Gene annotation
Transcriptome id Sobic.010G109700.1
Synonym Sb10g009580
Functional annotation myb-like DNA-binding domain, SHAQKYF class family protein, expressed
UniProt C5Z845
Pfam PF00249
Panther DB PTHR12374:SF26 PTHR12374
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G38090 : Duplicated homeodomain-like superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os06g07650.1 : myb-like DNA-binding domain, SHAQKYF class family protein, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G056100 - -
2 Sobic.001G096500 phosphoesterase, putative, expressed K08073: bifunctional polynucleotide phosphatase/kinase
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11 Sobic.010G034900 expressed protein -
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15 Sobic.010G200400 AP2 domain containing protein, expressed -
16 Sobic.002G089400 DEF8 - Defensin and Defensin-like DEFL family, expressed -
17 Sobic.008G103066 - -
18 Sobic.007G205100 AP2 domain containing protein, expressed -
19 Sobic.003G303500 homeobox and START domains containing protein, putative, expressed K09338: homeobox-leucine zipper protein
20 Sobic.005G140400 - -


Gene co-expression network
sample Sobic010G109700 Sobic010G109700 Sobic005G056100 Sobic005G056100 Sobic010G109700--Sobic005G056100 Sobic001G096500 Sobic001G096500 Sobic010G109700--Sobic001G096500 Sobic001G249233 Sobic001G249233 Sobic010G109700--Sobic001G249233 Sobic008G081000 Sobic008G081000 Sobic010G109700--Sobic008G081000 Sobic005G102451 Sobic005G102451 Sobic010G109700--Sobic005G102451 Sobic006G062700 Sobic006G062700 Sobic010G109700--Sobic006G062700 Sobic005G174900 Sobic005G174900 Sobic010G109700--Sobic005G174900 Sobic007G025300 Sobic007G025300 Sobic010G109700--Sobic007G025300 Sobic008G088450 Sobic008G088450 Sobic010G109700--Sobic008G088450 Sobic005G056100--Sobic010G109700 Sobic005G056100--Sobic001G096500 Sobic005G056100--Sobic008G081000 Sobic005G056100--Sobic005G102451 Sobic005G056100--Sobic001G249233 Sobic007G205200 Sobic007G205200 Sobic005G056100--Sobic007G205200 Sobic005G056100--Sobic006G062700 Sobic002G345400 Sobic002G345400 Sobic005G056100--Sobic002G345400 Sobic005G056100--Sobic008G088450 Sobic001G096500--Sobic007G205200 Sobic001G096500--Sobic005G056100 Sobic001G096500--Sobic010G109700 Sobic005G153600 Sobic005G153600 Sobic001G096500--Sobic005G153600 Sobic001G096500--Sobic005G102451 Sobic001G096500--Sobic002G345400 Sobic001G096500--Sobic001G249233 Sobic010G148600 Sobic010G148600 Sobic001G096500--Sobic010G148600 Sobic001G328900 Sobic001G328900 Sobic001G096500--Sobic001G328900 Sobic001G249233--Sobic005G174900 Sobic001G249233--Sobic006G062700 Sobic001G249233--Sobic010G148600 Sobic005G140400 Sobic005G140400 Sobic001G249233--Sobic005G140400 Sobic001G249233--Sobic010G109700 Sobic001G249233--Sobic007G025300 Sobic003G024700 Sobic003G024700 Sobic001G249233--Sobic003G024700 Sobic001G249233--Sobic005G056100 Sobic008G103066 Sobic008G103066 Sobic001G249233--Sobic008G103066 Sobic008G081000--Sobic005G056100 Sobic008G081000--Sobic010G109700 Sobic008G081000--Sobic005G102451 Sobic010G200400 Sobic010G200400 Sobic008G081000--Sobic010G200400 Sobic002G089400 Sobic002G089400 Sobic008G081000--Sobic002G089400 Sobic008G081000--Sobic008G088450 Sobic008G081000--Sobic007G025300 Sobic007G205100 Sobic007G205100 Sobic008G081000--Sobic007G205100 Sobic001G068200 Sobic001G068200 Sobic008G081000--Sobic001G068200 Sobic005G102451--Sobic002G345400 Sobic005G102451--Sobic005G056100 Sobic005G102451--Sobic001G096500 Sobic005G102451--Sobic010G109700 Sobic003G303500 Sobic003G303500 Sobic005G102451--Sobic003G303500 Sobic005G102451--Sobic007G205200 Sobic005G102451--Sobic008G081000 Sobic005G102451--Sobic001G328900 Sobic009G039100 Sobic009G039100 Sobic005G102451--Sobic009G039100 Sobic006G062700--Sobic005G174900 Sobic006G062700--Sobic001G249233 Sobic006G062700--Sobic008G103066 Sobic006G062700--Sobic007G025300 Sobic006G062700--Sobic005G140400 Sobic006G062700--Sobic010G148600 Sobic001G112250 Sobic001G112250 Sobic006G062700--Sobic001G112250 Sobic007G070700 Sobic007G070700 Sobic006G062700--Sobic007G070700 Sobic006G062700--Sobic010G109700 Sobic005G174900--Sobic001G249233 Sobic005G174900--Sobic006G062700 Sobic005G174900--Sobic005G140400 Sobic005G174900--Sobic007G025300 Sobic005G174900--Sobic008G103066 Sobic005G174900--Sobic010G148600 Sobic001G253501 Sobic001G253501 Sobic005G174900--Sobic001G253501 Sobic009G245750 Sobic009G245750 Sobic005G174900--Sobic009G245750 Sobic005G174900--Sobic007G070700 Sobic007G025300--Sobic008G103066 Sobic007G025300--Sobic002G089400 Sobic007G025300--Sobic010G200400 Sobic007G025300--Sobic006G062700 Sobic007G025300--Sobic005G174900 Sobic009G001600 Sobic009G001600 Sobic007G025300--Sobic009G001600 Sobic002G367600 Sobic002G367600 Sobic007G025300--Sobic002G367600 Sobic001G535900 Sobic001G535900 Sobic007G025300--Sobic001G535900 Sobic007G025300--Sobic007G205100 Sobic009G007500 Sobic009G007500 Sobic008G088450--Sobic009G007500 Sobic008G088450--Sobic006G062700 Sobic008G088450--Sobic010G109700 Sobic008G088450--Sobic005G056100 Sobic008G088450--Sobic007G025300 Sobic008G088450--Sobic008G081000 Sobic008G088450--Sobic001G249233 Sobic008G088450--Sobic008G103066 Sobic008G088450--Sobic010G200400
Octagon: transcription factors


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