Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G225000.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6PU56
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) Zm00025a029105
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G199101 - K12581: CNOT7_8, CAF1, CCR4-NOT transcription complex subunit 7/8
2 Sobic.010G153800 - -
3 Sobic.005G153600 DEF1 - Defensin and Defensin-like DEFL family, expressed -
4 Sobic.010G148600 WRKY31, expressed -
5 Sobic.002G091800 peptide transporter PTR2, putative, expressed -
6 Sobic.005G187100 - -
7 Sobic.002G344900 MBTB21 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Meprin and TRAF Homology MATH domain, expressed K10523: speckle-type POZ protein
8 Sobic.010G219300 DEFL27 - Defensin and Defensin-like DEFL family -
9 Sobic.005G140400 - -
10 Sobic.003G024700 peroxidase precursor, putative, expressed K00430: peroxidase
11 Sobic.001G249233 - -
12 Sobic.001G096500 phosphoesterase, putative, expressed K08073: bifunctional polynucleotide phosphatase/kinase
13 Sobic.005G174900 - -
14 Sobic.007G205200 Not investigated(PubMedID : 23766026)@AP2 domain containing protein, expressed -
15 Sobic.006G062700 transferase family protein, putative, expressed -
16 Sobic.005G223200 - -
17 Sobic.005G112066 - -
18 Sobic.010G142300 - -
19 Sobic.010G034900 expressed protein -
20 Sobic.001G326000 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic005G225000 Sobic005G225000 Sobic005G199101 Sobic005G199101 Sobic005G225000--Sobic005G199101 Sobic010G153800 Sobic010G153800 Sobic005G225000--Sobic010G153800 Sobic005G153600 Sobic005G153600 Sobic005G225000--Sobic005G153600 Sobic010G148600 Sobic010G148600 Sobic005G225000--Sobic010G148600 Sobic002G091800 Sobic002G091800 Sobic005G225000--Sobic002G091800 Sobic005G187100 Sobic005G187100 Sobic005G225000--Sobic005G187100 Sobic002G344900 Sobic002G344900 Sobic005G225000--Sobic002G344900 Sobic010G219300 Sobic010G219300 Sobic005G225000--Sobic010G219300 Sobic005G140400 Sobic005G140400 Sobic005G225000--Sobic005G140400 Sobic005G199101--Sobic010G153800 Sobic005G199101--Sobic005G225000 Sobic005G199101--Sobic005G187100 Sobic005G199101--Sobic002G091800 Sobic005G199101--Sobic002G344900 Sobic005G199101--Sobic005G153600 Sobic005G199101--Sobic010G148600 Sobic005G199101--Sobic005G140400 Sobic005G199101--Sobic010G219300 Sobic010G153800--Sobic005G199101 Sobic010G153800--Sobic005G225000 Sobic010G153800--Sobic005G187100 Sobic010G153800--Sobic002G091800 Sobic010G153800--Sobic002G344900 Sobic010G153800--Sobic005G153600 Sobic010G153800--Sobic010G148600 Sobic010G153800--Sobic005G140400 Sobic010G153800--Sobic010G219300 Sobic005G153600--Sobic005G225000 Sobic007G205200 Sobic007G205200 Sobic005G153600--Sobic007G205200 Sobic005G153600--Sobic005G199101 Sobic005G153600--Sobic010G153800 Sobic001G096500 Sobic001G096500 Sobic005G153600--Sobic001G096500 Sobic005G153600--Sobic010G219300 Sobic005G153600--Sobic010G148600 Sobic005G116000 Sobic005G116000 Sobic005G153600--Sobic005G116000 Sobic005G153600--Sobic005G187100 Sobic010G148600--Sobic005G140400 Sobic001G249233 Sobic001G249233 Sobic010G148600--Sobic001G249233 Sobic005G174900 Sobic005G174900 Sobic010G148600--Sobic005G174900 Sobic010G148600--Sobic002G091800 Sobic010G148600--Sobic005G225000 Sobic003G024700 Sobic003G024700 Sobic010G148600--Sobic003G024700 Sobic006G062700 Sobic006G062700 Sobic010G148600--Sobic006G062700 Sobic010G148600--Sobic005G199101 Sobic010G148600--Sobic010G153800 Sobic002G091800--Sobic002G344900 Sobic002G091800--Sobic005G140400 Sobic002G091800--Sobic010G148600 Sobic005G112066 Sobic005G112066 Sobic002G091800--Sobic005G112066 Sobic002G091800--Sobic005G199101 Sobic002G091800--Sobic010G153800 Sobic002G091800--Sobic005G225000 Sobic002G077500 Sobic002G077500 Sobic002G091800--Sobic002G077500 Sobic007G049400 Sobic007G049400 Sobic002G091800--Sobic007G049400 Sobic005G187100--Sobic010G153800 Sobic005G187100--Sobic005G199101 Sobic005G187100--Sobic005G225000 Sobic005G187100--Sobic010G219300 Sobic007G082900 Sobic007G082900 Sobic005G187100--Sobic007G082900 Sobic005G187100--Sobic002G091800 Sobic005G187100--Sobic002G344900 Sobic005G187100--Sobic005G153600 Sobic005G187100--Sobic010G148600 Sobic002G344900--Sobic002G091800 Sobic002G344900--Sobic010G153800 Sobic002G344900--Sobic005G199101 Sobic002G344900--Sobic005G112066 Sobic001G326000 Sobic001G326000 Sobic002G344900--Sobic001G326000 Sobic002G344900--Sobic005G140400 Sobic002G344900--Sobic005G225000 Sobic007G156300 Sobic007G156300 Sobic002G344900--Sobic007G156300 Sobic005G223200 Sobic005G223200 Sobic002G344900--Sobic005G223200 Sobic010G219300--Sobic003G024700 Sobic010G219300--Sobic005G187100 Sobic010G034900 Sobic010G034900 Sobic010G219300--Sobic010G034900 Sobic010G219300--Sobic007G082900 Sobic010G219300--Sobic005G153600 Sobic010G219300--Sobic005G225000 Sobic010G219300--Sobic010G148600 Sobic010G219300--Sobic001G096500 Sobic010G219300--Sobic005G199101 Sobic005G140400--Sobic005G174900 Sobic005G140400--Sobic002G091800 Sobic005G140400--Sobic007G049400 Sobic005G140400--Sobic010G148600 Sobic005G140400--Sobic001G249233 Sobic005G140400--Sobic006G062700 Sobic005G140400--Sobic005G112066 Sobic007G070700 Sobic007G070700 Sobic005G140400--Sobic007G070700 Sobic005G140400--Sobic002G077500
Octagon: transcription factors


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