Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G303500.3,Sobic.003G303500.1,Sobic.003G303500.2
Synonym GL2
Functional annotation homeobox and START domains containing protein, putative, expressed
UniProt A0A1W0VZM7 , A0A1W0VZQ5 , A0A1W0VZR4
Pfam PF00046 PF01852
Panther DB PTHR24326 PTHR24326:SF272
NCBI CDD KOG0483; Transcription factor HEX, contains HOX and HALZ domains
KEGG Orthology K09338; homeobox-leucine zipper protein
Gene Ontology GO:0003677; DNA binding GO:0008289lipid binding


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G79840 : HD-ZIP IV family of homeobox-leucine zipper protein with lipid-binding START domain
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g55549.1 : homeobox and START domains containing protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G102451 - -
2 Sobic.002G345400 DEF1 - Defensin and Defensin-like DEFL family, expressed -
3 Sobic.008G081000 - -
4 Sobic.009G039100 myb-like DNA-binding domain, SHAQKYF class family protein, expressed -
5 Sobic.005G056100 - -
6 Sobic.001G328900 expressed protein -
7 Sobic.010G109700 myb-like DNA-binding domain, SHAQKYF class family protein, expressed -
8 Sobic.001G096500 phosphoesterase, putative, expressed K08073: bifunctional polynucleotide phosphatase/kinase
9 Sobic.007G205200 Not investigated(PubMedID : 23766026)@AP2 domain containing protein, expressed -
10 Sobic.006G064700 expressed protein -
11 Sobic.008G088450 - -
12 Sobic.005G074800 LTPL33 - Protease inhibitor/seed storage/LTP family protein precursor, expressed -
13 Sobic.003G207600 OsFBD5 - F-box and FBD domain containing protein, expressed -
14 Sobic.001G249233 - -
15 Sobic.010G085700 myb-like DNA-binding domain, SHAQKYF class family protein, expressed -
16 Sobic.005G153400 - -
17 Sobic.005G198700 - -
18 Sobic.009G039900 myb-like DNA-binding domain, SHAQKYF class family protein, expressed -
19 Sobic.001G068200 - -
20 Sobic.010G200400 AP2 domain containing protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic003G303500 Sobic003G303500 Sobic005G102451 Sobic005G102451 Sobic003G303500--Sobic005G102451 Sobic002G345400 Sobic002G345400 Sobic003G303500--Sobic002G345400 Sobic008G081000 Sobic008G081000 Sobic003G303500--Sobic008G081000 Sobic009G039100 Sobic009G039100 Sobic003G303500--Sobic009G039100 Sobic005G056100 Sobic005G056100 Sobic003G303500--Sobic005G056100 Sobic001G328900 Sobic001G328900 Sobic003G303500--Sobic001G328900 Sobic010G109700 Sobic010G109700 Sobic003G303500--Sobic010G109700 Sobic001G096500 Sobic001G096500 Sobic003G303500--Sobic001G096500 Sobic007G205200 Sobic007G205200 Sobic003G303500--Sobic007G205200 Sobic005G102451--Sobic002G345400 Sobic005G102451--Sobic005G056100 Sobic005G102451--Sobic001G096500 Sobic005G102451--Sobic010G109700 Sobic005G102451--Sobic003G303500 Sobic005G102451--Sobic007G205200 Sobic005G102451--Sobic008G081000 Sobic005G102451--Sobic001G328900 Sobic005G102451--Sobic009G039100 Sobic002G345400--Sobic005G102451 Sobic002G345400--Sobic001G328900 Sobic002G345400--Sobic007G205200 Sobic002G345400--Sobic001G096500 Sobic002G345400--Sobic009G039100 Sobic002G345400--Sobic003G303500 Sobic002G345400--Sobic005G056100 Sobic002G345400--Sobic010G109700 Sobic005G153400 Sobic005G153400 Sobic002G345400--Sobic005G153400 Sobic008G081000--Sobic005G056100 Sobic008G081000--Sobic010G109700 Sobic008G081000--Sobic005G102451 Sobic010G200400 Sobic010G200400 Sobic008G081000--Sobic010G200400 Sobic002G089400 Sobic002G089400 Sobic008G081000--Sobic002G089400 Sobic008G088450 Sobic008G088450 Sobic008G081000--Sobic008G088450 Sobic007G025300 Sobic007G025300 Sobic008G081000--Sobic007G025300 Sobic007G205100 Sobic007G205100 Sobic008G081000--Sobic007G205100 Sobic001G068200 Sobic001G068200 Sobic008G081000--Sobic001G068200 Sobic006G064700 Sobic006G064700 Sobic009G039100--Sobic006G064700 Sobic009G039100--Sobic002G345400 Sobic009G039100--Sobic001G328900 Sobic009G039100--Sobic005G102451 Sobic009G039900 Sobic009G039900 Sobic009G039100--Sobic009G039900 Sobic009G039100--Sobic003G303500 Sobic009G039100--Sobic005G153400 Sobic010G195600 Sobic010G195600 Sobic009G039100--Sobic010G195600 Sobic009G039100--Sobic007G205200 Sobic005G056100--Sobic010G109700 Sobic005G056100--Sobic001G096500 Sobic005G056100--Sobic008G081000 Sobic005G056100--Sobic005G102451 Sobic001G249233 Sobic001G249233 Sobic005G056100--Sobic001G249233 Sobic005G056100--Sobic007G205200 Sobic006G062700 Sobic006G062700 Sobic005G056100--Sobic006G062700 Sobic005G056100--Sobic002G345400 Sobic005G056100--Sobic008G088450 Sobic001G328900--Sobic002G345400 Sobic001G328900--Sobic007G205200 Sobic001G328900--Sobic005G153400 Sobic001G328900--Sobic009G039100 Sobic001G328900--Sobic005G102451 Sobic001G328900--Sobic001G096500 Sobic005G051700 Sobic005G051700 Sobic001G328900--Sobic005G051700 Sobic005G116000 Sobic005G116000 Sobic001G328900--Sobic005G116000 Sobic001G328900--Sobic006G064700 Sobic010G109700--Sobic005G056100 Sobic010G109700--Sobic001G096500 Sobic010G109700--Sobic001G249233 Sobic010G109700--Sobic008G081000 Sobic010G109700--Sobic005G102451 Sobic010G109700--Sobic006G062700 Sobic005G174900 Sobic005G174900 Sobic010G109700--Sobic005G174900 Sobic010G109700--Sobic007G025300 Sobic010G109700--Sobic008G088450 Sobic001G096500--Sobic007G205200 Sobic001G096500--Sobic005G056100 Sobic001G096500--Sobic010G109700 Sobic005G153600 Sobic005G153600 Sobic001G096500--Sobic005G153600 Sobic001G096500--Sobic005G102451 Sobic001G096500--Sobic002G345400 Sobic001G096500--Sobic001G249233 Sobic010G148600 Sobic010G148600 Sobic001G096500--Sobic010G148600 Sobic001G096500--Sobic001G328900 Sobic007G205200--Sobic001G096500 Sobic007G205200--Sobic002G345400 Sobic007G205200--Sobic005G153600 Sobic007G205200--Sobic001G328900 Sobic007G205200--Sobic005G102451 Sobic007G205200--Sobic005G056100 Sobic007G205200--Sobic010G109700 Sobic007G205200--Sobic005G116000 Sobic010G219300 Sobic010G219300 Sobic007G205200--Sobic010G219300
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.