Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G173800.1
Synonym
Functional annotation DEFL12 - Defensin and Defensin-like DEFL family, expressed
UniProt A0A1B6PT42
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
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Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.010G085700 myb-like DNA-binding domain, SHAQKYF class family protein, expressed -
2 Sobic.009G040000 myb-like DNA-binding domain, SHAQKYF class family protein, expressed -
3 Sobic.001G253400 AP2 domain containing protein, expressed -
4 Sobic.003G207600 OsFBD5 - F-box and FBD domain containing protein, expressed -
5 Sobic.006G051750 - -
6 Sobic.001G158600 MYB family transcription factor, putative, expressed -
7 Sobic.006G104800 dnaJ domain containing protein, expressed -
8 Sobic.001G068200 - -
9 Sobic.004G261000 expressed protein -
10 Sobic.004G099750 - -
11 Sobic.005G193700 - -
12 Sobic.009G077250 - -
13 Sobic.003G135000 major facilitator superfamily antiporter, putative, expressed -
14 Sobic.002G409250 - -
15 Sobic.008G081000 - -
16 Sobic.006G178400 monocopper oxidase, putative, expressed -
17 Sobic.001G175501 - -
18 Sobic.003G091400 seven in absentia protein family domain containing protein, expressed -
19 Sobic.001G392900 - -
20 Sobic.006G015750 - -


Gene co-expression network
sample Sobic005G173800 Sobic005G173800 Sobic010G085700 Sobic010G085700 Sobic005G173800--Sobic010G085700 Sobic009G040000 Sobic009G040000 Sobic005G173800--Sobic009G040000 Sobic001G253400 Sobic001G253400 Sobic005G173800--Sobic001G253400 Sobic003G207600 Sobic003G207600 Sobic005G173800--Sobic003G207600 Sobic006G051750 Sobic006G051750 Sobic005G173800--Sobic006G051750 Sobic001G158600 Sobic001G158600 Sobic005G173800--Sobic001G158600 Sobic006G104800 Sobic006G104800 Sobic005G173800--Sobic006G104800 Sobic001G068200 Sobic001G068200 Sobic005G173800--Sobic001G068200 Sobic004G261000 Sobic004G261000 Sobic005G173800--Sobic004G261000 Sobic010G085700--Sobic009G040000 Sobic010G085700--Sobic005G173800 Sobic010G085700--Sobic006G051750 Sobic010G085700--Sobic001G253400 Sobic010G085700--Sobic001G158600 Sobic010G085700--Sobic004G261000 Sobic010G085700--Sobic001G068200 Sobic004G099750 Sobic004G099750 Sobic010G085700--Sobic004G099750 Sobic008G081000 Sobic008G081000 Sobic010G085700--Sobic008G081000 Sobic009G040000--Sobic001G253400 Sobic009G040000--Sobic010G085700 Sobic009G040000--Sobic001G158600 Sobic009G040000--Sobic005G173800 Sobic002G409250 Sobic002G409250 Sobic009G040000--Sobic002G409250 Sobic003G091400 Sobic003G091400 Sobic009G040000--Sobic003G091400 Sobic006G015750 Sobic006G015750 Sobic009G040000--Sobic006G015750 Sobic002G078800 Sobic002G078800 Sobic009G040000--Sobic002G078800 Sobic005G193700 Sobic005G193700 Sobic009G040000--Sobic005G193700 Sobic001G253400--Sobic001G158600 Sobic001G253400--Sobic005G193700 Sobic001G253400--Sobic006G051750 Sobic001G253400--Sobic009G040000 Sobic001G253400--Sobic002G409250 Sobic001G253400--Sobic003G091400 Sobic001G253400--Sobic006G015750 Sobic001G253400--Sobic004G261000 Sobic003G135000 Sobic003G135000 Sobic001G253400--Sobic003G135000 Sobic003G207600--Sobic005G173800 Sobic003G321500 Sobic003G321500 Sobic003G207600--Sobic003G321500 Sobic001G246400 Sobic001G246400 Sobic003G207600--Sobic001G246400 Sobic003G207600--Sobic010G085700 Sobic009G090250 Sobic009G090250 Sobic003G207600--Sobic009G090250 Sobic003G207100 Sobic003G207100 Sobic003G207600--Sobic003G207100 Sobic003G207600--Sobic009G040000 Sobic003G207600--Sobic008G081000 Sobic005G174500 Sobic005G174500 Sobic003G207600--Sobic005G174500 Sobic006G051750--Sobic004G261000 Sobic005G153200 Sobic005G153200 Sobic006G051750--Sobic005G153200 Sobic001G259250 Sobic001G259250 Sobic006G051750--Sobic001G259250 Sobic006G051750--Sobic001G158600 Sobic004G142000 Sobic004G142000 Sobic006G051750--Sobic004G142000 Sobic006G051750--Sobic001G253400 Sobic006G051750--Sobic005G193700 Sobic006G051750--Sobic004G099750 Sobic010G200200 Sobic010G200200 Sobic006G051750--Sobic010G200200 Sobic001G158600--Sobic001G253400 Sobic001G158600--Sobic005G193700 Sobic001G158600--Sobic006G051750 Sobic001G158600--Sobic004G261000 Sobic001G158600--Sobic003G135000 Sobic001G158600--Sobic004G099750 Sobic007G034900 Sobic007G034900 Sobic001G158600--Sobic007G034900 Sobic001G158600--Sobic002G409250 Sobic001G158600--Sobic005G153200 Sobic006G104800--Sobic003G135000 Sobic006G080500 Sobic006G080500 Sobic006G104800--Sobic006G080500 Sobic002G381600 Sobic002G381600 Sobic006G104800--Sobic002G381600 Sobic001G142600 Sobic001G142600 Sobic006G104800--Sobic001G142600 Sobic005G056300 Sobic005G056300 Sobic006G104800--Sobic005G056300 Sobic001G392900 Sobic001G392900 Sobic006G104800--Sobic001G392900 Sobic002G053100 Sobic002G053100 Sobic006G104800--Sobic002G053100 Sobic006G104800--Sobic001G158600 Sobic001G129900 Sobic001G129900 Sobic006G104800--Sobic001G129900 Sobic001G068200--Sobic006G051750 Sobic001G068200--Sobic010G085700 Sobic001G068200--Sobic004G261000 Sobic010G200400 Sobic010G200400 Sobic001G068200--Sobic010G200400 Sobic007G205100 Sobic007G205100 Sobic001G068200--Sobic007G205100 Sobic001G068200--Sobic008G081000 Sobic002G338600 Sobic002G338600 Sobic001G068200--Sobic002G338600 Sobic001G068200--Sobic001G259250 Sobic001G068200--Sobic005G153200 Sobic004G261000--Sobic006G051750 Sobic004G261000--Sobic005G153200 Sobic004G261000--Sobic001G259250 Sobic004G261000--Sobic001G158600 Sobic004G261000--Sobic007G034900 Sobic004G261000--Sobic004G142000 Sobic009G116500 Sobic009G116500 Sobic004G261000--Sobic009G116500 Sobic004G261000--Sobic010G200200 Sobic008G081700 Sobic008G081700 Sobic004G261000--Sobic008G081700
Octagon: transcription factors


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