Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G207600.1
Synonym
Functional annotation OsFBD5 - F-box and FBD domain containing protein, expressed
UniProt C5XQ66
Pfam PF00646 PF08387
Panther DB PTHR32212 PTHR32212:SF114
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0005515; protein binding


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G26030 : F-box/RNI-like/FBD-like domains-containing protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g41290.1 : OsFBD5 - F-box and FBD domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a028608
Brachypodium KQK21695
Barley -
Wheat TraesCS3B02G501600
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G173800 DEFL12 - Defensin and Defensin-like DEFL family, expressed -
2 Sobic.003G321500 Homeobox domain containing protein, expressed -
3 Sobic.001G246400 MBTB43 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Meprin and TRAF Homology MATH domain, expressed K10523: speckle-type POZ protein
4 Sobic.010G085700 myb-like DNA-binding domain, SHAQKYF class family protein, expressed -
5 Sobic.009G090250 - -
6 Sobic.003G207100 expressed protein -
7 Sobic.009G040000 myb-like DNA-binding domain, SHAQKYF class family protein, expressed -
8 Sobic.008G081000 - -
9 Sobic.005G174500 - -
10 Sobic.003G303500 homeobox and START domains containing protein, putative, expressed K09338: homeobox-leucine zipper protein
11 Sobic.001G068200 - -
12 Sobic.002G089500 DEF8 - Defensin and Defensin-like DEFL family, expressed -
13 Sobic.005G102451 - -
14 Sobic.006G104800 dnaJ domain containing protein, expressed -
15 Sobic.002G007700 nodulin family protein, putative, expressed -
16 Sobic.006G117300 Os4bglu12 - beta-glucosidase, exo-beta-glucanase, expressed K01188: beta-glucosidase
17 Sobic.009G077250 - -
18 Sobic.006G064700 expressed protein -
19 Sobic.009G039100 myb-like DNA-binding domain, SHAQKYF class family protein, expressed -
20 Sobic.001G392900 - -


Gene co-expression network
sample Sobic003G207600 Sobic003G207600 Sobic005G173800 Sobic005G173800 Sobic003G207600--Sobic005G173800 Sobic003G321500 Sobic003G321500 Sobic003G207600--Sobic003G321500 Sobic001G246400 Sobic001G246400 Sobic003G207600--Sobic001G246400 Sobic010G085700 Sobic010G085700 Sobic003G207600--Sobic010G085700 Sobic009G090250 Sobic009G090250 Sobic003G207600--Sobic009G090250 Sobic003G207100 Sobic003G207100 Sobic003G207600--Sobic003G207100 Sobic009G040000 Sobic009G040000 Sobic003G207600--Sobic009G040000 Sobic008G081000 Sobic008G081000 Sobic003G207600--Sobic008G081000 Sobic005G174500 Sobic005G174500 Sobic003G207600--Sobic005G174500 Sobic005G173800--Sobic010G085700 Sobic005G173800--Sobic009G040000 Sobic001G253400 Sobic001G253400 Sobic005G173800--Sobic001G253400 Sobic005G173800--Sobic003G207600 Sobic006G051750 Sobic006G051750 Sobic005G173800--Sobic006G051750 Sobic001G158600 Sobic001G158600 Sobic005G173800--Sobic001G158600 Sobic006G104800 Sobic006G104800 Sobic005G173800--Sobic006G104800 Sobic001G068200 Sobic001G068200 Sobic005G173800--Sobic001G068200 Sobic004G261000 Sobic004G261000 Sobic005G173800--Sobic004G261000 Sobic003G321500--Sobic009G090250 Sobic006G117300 Sobic006G117300 Sobic003G321500--Sobic006G117300 Sobic007G040000 Sobic007G040000 Sobic003G321500--Sobic007G040000 Sobic003G321500--Sobic001G246400 Sobic001G270600 Sobic001G270600 Sobic003G321500--Sobic001G270600 Sobic003G321500--Sobic005G174500 Sobic003G321500--Sobic003G207600 Sobic006G064700 Sobic006G064700 Sobic003G321500--Sobic006G064700 Sobic005G173900 Sobic005G173900 Sobic003G321500--Sobic005G173900 Sobic001G246400--Sobic009G090250 Sobic001G246400--Sobic005G174500 Sobic001G246400--Sobic007G040000 Sobic001G246400--Sobic003G321500 Sobic001G246400--Sobic006G117300 Sobic001G246400--Sobic001G270600 Sobic001G246400--Sobic003G207600 Sobic001G246400--Sobic005G173900 Sobic002G007700 Sobic002G007700 Sobic001G246400--Sobic002G007700 Sobic010G085700--Sobic009G040000 Sobic010G085700--Sobic005G173800 Sobic010G085700--Sobic006G051750 Sobic010G085700--Sobic001G253400 Sobic010G085700--Sobic001G158600 Sobic010G085700--Sobic004G261000 Sobic010G085700--Sobic001G068200 Sobic004G099750 Sobic004G099750 Sobic010G085700--Sobic004G099750 Sobic010G085700--Sobic008G081000 Sobic009G090250--Sobic001G246400 Sobic009G090250--Sobic005G174500 Sobic009G090250--Sobic007G040000 Sobic009G090250--Sobic003G321500 Sobic009G090250--Sobic001G270600 Sobic009G090250--Sobic006G117300 Sobic009G090250--Sobic005G173900 Sobic009G090250--Sobic003G207600 Sobic009G090250--Sobic002G007700 Sobic003G207100--Sobic002G007700 Sobic003G091500 Sobic003G091500 Sobic003G207100--Sobic003G091500 Sobic008G184100 Sobic008G184100 Sobic003G207100--Sobic008G184100 Sobic002G089500 Sobic002G089500 Sobic003G207100--Sobic002G089500 Sobic001G233600 Sobic001G233600 Sobic003G207100--Sobic001G233600 Sobic004G171600 Sobic004G171600 Sobic003G207100--Sobic004G171600 Sobic005G077900 Sobic005G077900 Sobic003G207100--Sobic005G077900 Sobic003G207100--Sobic005G174500 Sobic008G088900 Sobic008G088900 Sobic003G207100--Sobic008G088900 Sobic009G040000--Sobic001G253400 Sobic009G040000--Sobic010G085700 Sobic009G040000--Sobic001G158600 Sobic009G040000--Sobic005G173800 Sobic002G409250 Sobic002G409250 Sobic009G040000--Sobic002G409250 Sobic003G091400 Sobic003G091400 Sobic009G040000--Sobic003G091400 Sobic006G015750 Sobic006G015750 Sobic009G040000--Sobic006G015750 Sobic002G078800 Sobic002G078800 Sobic009G040000--Sobic002G078800 Sobic005G193700 Sobic005G193700 Sobic009G040000--Sobic005G193700 Sobic005G056100 Sobic005G056100 Sobic008G081000--Sobic005G056100 Sobic010G109700 Sobic010G109700 Sobic008G081000--Sobic010G109700 Sobic005G102451 Sobic005G102451 Sobic008G081000--Sobic005G102451 Sobic010G200400 Sobic010G200400 Sobic008G081000--Sobic010G200400 Sobic002G089400 Sobic002G089400 Sobic008G081000--Sobic002G089400 Sobic008G088450 Sobic008G088450 Sobic008G081000--Sobic008G088450 Sobic007G025300 Sobic007G025300 Sobic008G081000--Sobic007G025300 Sobic007G205100 Sobic007G205100 Sobic008G081000--Sobic007G205100 Sobic008G081000--Sobic001G068200 Sobic005G174500--Sobic009G090250 Sobic005G174500--Sobic001G246400 Sobic005G174500--Sobic007G040000 Sobic005G174500--Sobic005G173900 Sobic005G174500--Sobic002G007700 Sobic005G174500--Sobic006G117300 Sobic005G174500--Sobic003G091500 Sobic005G174500--Sobic002G089500 Sobic005G174500--Sobic003G207100
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