Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G328900.1
Synonym
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1Z5S8U0
Pfam PF04043
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0004857; enzyme inhibitor activity


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os08g25070.1 : PME/invertase inhibitor, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G345400 DEF1 - Defensin and Defensin-like DEFL family, expressed -
2 Sobic.007G205200 Not investigated(PubMedID : 23766026)@AP2 domain containing protein, expressed -
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4 Sobic.009G039100 myb-like DNA-binding domain, SHAQKYF class family protein, expressed -
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7 Sobic.005G051700 - -
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13 Sobic.005G153600 DEF1 - Defensin and Defensin-like DEFL family, expressed -
14 Sobic.005G056100 - -
15 Sobic.010G109700 myb-like DNA-binding domain, SHAQKYF class family protein, expressed -
16 Sobic.010G219300 DEFL27 - Defensin and Defensin-like DEFL family -
17 Sobic.005G074800 LTPL33 - Protease inhibitor/seed storage/LTP family protein precursor, expressed -
18 Sobic.008G081000 - -
19 Sobic.003G024700 peroxidase precursor, putative, expressed K00430: peroxidase
20 Sobic.005G148600 - -


Gene co-expression network
sample Sobic001G328900 Sobic001G328900 Sobic002G345400 Sobic002G345400 Sobic001G328900--Sobic002G345400 Sobic007G205200 Sobic007G205200 Sobic001G328900--Sobic007G205200 Sobic005G153400 Sobic005G153400 Sobic001G328900--Sobic005G153400 Sobic009G039100 Sobic009G039100 Sobic001G328900--Sobic009G039100 Sobic005G102451 Sobic005G102451 Sobic001G328900--Sobic005G102451 Sobic001G096500 Sobic001G096500 Sobic001G328900--Sobic001G096500 Sobic005G051700 Sobic005G051700 Sobic001G328900--Sobic005G051700 Sobic005G116000 Sobic005G116000 Sobic001G328900--Sobic005G116000 Sobic006G064700 Sobic006G064700 Sobic001G328900--Sobic006G064700 Sobic002G345400--Sobic005G102451 Sobic002G345400--Sobic001G328900 Sobic002G345400--Sobic007G205200 Sobic002G345400--Sobic001G096500 Sobic002G345400--Sobic009G039100 Sobic003G303500 Sobic003G303500 Sobic002G345400--Sobic003G303500 Sobic005G056100 Sobic005G056100 Sobic002G345400--Sobic005G056100 Sobic010G109700 Sobic010G109700 Sobic002G345400--Sobic010G109700 Sobic002G345400--Sobic005G153400 Sobic007G205200--Sobic001G096500 Sobic007G205200--Sobic002G345400 Sobic005G153600 Sobic005G153600 Sobic007G205200--Sobic005G153600 Sobic007G205200--Sobic001G328900 Sobic007G205200--Sobic005G102451 Sobic007G205200--Sobic005G056100 Sobic007G205200--Sobic010G109700 Sobic007G205200--Sobic005G116000 Sobic010G219300 Sobic010G219300 Sobic007G205200--Sobic010G219300 Sobic005G153400--Sobic005G051700 Sobic005G153400--Sobic001G328900 Sobic005G153400--Sobic005G116000 Sobic009G039900 Sobic009G039900 Sobic005G153400--Sobic009G039900 Sobic010G195600 Sobic010G195600 Sobic005G153400--Sobic010G195600 Sobic005G153400--Sobic002G345400 Sobic005G153400--Sobic007G205200 Sobic005G153400--Sobic009G039100 Sobic005G153400--Sobic005G153600 Sobic009G039100--Sobic006G064700 Sobic009G039100--Sobic002G345400 Sobic009G039100--Sobic001G328900 Sobic009G039100--Sobic005G102451 Sobic009G039100--Sobic009G039900 Sobic009G039100--Sobic003G303500 Sobic009G039100--Sobic005G153400 Sobic009G039100--Sobic010G195600 Sobic009G039100--Sobic007G205200 Sobic005G102451--Sobic002G345400 Sobic005G102451--Sobic005G056100 Sobic005G102451--Sobic001G096500 Sobic005G102451--Sobic010G109700 Sobic005G102451--Sobic003G303500 Sobic005G102451--Sobic007G205200 Sobic008G081000 Sobic008G081000 Sobic005G102451--Sobic008G081000 Sobic005G102451--Sobic001G328900 Sobic005G102451--Sobic009G039100 Sobic001G096500--Sobic007G205200 Sobic001G096500--Sobic005G056100 Sobic001G096500--Sobic010G109700 Sobic001G096500--Sobic005G153600 Sobic001G096500--Sobic005G102451 Sobic001G096500--Sobic002G345400 Sobic001G249233 Sobic001G249233 Sobic001G096500--Sobic001G249233 Sobic010G148600 Sobic010G148600 Sobic001G096500--Sobic010G148600 Sobic001G096500--Sobic001G328900 Sobic005G051700--Sobic005G116000 Sobic005G051700--Sobic010G195600 Sobic005G051700--Sobic005G153400 Sobic005G051700--Sobic001G328900 Sobic009G040100 Sobic009G040100 Sobic005G051700--Sobic009G040100 Sobic005G051700--Sobic007G205200 Sobic005G051700--Sobic002G345400 Sobic005G051700--Sobic005G153600 Sobic005G051700--Sobic009G039100 Sobic005G116000--Sobic005G051700 Sobic005G116000--Sobic005G153400 Sobic005G116000--Sobic007G205200 Sobic005G116000--Sobic009G040100 Sobic005G116000--Sobic001G328900 Sobic005G116000--Sobic005G153600 Sobic005G116000--Sobic010G195600 Sobic005G116000--Sobic001G096500 Sobic005G116000--Sobic002G345400 Sobic006G064700--Sobic009G039100 Sobic006G064700--Sobic009G039900 Sobic006G064700--Sobic002G345400 Sobic006G064700--Sobic001G328900 Sobic006G064700--Sobic005G102451 Sobic006G064700--Sobic003G303500 Sobic006G064700--Sobic005G153400 Sobic005G148600 Sobic005G148600 Sobic006G064700--Sobic005G148600 Sobic006G064700--Sobic010G195600
Octagon: transcription factors


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