Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G198700.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6PTP0
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.008G081000 - -
2 Sobic.005G102451 - -
3 Sobic.005G056100 - -
4 Sobic.010G109700 myb-like DNA-binding domain, SHAQKYF class family protein, expressed -
5 Sobic.003G303500 homeobox and START domains containing protein, putative, expressed K09338: homeobox-leucine zipper protein
6 Sobic.002G345400 DEF1 - Defensin and Defensin-like DEFL family, expressed -
7 Sobic.001G096500 phosphoesterase, putative, expressed K08073: bifunctional polynucleotide phosphatase/kinase
8 Sobic.008G088450 - -
9 Sobic.010G200400 AP2 domain containing protein, expressed -
10 Sobic.007G205200 Not investigated(PubMedID : 23766026)@AP2 domain containing protein, expressed -
11 Sobic.010G085700 myb-like DNA-binding domain, SHAQKYF class family protein, expressed -
12 Sobic.007G025300 helix-loop-helix DNA-binding domain containing protein, expressed -
13 Sobic.001G068200 - -
14 Sobic.002G089400 DEF8 - Defensin and Defensin-like DEFL family, expressed -
15 Sobic.001G249233 - -
16 Sobic.009G039100 myb-like DNA-binding domain, SHAQKYF class family protein, expressed -
17 Sobic.007G205100 AP2 domain containing protein, expressed -
18 Sobic.010G227400 glycosyl hydrolase, family 31, putative, expressed K01187: alpha-glucosidase
19 Sobic.001G328900 expressed protein -
20 Sobic.006G062700 transferase family protein, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic005G198700 Sobic005G198700 Sobic008G081000 Sobic008G081000 Sobic005G198700--Sobic008G081000 Sobic005G102451 Sobic005G102451 Sobic005G198700--Sobic005G102451 Sobic005G056100 Sobic005G056100 Sobic005G198700--Sobic005G056100 Sobic010G109700 Sobic010G109700 Sobic005G198700--Sobic010G109700 Sobic003G303500 Sobic003G303500 Sobic005G198700--Sobic003G303500 Sobic002G345400 Sobic002G345400 Sobic005G198700--Sobic002G345400 Sobic001G096500 Sobic001G096500 Sobic005G198700--Sobic001G096500 Sobic008G088450 Sobic008G088450 Sobic005G198700--Sobic008G088450 Sobic010G200400 Sobic010G200400 Sobic005G198700--Sobic010G200400 Sobic008G081000--Sobic005G056100 Sobic008G081000--Sobic010G109700 Sobic008G081000--Sobic005G102451 Sobic008G081000--Sobic010G200400 Sobic002G089400 Sobic002G089400 Sobic008G081000--Sobic002G089400 Sobic008G081000--Sobic008G088450 Sobic007G025300 Sobic007G025300 Sobic008G081000--Sobic007G025300 Sobic007G205100 Sobic007G205100 Sobic008G081000--Sobic007G205100 Sobic001G068200 Sobic001G068200 Sobic008G081000--Sobic001G068200 Sobic005G102451--Sobic002G345400 Sobic005G102451--Sobic005G056100 Sobic005G102451--Sobic001G096500 Sobic005G102451--Sobic010G109700 Sobic005G102451--Sobic003G303500 Sobic007G205200 Sobic007G205200 Sobic005G102451--Sobic007G205200 Sobic005G102451--Sobic008G081000 Sobic001G328900 Sobic001G328900 Sobic005G102451--Sobic001G328900 Sobic009G039100 Sobic009G039100 Sobic005G102451--Sobic009G039100 Sobic005G056100--Sobic010G109700 Sobic005G056100--Sobic001G096500 Sobic005G056100--Sobic008G081000 Sobic005G056100--Sobic005G102451 Sobic001G249233 Sobic001G249233 Sobic005G056100--Sobic001G249233 Sobic005G056100--Sobic007G205200 Sobic006G062700 Sobic006G062700 Sobic005G056100--Sobic006G062700 Sobic005G056100--Sobic002G345400 Sobic005G056100--Sobic008G088450 Sobic010G109700--Sobic005G056100 Sobic010G109700--Sobic001G096500 Sobic010G109700--Sobic001G249233 Sobic010G109700--Sobic008G081000 Sobic010G109700--Sobic005G102451 Sobic010G109700--Sobic006G062700 Sobic005G174900 Sobic005G174900 Sobic010G109700--Sobic005G174900 Sobic010G109700--Sobic007G025300 Sobic010G109700--Sobic008G088450 Sobic003G303500--Sobic005G102451 Sobic003G303500--Sobic002G345400 Sobic003G303500--Sobic008G081000 Sobic003G303500--Sobic009G039100 Sobic003G303500--Sobic005G056100 Sobic003G303500--Sobic001G328900 Sobic003G303500--Sobic010G109700 Sobic003G303500--Sobic001G096500 Sobic003G303500--Sobic007G205200 Sobic002G345400--Sobic005G102451 Sobic002G345400--Sobic001G328900 Sobic002G345400--Sobic007G205200 Sobic002G345400--Sobic001G096500 Sobic002G345400--Sobic009G039100 Sobic002G345400--Sobic003G303500 Sobic002G345400--Sobic005G056100 Sobic002G345400--Sobic010G109700 Sobic005G153400 Sobic005G153400 Sobic002G345400--Sobic005G153400 Sobic001G096500--Sobic007G205200 Sobic001G096500--Sobic005G056100 Sobic001G096500--Sobic010G109700 Sobic005G153600 Sobic005G153600 Sobic001G096500--Sobic005G153600 Sobic001G096500--Sobic005G102451 Sobic001G096500--Sobic002G345400 Sobic001G096500--Sobic001G249233 Sobic010G148600 Sobic010G148600 Sobic001G096500--Sobic010G148600 Sobic001G096500--Sobic001G328900 Sobic009G007500 Sobic009G007500 Sobic008G088450--Sobic009G007500 Sobic008G088450--Sobic006G062700 Sobic008G088450--Sobic010G109700 Sobic008G088450--Sobic005G056100 Sobic008G088450--Sobic007G025300 Sobic008G088450--Sobic008G081000 Sobic008G088450--Sobic001G249233 Sobic008G103066 Sobic008G103066 Sobic008G088450--Sobic008G103066 Sobic008G088450--Sobic010G200400 Sobic010G200400--Sobic007G205100 Sobic010G200400--Sobic002G089400 Sobic002G338600 Sobic002G338600 Sobic010G200400--Sobic002G338600 Sobic002G028100 Sobic002G028100 Sobic010G200400--Sobic002G028100 Sobic010G200400--Sobic007G025300 Sobic008G081700 Sobic008G081700 Sobic010G200400--Sobic008G081700 Sobic010G200200 Sobic010G200200 Sobic010G200400--Sobic010G200200 Sobic002G367600 Sobic002G367600 Sobic010G200400--Sobic002G367600 Sobic009G116500 Sobic009G116500 Sobic010G200400--Sobic009G116500
Octagon: transcription factors


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