G018700 Sobic009G225250--Sobic008G043000 Sobic009G225250--Sobic002G250700 Sobic009G225250--Sobic004G204700 Sobic003G255000 Sobic003G255000 Sobic009G225250--Sobic003G255000 Sobic002G064100 Sobic002G064100 Sobic009G225250--Sobic002G064100 Sobic008G172900 Sobic008G172900 Sobic009G225250--Sobic008G172900 Sobic009G225250--Sobic009G067700 Sobic009G225250--Sobic002G291850 Sobic005G002350 Sobic005G002350 Sobic009G225250--Sobic005G002350 Sobic006G075650--Sobic003G405400 Sobic001G211101 Sobic001G211101 Sobic006G075650--Sobic001G211101 Sobic006G075650--Sobic001G539100 Sobic003G178101 Sobic003G178101 Sobic006G075650--Sobic003G178101 Sobic006G075650--Sobic009G019301 Sobic005G062300 Sobic005G062300 Sobic006G075650--Sobic005G062300 Sobic003G384650 Sobic003G384650 Sobic006G075650--Sobic003G384650 Sobic002G099500 Sobic002G099500 Sobic006G075650--Sobic002G099500 Sobic006G075650--Sobic002G218350 Sobic008G153801 Sobic008G153801 Sobic009G062150--Sobic008G153801 Sobic006G204850 Sobic006G204850 Sobic009G062150--Sobic006G204850 Sobic003G426750 Sobic003G426750 Sobic009G062150--Sobic003G426750 Sobic009G062150--Sobic009G067700 Sobic005G017632 Sobic005G017632 Sobic009G062150--Sobic005G017632 Sobic009G062150--Sobic001G018700 Sobic002G291850--Sobic009G067700 Sobic002G291850--Sobic008G106550 Sobic002G291850--Sobic009G128901 Sobic002G291850--Sobic004G204700 Sobic002G291850--Sobic001G018700
Octagon: transcription factors


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