Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G039700.2
Synonym Sb08g003420
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1Z5R4U1
Pfam -
Panther DB PTHR32212 PTHR32212:SF106
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G56690 : FBD, F-box and Leucine Rich Repeat domains containing protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g51720.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a053910
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.006G051750 - -
2 Sobic.010G085700 myb-like DNA-binding domain, SHAQKYF class family protein, expressed -
3 Sobic.001G068200 - -
4 Sobic.004G261000 expressed protein -
5 Sobic.004G099750 - -
6 Sobic.001G158600 MYB family transcription factor, putative, expressed -
7 Sobic.001G253400 AP2 domain containing protein, expressed -
8 Sobic.010G200400 AP2 domain containing protein, expressed -
9 Sobic.005G153200 - -
10 Sobic.001G259250 - -
11 Sobic.004G142000 - -
12 Sobic.010G227400 glycosyl hydrolase, family 31, putative, expressed K01187: alpha-glucosidase
13 Sobic.007G205100 AP2 domain containing protein, expressed -
14 Sobic.008G081700 - -
15 Sobic.002G338600 expressed protein -
16 Sobic.010G200200 AP2 domain containing protein, expressed -
17 Sobic.008G081000 - -
18 Sobic.009G116500 esterase, putative, expressed -
19 Sobic.009G040000 myb-like DNA-binding domain, SHAQKYF class family protein, expressed -
20 Sobic.005G193700 - -


Gene co-expression network
sample Sobic008G039700 Sobic008G039700 Sobic006G051750 Sobic006G051750 Sobic008G039700--Sobic006G051750 Sobic010G085700 Sobic010G085700 Sobic008G039700--Sobic010G085700 Sobic001G068200 Sobic001G068200 Sobic008G039700--Sobic001G068200 Sobic004G261000 Sobic004G261000 Sobic008G039700--Sobic004G261000 Sobic004G099750 Sobic004G099750 Sobic008G039700--Sobic004G099750 Sobic001G158600 Sobic001G158600 Sobic008G039700--Sobic001G158600 Sobic001G253400 Sobic001G253400 Sobic008G039700--Sobic001G253400 Sobic010G200400 Sobic010G200400 Sobic008G039700--Sobic010G200400 Sobic005G153200 Sobic005G153200 Sobic008G039700--Sobic005G153200 Sobic006G051750--Sobic004G261000 Sobic006G051750--Sobic005G153200 Sobic001G259250 Sobic001G259250 Sobic006G051750--Sobic001G259250 Sobic006G051750--Sobic001G158600 Sobic004G142000 Sobic004G142000 Sobic006G051750--Sobic004G142000 Sobic006G051750--Sobic001G253400 Sobic005G193700 Sobic005G193700 Sobic006G051750--Sobic005G193700 Sobic006G051750--Sobic004G099750 Sobic010G200200 Sobic010G200200 Sobic006G051750--Sobic010G200200 Sobic009G040000 Sobic009G040000 Sobic010G085700--Sobic009G040000 Sobic005G173800 Sobic005G173800 Sobic010G085700--Sobic005G173800 Sobic010G085700--Sobic006G051750 Sobic010G085700--Sobic001G253400 Sobic010G085700--Sobic001G158600 Sobic010G085700--Sobic004G261000 Sobic010G085700--Sobic001G068200 Sobic010G085700--Sobic004G099750 Sobic008G081000 Sobic008G081000 Sobic010G085700--Sobic008G081000 Sobic001G068200--Sobic006G051750 Sobic001G068200--Sobic010G085700 Sobic001G068200--Sobic004G261000 Sobic001G068200--Sobic010G200400 Sobic007G205100 Sobic007G205100 Sobic001G068200--Sobic007G205100 Sobic001G068200--Sobic008G081000 Sobic002G338600 Sobic002G338600 Sobic001G068200--Sobic002G338600 Sobic001G068200--Sobic001G259250 Sobic001G068200--Sobic005G153200 Sobic004G261000--Sobic006G051750 Sobic004G261000--Sobic005G153200 Sobic004G261000--Sobic001G259250 Sobic004G261000--Sobic001G158600 Sobic007G034900 Sobic007G034900 Sobic004G261000--Sobic007G034900 Sobic004G261000--Sobic004G142000 Sobic009G116500 Sobic009G116500 Sobic004G261000--Sobic009G116500 Sobic004G261000--Sobic010G200200 Sobic008G081700 Sobic008G081700 Sobic004G261000--Sobic008G081700 Sobic004G099750--Sobic006G051750 Sobic001G175501 Sobic001G175501 Sobic004G099750--Sobic001G175501 Sobic004G099750--Sobic001G158600 Sobic004G099750--Sobic001G253400 Sobic004G099750--Sobic004G261000 Sobic004G099750--Sobic005G193700 Sobic004G099750--Sobic005G153200 Sobic004G099750--Sobic001G259250 Sobic004G099750--Sobic004G142000 Sobic001G158600--Sobic001G253400 Sobic001G158600--Sobic005G193700 Sobic001G158600--Sobic006G051750 Sobic001G158600--Sobic004G261000 Sobic003G135000 Sobic003G135000 Sobic001G158600--Sobic003G135000 Sobic001G158600--Sobic004G099750 Sobic001G158600--Sobic007G034900 Sobic002G409250 Sobic002G409250 Sobic001G158600--Sobic002G409250 Sobic001G158600--Sobic005G153200 Sobic001G253400--Sobic001G158600 Sobic001G253400--Sobic005G193700 Sobic001G253400--Sobic006G051750 Sobic001G253400--Sobic009G040000 Sobic001G253400--Sobic002G409250 Sobic003G091400 Sobic003G091400 Sobic001G253400--Sobic003G091400 Sobic006G015750 Sobic006G015750 Sobic001G253400--Sobic006G015750 Sobic001G253400--Sobic004G261000 Sobic001G253400--Sobic003G135000 Sobic010G200400--Sobic007G205100 Sobic002G089400 Sobic002G089400 Sobic010G200400--Sobic002G089400 Sobic010G200400--Sobic002G338600 Sobic002G028100 Sobic002G028100 Sobic010G200400--Sobic002G028100 Sobic007G025300 Sobic007G025300 Sobic010G200400--Sobic007G025300 Sobic010G200400--Sobic008G081700 Sobic010G200400--Sobic010G200200 Sobic002G367600 Sobic002G367600 Sobic010G200400--Sobic002G367600 Sobic010G200400--Sobic009G116500 Sobic005G153200--Sobic001G259250 Sobic005G153200--Sobic004G142000 Sobic005G153200--Sobic010G200200 Sobic005G153200--Sobic006G051750 Sobic005G153200--Sobic002G338600 Sobic005G153200--Sobic004G261000 Sobic005G153200--Sobic008G081700 Sobic005G153200--Sobic007G205100 Sobic005G153200--Sobic007G034900
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.