Gene annotation
Transcriptome id Sobic.010G085700.2
Synonym Sb10g007420
Functional annotation myb-like DNA-binding domain, SHAQKYF class family protein, expressed
UniProt A0A1W0VS01
Pfam PF00249
Panther DB PTHR12374 PTHR12374:SF26
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G38090 : Duplicated homeodomain-like superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os06g07650.1 : myb-like DNA-binding domain, SHAQKYF class family protein, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.009G040000 myb-like DNA-binding domain, SHAQKYF class family protein, expressed -
2 Sobic.005G173800 DEFL12 - Defensin and Defensin-like DEFL family, expressed -
3 Sobic.006G051750 - -
4 Sobic.001G253400 AP2 domain containing protein, expressed -
5 Sobic.001G158600 MYB family transcription factor, putative, expressed -
6 Sobic.004G261000 expressed protein -
7 Sobic.001G068200 - -
8 Sobic.004G099750 - -
9 Sobic.008G081000 - -
10 Sobic.005G193700 - -
11 Sobic.005G153200 - -
12 Sobic.001G259250 - -
13 Sobic.008G039700 expressed protein -
14 Sobic.004G142000 - -
15 Sobic.006G104800 dnaJ domain containing protein, expressed -
16 Sobic.010G200400 AP2 domain containing protein, expressed -
17 Sobic.007G034900 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence./late senescence marker during developmental senescence(PubMedID : 27586543)@cytochrome P450, putative, expressed -
18 Sobic.003G135000 major facilitator superfamily antiporter, putative, expressed -
19 Sobic.010G227400 glycosyl hydrolase, family 31, putative, expressed K01187: alpha-glucosidase
20 Sobic.001G175501 - -


Gene co-expression network
sample Sobic010G085700 Sobic010G085700 Sobic009G040000 Sobic009G040000 Sobic010G085700--Sobic009G040000 Sobic005G173800 Sobic005G173800 Sobic010G085700--Sobic005G173800 Sobic006G051750 Sobic006G051750 Sobic010G085700--Sobic006G051750 Sobic001G253400 Sobic001G253400 Sobic010G085700--Sobic001G253400 Sobic001G158600 Sobic001G158600 Sobic010G085700--Sobic001G158600 Sobic004G261000 Sobic004G261000 Sobic010G085700--Sobic004G261000 Sobic001G068200 Sobic001G068200 Sobic010G085700--Sobic001G068200 Sobic004G099750 Sobic004G099750 Sobic010G085700--Sobic004G099750 Sobic008G081000 Sobic008G081000 Sobic010G085700--Sobic008G081000 Sobic009G040000--Sobic001G253400 Sobic009G040000--Sobic010G085700 Sobic009G040000--Sobic001G158600 Sobic009G040000--Sobic005G173800 Sobic002G409250 Sobic002G409250 Sobic009G040000--Sobic002G409250 Sobic003G091400 Sobic003G091400 Sobic009G040000--Sobic003G091400 Sobic006G015750 Sobic006G015750 Sobic009G040000--Sobic006G015750 Sobic002G078800 Sobic002G078800 Sobic009G040000--Sobic002G078800 Sobic005G193700 Sobic005G193700 Sobic009G040000--Sobic005G193700 Sobic005G173800--Sobic010G085700 Sobic005G173800--Sobic009G040000 Sobic005G173800--Sobic001G253400 Sobic003G207600 Sobic003G207600 Sobic005G173800--Sobic003G207600 Sobic005G173800--Sobic006G051750 Sobic005G173800--Sobic001G158600 Sobic006G104800 Sobic006G104800 Sobic005G173800--Sobic006G104800 Sobic005G173800--Sobic001G068200 Sobic005G173800--Sobic004G261000 Sobic006G051750--Sobic004G261000 Sobic005G153200 Sobic005G153200 Sobic006G051750--Sobic005G153200 Sobic001G259250 Sobic001G259250 Sobic006G051750--Sobic001G259250 Sobic006G051750--Sobic001G158600 Sobic004G142000 Sobic004G142000 Sobic006G051750--Sobic004G142000 Sobic006G051750--Sobic001G253400 Sobic006G051750--Sobic005G193700 Sobic006G051750--Sobic004G099750 Sobic010G200200 Sobic010G200200 Sobic006G051750--Sobic010G200200 Sobic001G253400--Sobic001G158600 Sobic001G253400--Sobic005G193700 Sobic001G253400--Sobic006G051750 Sobic001G253400--Sobic009G040000 Sobic001G253400--Sobic002G409250 Sobic001G253400--Sobic003G091400 Sobic001G253400--Sobic006G015750 Sobic001G253400--Sobic004G261000 Sobic003G135000 Sobic003G135000 Sobic001G253400--Sobic003G135000 Sobic001G158600--Sobic001G253400 Sobic001G158600--Sobic005G193700 Sobic001G158600--Sobic006G051750 Sobic001G158600--Sobic004G261000 Sobic001G158600--Sobic003G135000 Sobic001G158600--Sobic004G099750 Sobic007G034900 Sobic007G034900 Sobic001G158600--Sobic007G034900 Sobic001G158600--Sobic002G409250 Sobic001G158600--Sobic005G153200 Sobic004G261000--Sobic006G051750 Sobic004G261000--Sobic005G153200 Sobic004G261000--Sobic001G259250 Sobic004G261000--Sobic001G158600 Sobic004G261000--Sobic007G034900 Sobic004G261000--Sobic004G142000 Sobic009G116500 Sobic009G116500 Sobic004G261000--Sobic009G116500 Sobic004G261000--Sobic010G200200 Sobic008G081700 Sobic008G081700 Sobic004G261000--Sobic008G081700 Sobic001G068200--Sobic006G051750 Sobic001G068200--Sobic010G085700 Sobic001G068200--Sobic004G261000 Sobic010G200400 Sobic010G200400 Sobic001G068200--Sobic010G200400 Sobic007G205100 Sobic007G205100 Sobic001G068200--Sobic007G205100 Sobic001G068200--Sobic008G081000 Sobic002G338600 Sobic002G338600 Sobic001G068200--Sobic002G338600 Sobic001G068200--Sobic001G259250 Sobic001G068200--Sobic005G153200 Sobic004G099750--Sobic006G051750 Sobic001G175501 Sobic001G175501 Sobic004G099750--Sobic001G175501 Sobic004G099750--Sobic001G158600 Sobic004G099750--Sobic001G253400 Sobic004G099750--Sobic004G261000 Sobic004G099750--Sobic005G193700 Sobic004G099750--Sobic005G153200 Sobic004G099750--Sobic001G259250 Sobic004G099750--Sobic004G142000 Sobic005G056100 Sobic005G056100 Sobic008G081000--Sobic005G056100 Sobic010G109700 Sobic010G109700 Sobic008G081000--Sobic010G109700 Sobic005G102451 Sobic005G102451 Sobic008G081000--Sobic005G102451 Sobic008G081000--Sobic010G200400 Sobic002G089400 Sobic002G089400 Sobic008G081000--Sobic002G089400 Sobic008G088450 Sobic008G088450 Sobic008G081000--Sobic008G088450 Sobic007G025300 Sobic007G025300 Sobic008G081000--Sobic007G025300 Sobic008G081000--Sobic007G205100 Sobic008G081000--Sobic001G068200
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.