Gene annotation
Transcriptome id Sobic.006G062700.1
Synonym HCT, Sb06g015030
Functional annotation transferase family protein, putative, expressed
UniProt C5YFE4
Pfam PF02458
Panther DB PTHR31642 PTHR31642:SF39
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0016747; transferase activity, transferring acyl groups other than amino-acyl groups


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G48930 : hydroxycinnamoyl-CoA shikimate/quinate hydroxycinnamoyl transferase
RAP-DB (Rice) LOC_Os09g37200.1 : transferase family protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a011613
Brachypodium KQJ91286
Barley HORVU5Hr1G084980.3 , HORVU5Hr1G084980.1 , HORVU5Hr1G084980.4
Wheat -
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.006G062700


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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20 Sobic.001G535900 aquaporin protein, putative, expressed K09873: aquaporin TIP


Gene co-expression network
sample Sobic006G062700 Sobic006G062700 Sobic005G174900 Sobic005G174900 Sobic006G062700--Sobic005G174900 Sobic001G249233 Sobic001G249233 Sobic006G062700--Sobic001G249233 Sobic008G103066 Sobic008G103066 Sobic006G062700--Sobic008G103066 Sobic007G025300 Sobic007G025300 Sobic006G062700--Sobic007G025300 Sobic005G140400 Sobic005G140400 Sobic006G062700--Sobic005G140400 Sobic010G148600 Sobic010G148600 Sobic006G062700--Sobic010G148600 Sobic001G112250 Sobic001G112250 Sobic006G062700--Sobic001G112250 Sobic007G070700 Sobic007G070700 Sobic006G062700--Sobic007G070700 Sobic010G109700 Sobic010G109700 Sobic006G062700--Sobic010G109700 Sobic005G174900--Sobic001G249233 Sobic005G174900--Sobic006G062700 Sobic005G174900--Sobic005G140400 Sobic005G174900--Sobic007G025300 Sobic005G174900--Sobic008G103066 Sobic005G174900--Sobic010G148600 Sobic001G253501 Sobic001G253501 Sobic005G174900--Sobic001G253501 Sobic009G245750 Sobic009G245750 Sobic005G174900--Sobic009G245750 Sobic005G174900--Sobic007G070700 Sobic001G249233--Sobic005G174900 Sobic001G249233--Sobic006G062700 Sobic001G249233--Sobic010G148600 Sobic001G249233--Sobic005G140400 Sobic001G249233--Sobic010G109700 Sobic001G249233--Sobic007G025300 Sobic003G024700 Sobic003G024700 Sobic001G249233--Sobic003G024700 Sobic005G056100 Sobic005G056100 Sobic001G249233--Sobic005G056100 Sobic001G249233--Sobic008G103066 Sobic008G103066--Sobic001G112250 Sobic009G001600 Sobic009G001600 Sobic008G103066--Sobic009G001600 Sobic008G103066--Sobic007G025300 Sobic003G247700 Sobic003G247700 Sobic008G103066--Sobic003G247700 Sobic008G103066--Sobic009G245750 Sobic008G103066--Sobic001G253501 Sobic001G535900 Sobic001G535900 Sobic008G103066--Sobic001G535900 Sobic002G211700 Sobic002G211700 Sobic008G103066--Sobic002G211700 Sobic008G103066--Sobic006G062700 Sobic007G025300--Sobic008G103066 Sobic002G089400 Sobic002G089400 Sobic007G025300--Sobic002G089400 Sobic010G200400 Sobic010G200400 Sobic007G025300--Sobic010G200400 Sobic007G025300--Sobic006G062700 Sobic007G025300--Sobic005G174900 Sobic007G025300--Sobic009G001600 Sobic002G367600 Sobic002G367600 Sobic007G025300--Sobic002G367600 Sobic007G025300--Sobic001G535900 Sobic007G205100 Sobic007G205100 Sobic007G025300--Sobic007G205100 Sobic005G140400--Sobic005G174900 Sobic002G091800 Sobic002G091800 Sobic005G140400--Sobic002G091800 Sobic007G049400 Sobic007G049400 Sobic005G140400--Sobic007G049400 Sobic005G140400--Sobic010G148600 Sobic005G140400--Sobic001G249233 Sobic005G140400--Sobic006G062700 Sobic005G112066 Sobic005G112066 Sobic005G140400--Sobic005G112066 Sobic005G140400--Sobic007G070700 Sobic002G077500 Sobic002G077500 Sobic005G140400--Sobic002G077500 Sobic010G148600--Sobic005G140400 Sobic010G148600--Sobic001G249233 Sobic010G148600--Sobic005G174900 Sobic010G148600--Sobic002G091800 Sobic005G225000 Sobic005G225000 Sobic010G148600--Sobic005G225000 Sobic010G148600--Sobic003G024700 Sobic010G148600--Sobic006G062700 Sobic005G199101 Sobic005G199101 Sobic010G148600--Sobic005G199101 Sobic010G153800 Sobic010G153800 Sobic010G148600--Sobic010G153800 Sobic001G112250--Sobic008G103066 Sobic001G112250--Sobic001G253501 Sobic001G112250--Sobic009G245750 Sobic002G077600 Sobic002G077600 Sobic001G112250--Sobic002G077600 Sobic001G112250--Sobic007G070700 Sobic001G112250--Sobic009G001600 Sobic001G112250--Sobic003G247700 Sobic001G112250--Sobic002G211700 Sobic001G112250--Sobic001G535900 Sobic007G070700--Sobic002G077600 Sobic007G083300 Sobic007G083300 Sobic007G070700--Sobic007G083300 Sobic007G070700--Sobic003G247700 Sobic007G070700--Sobic001G253501 Sobic007G070700--Sobic009G245750 Sobic007G070700--Sobic002G211700 Sobic007G070700--Sobic009G001600 Sobic007G070700--Sobic001G112250 SobicK043500 SobicK043500 Sobic007G070700--SobicK043500 Sobic010G109700--Sobic005G056100 Sobic001G096500 Sobic001G096500 Sobic010G109700--Sobic001G096500 Sobic010G109700--Sobic001G249233 Sobic008G081000 Sobic008G081000 Sobic010G109700--Sobic008G081000 Sobic005G102451 Sobic005G102451 Sobic010G109700--Sobic005G102451 Sobic010G109700--Sobic006G062700 Sobic010G109700--Sobic005G174900 Sobic010G109700--Sobic007G025300 Sobic008G088450 Sobic008G088450 Sobic010G109700--Sobic008G088450
Octagon: transcription factors


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