Gene annotation
Transcriptome id Sobic.010G174550.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1W0VTK5
Pfam PF00560 PF13855
Panther DB PTHR27004 PTHR27004:SF12
NCBI CDD KOG4579; Leucine-rich repeat (LRR) protein associated with apoptosis in muscle tissue KOG0617Ras suppressor protein (contains leucine-rich repeats)
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0005515; protein binding


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G33170 : Leucine-rich repeat receptor-like protein kinase family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os11g35840.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.008G043000 tentative name(PubMedID : 31536532)@histone-like transcription factor and archaeal histone, putative, expressed K08066: NFYC, nuclear transcription factor Y, gamma
2 Sobic.003G255000 no apical meristem protein, putative, expressed -
3 Sobic.009G225250 - -
4 Sobic.002G250700 DC1 domain-containing protein, putative, expressed -
5 Sobic.006G022800 vignain precursor, putative, expressed -
6 Sobic.004G204700 OsFBX230 - F-box domain containing protein, expressed -
7 Sobic.003G029350 - -
8 Sobic.009G080500 - -
9 Sobic.002G392550 - -
10 Sobic.003G358500 - -
11 Sobic.002G291850 - -
12 Sobic.009G067700 ZOS1-19 - C2H2 zinc finger protein, expressed -
13 Sobic.006G025132 - -
14 Sobic.005G002350 - -
15 Sobic.008G172900 RGH1A, putative, expressed -
16 Sobic.002G064100 DNA-binding storekeeper protein-related, putative, expressed -
17 Sobic.002G069700 expressed protein -
18 Sobic.007G116733 - -
19 Sobic.006G218050 - -
20 Sobic.005G045400 - -


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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