Gene annotation
Transcriptome id Sobic.010G219300.1
Synonym
Functional annotation DEFL27 - Defensin and Defensin-like DEFL family
UniProt A0A194YLS9
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G20070 : -
RAP-DB (Rice) LOC_Os06g45320.1 : DEFL27 - Defensin and Defensin-like DEFL family
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.010G219300


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G024700 peroxidase precursor, putative, expressed K00430: peroxidase
2 Sobic.005G187100 - -
3 Sobic.010G034900 expressed protein -
4 Sobic.007G082900 - -
5 Sobic.005G153600 DEF1 - Defensin and Defensin-like DEFL family, expressed -
6 Sobic.005G225000 - -
7 Sobic.010G148600 WRKY31, expressed -
8 Sobic.001G096500 phosphoesterase, putative, expressed K08073: bifunctional polynucleotide phosphatase/kinase
9 Sobic.005G199101 - K12581: CNOT7_8, CAF1, CCR4-NOT transcription complex subunit 7/8
10 Sobic.010G153800 - -
11 Sobic.007G205200 Not investigated(PubMedID : 23766026)@AP2 domain containing protein, expressed -
12 Sobic.001G249233 - -
13 Sobic.002G091800 peptide transporter PTR2, putative, expressed -
14 Sobic.008G064000 LTPL36 - Protease inhibitor/seed storage/LTP family protein precursor, expressed -
15 Sobic.005G174900 - -
16 Sobic.005G140400 - -
17 Sobic.006G062700 transferase family protein, putative, expressed -
18 Sobic.010G109700 myb-like DNA-binding domain, SHAQKYF class family protein, expressed -
19 Sobic.005G056100 - -
20 Sobic.002G344900 MBTB21 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Meprin and TRAF Homology MATH domain, expressed K10523: speckle-type POZ protein


Gene co-expression network
sample Sobic010G219300 Sobic010G219300 Sobic003G024700 Sobic003G024700 Sobic010G219300--Sobic003G024700 Sobic005G187100 Sobic005G187100 Sobic010G219300--Sobic005G187100 Sobic010G034900 Sobic010G034900 Sobic010G219300--Sobic010G034900 Sobic007G082900 Sobic007G082900 Sobic010G219300--Sobic007G082900 Sobic005G153600 Sobic005G153600 Sobic010G219300--Sobic005G153600 Sobic005G225000 Sobic005G225000 Sobic010G219300--Sobic005G225000 Sobic010G148600 Sobic010G148600 Sobic010G219300--Sobic010G148600 Sobic001G096500 Sobic001G096500 Sobic010G219300--Sobic001G096500 Sobic005G199101 Sobic005G199101 Sobic010G219300--Sobic005G199101 Sobic003G024700--Sobic010G219300 Sobic003G024700--Sobic010G034900 Sobic003G024700--Sobic010G148600 Sobic001G249233 Sobic001G249233 Sobic003G024700--Sobic001G249233 Sobic005G174900 Sobic005G174900 Sobic003G024700--Sobic005G174900 Sobic006G062700 Sobic006G062700 Sobic003G024700--Sobic006G062700 Sobic005G140400 Sobic005G140400 Sobic003G024700--Sobic005G140400 Sobic003G024700--Sobic001G096500 Sobic010G109700 Sobic010G109700 Sobic003G024700--Sobic010G109700 Sobic010G153800 Sobic010G153800 Sobic005G187100--Sobic010G153800 Sobic005G187100--Sobic005G199101 Sobic005G187100--Sobic005G225000 Sobic005G187100--Sobic010G219300 Sobic005G187100--Sobic007G082900 Sobic002G091800 Sobic002G091800 Sobic005G187100--Sobic002G091800 Sobic002G344900 Sobic002G344900 Sobic005G187100--Sobic002G344900 Sobic005G187100--Sobic005G153600 Sobic005G187100--Sobic010G148600 Sobic008G064000 Sobic008G064000 Sobic010G034900--Sobic008G064000 Sobic010G034900--Sobic003G024700 Sobic010G034900--Sobic001G249233 Sobic010G034900--Sobic010G219300 Sobic010G034900--Sobic005G174900 Sobic010G034900--Sobic006G062700 Sobic010G034900--Sobic010G148600 Sobic010G034900--Sobic010G109700 Sobic007G083300 Sobic007G083300 Sobic010G034900--Sobic007G083300 Sobic007G082900--Sobic010G219300 Sobic007G082900--Sobic005G187100 Sobic004G196200 Sobic004G196200 Sobic007G082900--Sobic004G196200 Sobic007G082900--Sobic010G034900 Sobic007G082900--Sobic003G024700 Sobic007G082900--Sobic005G153600 Sobic007G082900--Sobic005G225000 Sobic007G082900--Sobic005G199101 Sobic007G082900--Sobic010G153800 Sobic005G153600--Sobic005G225000 Sobic007G205200 Sobic007G205200 Sobic005G153600--Sobic007G205200 Sobic005G153600--Sobic005G199101 Sobic005G153600--Sobic010G153800 Sobic005G153600--Sobic001G096500 Sobic005G153600--Sobic010G219300 Sobic005G153600--Sobic010G148600 Sobic005G116000 Sobic005G116000 Sobic005G153600--Sobic005G116000 Sobic005G153600--Sobic005G187100 Sobic005G225000--Sobic005G199101 Sobic005G225000--Sobic010G153800 Sobic005G225000--Sobic005G153600 Sobic005G225000--Sobic010G148600 Sobic005G225000--Sobic002G091800 Sobic005G225000--Sobic005G187100 Sobic005G225000--Sobic002G344900 Sobic005G225000--Sobic010G219300 Sobic005G225000--Sobic005G140400 Sobic010G148600--Sobic005G140400 Sobic010G148600--Sobic001G249233 Sobic010G148600--Sobic005G174900 Sobic010G148600--Sobic002G091800 Sobic010G148600--Sobic005G225000 Sobic010G148600--Sobic003G024700 Sobic010G148600--Sobic006G062700 Sobic010G148600--Sobic005G199101 Sobic010G148600--Sobic010G153800 Sobic001G096500--Sobic007G205200 Sobic005G056100 Sobic005G056100 Sobic001G096500--Sobic005G056100 Sobic001G096500--Sobic010G109700 Sobic001G096500--Sobic005G153600 Sobic005G102451 Sobic005G102451 Sobic001G096500--Sobic005G102451 Sobic002G345400 Sobic002G345400 Sobic001G096500--Sobic002G345400 Sobic001G096500--Sobic001G249233 Sobic001G096500--Sobic010G148600 Sobic001G328900 Sobic001G328900 Sobic001G096500--Sobic001G328900 Sobic005G199101--Sobic010G153800 Sobic005G199101--Sobic005G225000 Sobic005G199101--Sobic005G187100 Sobic005G199101--Sobic002G091800 Sobic005G199101--Sobic002G344900 Sobic005G199101--Sobic005G153600 Sobic005G199101--Sobic010G148600 Sobic005G199101--Sobic005G140400 Sobic005G199101--Sobic010G219300
Octagon: transcription factors


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