Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G051700.1
Synonym Sb05g004190
Functional annotation -
UniProt C5Y5K4
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
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Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G116000 LTPL33 - Protease inhibitor/seed storage/LTP family protein precursor, expressed -
2 Sobic.010G195600 reductase, putative, expressed -
3 Sobic.005G153400 - -
4 Sobic.001G328900 expressed protein -
5 Sobic.009G040100 myb-like DNA-binding domain, SHAQKYF class family protein, expressed -
6 Sobic.007G205200 Not investigated(PubMedID : 23766026)@AP2 domain containing protein, expressed -
7 Sobic.002G345400 DEF1 - Defensin and Defensin-like DEFL family, expressed -
8 Sobic.005G153600 DEF1 - Defensin and Defensin-like DEFL family, expressed -
9 Sobic.009G039100 myb-like DNA-binding domain, SHAQKYF class family protein, expressed -
10 Sobic.009G039900 myb-like DNA-binding domain, SHAQKYF class family protein, expressed -
11 Sobic.001G096500 phosphoesterase, putative, expressed K08073: bifunctional polynucleotide phosphatase/kinase
12 Sobic.005G102451 - -
13 Sobic.003G438300 - -
14 Sobic.006G064700 expressed protein -
15 Sobic.010G219300 DEFL27 - Defensin and Defensin-like DEFL family -
16 Sobic.003G303500 homeobox and START domains containing protein, putative, expressed K09338: homeobox-leucine zipper protein
17 Sobic.005G225000 - -
18 Sobic.005G056100 - -
19 Sobic.010G109700 myb-like DNA-binding domain, SHAQKYF class family protein, expressed -
20 Sobic.005G199101 - K12581: CNOT7_8, CAF1, CCR4-NOT transcription complex subunit 7/8


Gene co-expression network
sample Sobic005G051700 Sobic005G051700 Sobic005G116000 Sobic005G116000 Sobic005G051700--Sobic005G116000 Sobic010G195600 Sobic010G195600 Sobic005G051700--Sobic010G195600 Sobic005G153400 Sobic005G153400 Sobic005G051700--Sobic005G153400 Sobic001G328900 Sobic001G328900 Sobic005G051700--Sobic001G328900 Sobic009G040100 Sobic009G040100 Sobic005G051700--Sobic009G040100 Sobic007G205200 Sobic007G205200 Sobic005G051700--Sobic007G205200 Sobic002G345400 Sobic002G345400 Sobic005G051700--Sobic002G345400 Sobic005G153600 Sobic005G153600 Sobic005G051700--Sobic005G153600 Sobic009G039100 Sobic009G039100 Sobic005G051700--Sobic009G039100 Sobic005G116000--Sobic005G051700 Sobic005G116000--Sobic005G153400 Sobic005G116000--Sobic007G205200 Sobic005G116000--Sobic009G040100 Sobic005G116000--Sobic001G328900 Sobic005G116000--Sobic005G153600 Sobic005G116000--Sobic010G195600 Sobic001G096500 Sobic001G096500 Sobic005G116000--Sobic001G096500 Sobic005G116000--Sobic002G345400 Sobic010G195600--Sobic005G051700 Sobic010G195600--Sobic005G153400 Sobic010G195600--Sobic005G116000 Sobic010G195600--Sobic001G328900 Sobic010G195600--Sobic009G039100 Sobic003G438300 Sobic003G438300 Sobic010G195600--Sobic003G438300 Sobic009G039900 Sobic009G039900 Sobic010G195600--Sobic009G039900 Sobic006G064700 Sobic006G064700 Sobic010G195600--Sobic006G064700 Sobic010G195600--Sobic002G345400 Sobic005G153400--Sobic005G051700 Sobic005G153400--Sobic001G328900 Sobic005G153400--Sobic005G116000 Sobic005G153400--Sobic009G039900 Sobic005G153400--Sobic010G195600 Sobic005G153400--Sobic002G345400 Sobic005G153400--Sobic007G205200 Sobic005G153400--Sobic009G039100 Sobic005G153400--Sobic005G153600 Sobic001G328900--Sobic002G345400 Sobic001G328900--Sobic007G205200 Sobic001G328900--Sobic005G153400 Sobic001G328900--Sobic009G039100 Sobic005G102451 Sobic005G102451 Sobic001G328900--Sobic005G102451 Sobic001G328900--Sobic001G096500 Sobic001G328900--Sobic005G051700 Sobic001G328900--Sobic005G116000 Sobic001G328900--Sobic006G064700 Sobic009G040100--Sobic005G116000 Sobic009G040100--Sobic005G051700 Sobic009G040100--Sobic005G153400 Sobic009G040100--Sobic010G195600 Sobic009G040100--Sobic005G153600 Sobic009G040100--Sobic001G328900 Sobic009G040100--Sobic007G205200 Sobic009G040100--Sobic003G438300 Sobic005G199101 Sobic005G199101 Sobic009G040100--Sobic005G199101 Sobic007G205200--Sobic001G096500 Sobic007G205200--Sobic002G345400 Sobic007G205200--Sobic005G153600 Sobic007G205200--Sobic001G328900 Sobic007G205200--Sobic005G102451 Sobic005G056100 Sobic005G056100 Sobic007G205200--Sobic005G056100 Sobic010G109700 Sobic010G109700 Sobic007G205200--Sobic010G109700 Sobic007G205200--Sobic005G116000 Sobic010G219300 Sobic010G219300 Sobic007G205200--Sobic010G219300 Sobic002G345400--Sobic005G102451 Sobic002G345400--Sobic001G328900 Sobic002G345400--Sobic007G205200 Sobic002G345400--Sobic001G096500 Sobic002G345400--Sobic009G039100 Sobic003G303500 Sobic003G303500 Sobic002G345400--Sobic003G303500 Sobic002G345400--Sobic005G056100 Sobic002G345400--Sobic010G109700 Sobic002G345400--Sobic005G153400 Sobic005G225000 Sobic005G225000 Sobic005G153600--Sobic005G225000 Sobic005G153600--Sobic007G205200 Sobic005G153600--Sobic005G199101 Sobic010G153800 Sobic010G153800 Sobic005G153600--Sobic010G153800 Sobic005G153600--Sobic001G096500 Sobic005G153600--Sobic010G219300 Sobic010G148600 Sobic010G148600 Sobic005G153600--Sobic010G148600 Sobic005G153600--Sobic005G116000 Sobic005G187100 Sobic005G187100 Sobic005G153600--Sobic005G187100 Sobic009G039100--Sobic006G064700 Sobic009G039100--Sobic002G345400 Sobic009G039100--Sobic001G328900 Sobic009G039100--Sobic005G102451 Sobic009G039100--Sobic009G039900 Sobic009G039100--Sobic003G303500 Sobic009G039100--Sobic005G153400 Sobic009G039100--Sobic010G195600 Sobic009G039100--Sobic007G205200
Octagon: transcription factors


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