Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G471150.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5SAX2
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G54270 : eif4a-2
RAP-DB (Rice) LOC_Os02g05330.1 : DEAD-box ATP-dependent RNA helicase, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G071300 GDSL-like lipase/acylhydrolase, putative, expressed -
2 Sobic.003G077001 - -
3 Sobic.001G415901 - -
4 Sobic.002G113066 - -
5 Sobic.006G037150 - -
6 Sobic.006G221900 MBTB7 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Meprin and TRAF Homology MATH domain, expressed K10523: speckle-type POZ protein
7 Sobic.001G120850 - -
8 Sobic.010G172600 expressed protein -
9 Sobic.003G003900 - -
10 Sobic.005G159100 dirigent-like protein pDIR17, putative, expressed -
11 Sobic.009G186100 expressed protein -
12 Sobic.008G145700 expressed protein -
13 Sobic.001G515900 expressed protein -
14 Sobic.001G251650 - -
15 Sobic.010G216500 OsFBDUF34 - F-box and DUF domain containing protein, expressed -
16 Sobic.010G077275 - -
17 Sobic.005G214900 cytochrome P450, putative, expressed -
18 Sobic.010G174600 Leucine rich repeat N-terminal domain containing protein, putative, expressed -
19 Sobic.001G210500 RIPER6 - Ripening-related family protein precursor, expressed -
20 Sobic.001G146450 - -


Gene co-expression network
sample Sobic001G471150 Sobic001G471150 Sobic004G071300 Sobic004G071300 Sobic001G471150--Sobic004G071300 Sobic003G077001 Sobic003G077001 Sobic001G471150--Sobic003G077001 Sobic001G415901 Sobic001G415901 Sobic001G471150--Sobic001G415901 Sobic002G113066 Sobic002G113066 Sobic001G471150--Sobic002G113066 Sobic006G037150 Sobic006G037150 Sobic001G471150--Sobic006G037150 Sobic006G221900 Sobic006G221900 Sobic001G471150--Sobic006G221900 Sobic001G120850 Sobic001G120850 Sobic001G471150--Sobic001G120850 Sobic010G172600 Sobic010G172600 Sobic001G471150--Sobic010G172600 Sobic003G003900 Sobic003G003900 Sobic001G471150--Sobic003G003900 Sobic010G077275 Sobic010G077275 Sobic004G071300--Sobic010G077275 Sobic010G174600 Sobic010G174600 Sobic004G071300--Sobic010G174600 Sobic001G251650 Sobic001G251650 Sobic004G071300--Sobic001G251650 Sobic001G515900 Sobic001G515900 Sobic004G071300--Sobic001G515900 Sobic001G146450 Sobic001G146450 Sobic004G071300--Sobic001G146450 Sobic003G418600 Sobic003G418600 Sobic004G071300--Sobic003G418600 Sobic001G352100 Sobic001G352100 Sobic004G071300--Sobic001G352100 Sobic006G176300 Sobic006G176300 Sobic004G071300--Sobic006G176300 Sobic007G084900 Sobic007G084900 Sobic004G071300--Sobic007G084900 Sobic003G077001--Sobic002G113066 Sobic003G077001--Sobic003G003900 Sobic003G077001--Sobic001G415901 Sobic005G159100 Sobic005G159100 Sobic003G077001--Sobic005G159100 Sobic003G077001--Sobic006G221900 Sobic003G077001--Sobic001G120850 Sobic008G145700 Sobic008G145700 Sobic003G077001--Sobic008G145700 Sobic005G214900 Sobic005G214900 Sobic003G077001--Sobic005G214900 Sobic003G077001--Sobic010G172600 Sobic001G415901--Sobic003G077001 Sobic001G415901--Sobic006G221900 Sobic001G415901--Sobic002G113066 Sobic001G415901--Sobic005G159100 Sobic001G415901--Sobic001G120850 Sobic001G415901--Sobic010G172600 Sobic001G415901--Sobic003G003900 Sobic001G415901--Sobic008G145700 Sobic001G210500 Sobic001G210500 Sobic001G415901--Sobic001G210500 Sobic002G113066--Sobic003G077001 Sobic002G113066--Sobic003G003900 Sobic002G113066--Sobic001G415901 Sobic002G113066--Sobic005G214900 Sobic002G113066--Sobic001G120850 Sobic002G113066--Sobic005G159100 Sobic002G113066--Sobic006G221900 Sobic005G035850 Sobic005G035850 Sobic002G113066--Sobic005G035850 Sobic002G113066--Sobic008G145700 Sobic006G037150--Sobic005G035850 Sobic006G037150--Sobic003G003900 Sobic006G037150--Sobic002G113066 Sobic006G037150--Sobic005G214900 Sobic004G139800 Sobic004G139800 Sobic006G037150--Sobic004G139800 Sobic001G310133 Sobic001G310133 Sobic006G037150--Sobic001G310133 Sobic006G037150--Sobic003G077001 Sobic008G163750 Sobic008G163750 Sobic006G037150--Sobic008G163750 Sobic008G098032 Sobic008G098032 Sobic006G037150--Sobic008G098032 Sobic006G221900--Sobic001G415901 Sobic006G221900--Sobic010G172600 Sobic006G221900--Sobic003G077001 Sobic006G221900--Sobic001G120850 Sobic006G221900--Sobic005G159100 Sobic006G221900--Sobic002G113066 Sobic010G216500 Sobic010G216500 Sobic006G221900--Sobic010G216500 Sobic006G221900--Sobic008G145700 Sobic006G221900--Sobic001G210500 Sobic001G120850--Sobic001G415901 Sobic001G120850--Sobic010G172600 Sobic001G120850--Sobic006G221900 Sobic001G120850--Sobic003G077001 Sobic001G120850--Sobic010G216500 Sobic001G120850--Sobic002G113066 Sobic001G120850--Sobic005G159100 Sobic007G118700 Sobic007G118700 Sobic001G120850--Sobic007G118700 Sobic005G217400 Sobic005G217400 Sobic001G120850--Sobic005G217400 Sobic004G342800 Sobic004G342800 Sobic010G172600--Sobic004G342800 Sobic010G172600--Sobic001G120850 Sobic010G172600--Sobic001G415901 Sobic010G172600--Sobic006G221900 Sobic010G172600--Sobic005G159100 Sobic010G172600--Sobic010G216500 Sobic010G172600--Sobic001G210500 Sobic010G172600--Sobic003G077001 Sobic010G172600--Sobic007G118700 Sobic003G003900--Sobic002G113066 Sobic003G003900--Sobic003G077001 Sobic003G003900--Sobic005G035850 Sobic003G003900--Sobic005G214900 Sobic003G003900--Sobic001G310133 Sobic003G003900--Sobic001G415901 Sobic003G003900--Sobic004G139800 Sobic003G003900--Sobic008G163750 Sobic003G003900--Sobic001G120850
Octagon: transcription factors


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