Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G233900.1
Synonym Sb01g020500
Functional annotation expressed protein
UniProt C5X0D0
Pfam PF08879
Panther DB PTHR34680
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os10g30890.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a006760 , Zm00025a006759
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.008G088881 - -
2 Sobic.005G226150 - -
3 Sobic.005G225000 - -
4 Sobic.005G199101 - K12581: CNOT7_8, CAF1, CCR4-NOT transcription complex subunit 7/8
5 Sobic.010G153800 - -
6 Sobic.002G091800 peptide transporter PTR2, putative, expressed -
7 Sobic.010G107300 - -
8 Sobic.002G344900 MBTB21 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Meprin and TRAF Homology MATH domain, expressed K10523: speckle-type POZ protein
9 Sobic.010G148600 WRKY31, expressed -
10 Sobic.005G140400 - -
11 Sobic.005G083160 - -
12 Sobic.005G153600 DEF1 - Defensin and Defensin-like DEFL family, expressed -
13 Sobic.005G187100 - -
14 Sobic.005G112066 - -
15 Sobic.002G360900 GASR9 - Gibberellin-regulated GASA/GAST/Snakin family protein precursor, expressed -
16 Sobic.003G323000 - -
17 Sobic.010G136300 osMFT1 MFT-Like1 homologous to Mother of FT and TFL1 gene@ contains Pfam profile PF01161: Phosphatidylethanolamine-binding protein, expressed -
18 Sobic.005G223200 - -
19 Sobic.010G142300 - -
20 Sobic.006G031600 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic001G233900 Sobic001G233900 Sobic008G088881 Sobic008G088881 Sobic001G233900--Sobic008G088881 Sobic005G226150 Sobic005G226150 Sobic001G233900--Sobic005G226150 Sobic005G225000 Sobic005G225000 Sobic001G233900--Sobic005G225000 Sobic005G199101 Sobic005G199101 Sobic001G233900--Sobic005G199101 Sobic010G153800 Sobic010G153800 Sobic001G233900--Sobic010G153800 Sobic002G091800 Sobic002G091800 Sobic001G233900--Sobic002G091800 Sobic010G107300 Sobic010G107300 Sobic001G233900--Sobic010G107300 Sobic002G344900 Sobic002G344900 Sobic001G233900--Sobic002G344900 Sobic010G148600 Sobic010G148600 Sobic001G233900--Sobic010G148600 Sobic008G088881--Sobic005G226150 Sobic009G007500 Sobic009G007500 Sobic008G088881--Sobic009G007500 Sobic006G062700 Sobic006G062700 Sobic008G088881--Sobic006G062700 Sobic008G088450 Sobic008G088450 Sobic008G088881--Sobic008G088450 Sobic001G112250 Sobic001G112250 Sobic008G088881--Sobic001G112250 Sobic008G103066 Sobic008G103066 Sobic008G088881--Sobic008G103066 Sobic007G070700 Sobic007G070700 Sobic008G088881--Sobic007G070700 Sobic005G174900 Sobic005G174900 Sobic008G088881--Sobic005G174900 Sobic001G249233 Sobic001G249233 Sobic008G088881--Sobic001G249233 Sobic003G247700 Sobic003G247700 Sobic005G226150--Sobic003G247700 Sobic005G226150--Sobic007G070700 Sobic009G245750 Sobic009G245750 Sobic005G226150--Sobic009G245750 Sobic001G253501 Sobic001G253501 Sobic005G226150--Sobic001G253501 Sobic005G226150--Sobic008G103066 Sobic005G226150--Sobic008G088881 Sobic009G001600 Sobic009G001600 Sobic005G226150--Sobic009G001600 Sobic005G226150--Sobic005G174900 Sobic007G025300 Sobic007G025300 Sobic005G226150--Sobic007G025300 Sobic005G225000--Sobic005G199101 Sobic005G225000--Sobic010G153800 Sobic005G153600 Sobic005G153600 Sobic005G225000--Sobic005G153600 Sobic005G225000--Sobic010G148600 Sobic005G225000--Sobic002G091800 Sobic005G187100 Sobic005G187100 Sobic005G225000--Sobic005G187100 Sobic005G225000--Sobic002G344900 Sobic010G219300 Sobic010G219300 Sobic005G225000--Sobic010G219300 Sobic005G140400 Sobic005G140400 Sobic005G225000--Sobic005G140400 Sobic005G199101--Sobic010G153800 Sobic005G199101--Sobic005G225000 Sobic005G199101--Sobic005G187100 Sobic005G199101--Sobic002G091800 Sobic005G199101--Sobic002G344900 Sobic005G199101--Sobic005G153600 Sobic005G199101--Sobic010G148600 Sobic005G199101--Sobic005G140400 Sobic005G199101--Sobic010G219300 Sobic010G153800--Sobic005G199101 Sobic010G153800--Sobic005G225000 Sobic010G153800--Sobic005G187100 Sobic010G153800--Sobic002G091800 Sobic010G153800--Sobic002G344900 Sobic010G153800--Sobic005G153600 Sobic010G153800--Sobic010G148600 Sobic010G153800--Sobic005G140400 Sobic010G153800--Sobic010G219300 Sobic002G091800--Sobic002G344900 Sobic002G091800--Sobic005G140400 Sobic002G091800--Sobic010G148600 Sobic005G112066 Sobic005G112066 Sobic002G091800--Sobic005G112066 Sobic002G091800--Sobic005G199101 Sobic002G091800--Sobic010G153800 Sobic002G091800--Sobic005G225000 Sobic002G077500 Sobic002G077500 Sobic002G091800--Sobic002G077500 Sobic007G049400 Sobic007G049400 Sobic002G091800--Sobic007G049400 Sobic005G083160 Sobic005G083160 Sobic010G107300--Sobic005G083160 Sobic010G107300--Sobic005G226150 Sobic010G022600 Sobic010G022600 Sobic010G107300--Sobic010G022600 Sobic010G107300--Sobic008G088881 Sobic002G360900 Sobic002G360900 Sobic010G107300--Sobic002G360900 Sobic010G107300--Sobic001G233900 Sobic010G107300--Sobic003G247700 Sobic003G323000 Sobic003G323000 Sobic010G107300--Sobic003G323000 Sobic010G107300--Sobic007G070700 Sobic002G344900--Sobic002G091800 Sobic002G344900--Sobic010G153800 Sobic002G344900--Sobic005G199101 Sobic002G344900--Sobic005G112066 Sobic001G326000 Sobic001G326000 Sobic002G344900--Sobic001G326000 Sobic002G344900--Sobic005G140400 Sobic002G344900--Sobic005G225000 Sobic007G156300 Sobic007G156300 Sobic002G344900--Sobic007G156300 Sobic005G223200 Sobic005G223200 Sobic002G344900--Sobic005G223200 Sobic010G148600--Sobic005G140400 Sobic010G148600--Sobic001G249233 Sobic010G148600--Sobic005G174900 Sobic010G148600--Sobic002G091800 Sobic010G148600--Sobic005G225000 Sobic003G024700 Sobic003G024700 Sobic010G148600--Sobic003G024700 Sobic010G148600--Sobic006G062700 Sobic010G148600--Sobic005G199101 Sobic010G148600--Sobic010G153800
Octagon: transcription factors


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