Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G069700.1
Synonym
Functional annotation expressed protein
UniProt C5XCK6
Pfam PF01582
Panther DB PTHR31008 PTHR31008:SF2
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0007165; signal transduction GO:0005515protein binding


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G52900 : Toll-Interleukin-Resistance (TIR) domain family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os07g37950.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a048417
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.010G101350 - -
2 Sobic.009G110300 protein phosphotase protein, putative, expressed -
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17 Sobic.001G018700 RD26, putative, expressed -
18 Sobic.001G018700 RD26, putative, expressed -
19 Sobic.001G018700 RD26, putative, expressed -
20 Sobic.001G018700 RD26, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic002G069700 Sobic002G069700 Sobic010G101350 Sobic010G101350 Sobic002G069700--Sobic010G101350 Sobic009G110300 Sobic009G110300 Sobic002G069700--Sobic009G110300 Sobic003G358500 Sobic003G358500 Sobic002G069700--Sobic003G358500 Sobic001G218300 Sobic001G218300 Sobic002G069700--Sobic001G218300 Sobic007G023650 Sobic007G023650 Sobic002G069700--Sobic007G023650 Sobic009G196500 Sobic009G196500 Sobic002G069700--Sobic009G196500 Sobic004G177050 Sobic004G177050 Sobic002G069700--Sobic004G177050 Sobic010G197632 Sobic010G197632 Sobic002G069700--Sobic010G197632 Sobic005G193900 Sobic005G193900 Sobic002G069700--Sobic005G193900 Sobic010G101350--Sobic002G069700 Sobic010G101350--Sobic009G110300 Sobic010G101350--Sobic003G358500 Sobic010G101350--Sobic004G177050 Sobic010G101350--Sobic001G218300 Sobic010G101350--Sobic007G023650 Sobic010G101350--Sobic010G197632 Sobic001G154800 Sobic001G154800 Sobic010G101350--Sobic001G154800 Sobic010G101350--Sobic009G196500 Sobic009G110300--Sobic002G069700 Sobic009G110300--Sobic007G023650 Sobic001G236950 Sobic001G236950 Sobic009G110300--Sobic001G236950 Sobic009G110300--Sobic003G358500 Sobic009G110300--Sobic005G193900 Sobic009G110300--Sobic009G196500 Sobic009G110300--Sobic001G218300 Sobic001G018700 Sobic001G018700 Sobic009G110300--Sobic001G018700 Sobic003G358500--Sobic007G023650 Sobic003G358500--Sobic002G069700 Sobic003G358500--Sobic005G193900 Sobic003G358500--Sobic009G110300 Sobic003G358500--Sobic009G196500 Sobic010G140300 Sobic010G140300 Sobic003G358500--Sobic010G140300 Sobic008G082450 Sobic008G082450 Sobic003G358500--Sobic008G082450 Sobic003G358500--Sobic001G218300 Sobic001G040900 Sobic001G040900 Sobic003G358500--Sobic001G040900 Sobic005G062300 Sobic005G062300 Sobic001G218300--Sobic005G062300 Sobic001G211101 Sobic001G211101 Sobic001G218300--Sobic001G211101 Sobic001G218300--Sobic007G023650 Sobic003G178101 Sobic003G178101 Sobic001G218300--Sobic003G178101 Sobic006G075650 Sobic006G075650 Sobic001G218300--Sobic006G075650 Sobic001G218300--Sobic005G193900 Sobic001G218300--Sobic002G069700 Sobic001G218300--Sobic009G110300 Sobic001G218300--Sobic009G196500 Sobic007G023650--Sobic005G193900 Sobic007G023650--Sobic010G140300 Sobic007G023650--Sobic008G082450 Sobic007G023650--Sobic001G040900 Sobic010G090550 Sobic010G090550 Sobic007G023650--Sobic010G090550 Sobic007G023650--Sobic001G018700 Sobic002G034900 Sobic002G034900 Sobic009G196500--Sobic002G034900 Sobic009G196500--Sobic005G193900 Sobic009G196500--Sobic001G018700 Sobic004G177050--Sobic002G069700 Sobic004G177050--Sobic009G196500 Sobic004G177050--Sobic010G101350 Sobic001G321300 Sobic001G321300 Sobic004G177050--Sobic001G321300 Sobic004G177050--Sobic001G218300 Sobic004G177050--Sobic010G197632 Sobic004G177050--Sobic009G110300 Sobic004G177050--Sobic003G358500 Sobic004G177050--Sobic002G034900 Sobic010G197632--Sobic009G196500 Sobic010G197632--Sobic003G358500 Sobic001G185700 Sobic001G185700 Sobic010G197632--Sobic001G185700 Sobic010G197632--Sobic007G023650 Sobic010G197632--Sobic002G069700 Sobic003G137832 Sobic003G137832 Sobic010G197632--Sobic003G137832 Sobic010G197632--Sobic005G193900 Sobic010G197632--Sobic009G110300 Sobic010G197632--Sobic002G034900 Sobic005G193900--Sobic001G018700
Octagon: transcription factors


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