Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G096400.1
Synonym
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1B6QAA9
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os10g19904.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G064300 eukaryotic aspartyl protease domain containing protein, expressed -
2 Sobic.008G181600 thaumatin, putative, expressed -
3 Sobic.001G345700 zinc-binding protein, putative, expressed -
4 Sobic.001G345600 zinc-binding protein, putative, expressed -
5 Sobic.005G152400 - -
6 Sobic.001G312200 DEF3 - Defensin and Defensin-like DEFL family, expressed -
7 Sobic.002G332000 CRP8 - Cysteine-rich family protein precursor, expressed -
8 Sobic.008G122300 OsSub63 - Putative Subtilisin homologue, expressed -
9 Sobic.005G131100 expressed protein -
10 Sobic.010G039600 - -
11 Sobic.010G121800 expansin precursor, putative, expressed -
12 Sobic.005G153100 - -
13 Sobic.001G200800 LTPL160 - Protease inhibitor/seed storage/LTP family protein precursor, expressed -
14 Sobic.008G143200 - -
15 Sobic.001G505400 expressed protein -
16 Sobic.005G190300 - -
17 Sobic.002G103000 PME/invertase inhibitor, putative, expressed -
18 Sobic.005G080700 - -
19 Sobic.009G202700 zinc finger family protein, putative, expressed -
20 Sobic.006G021500 response regulator receiver domain containing protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic002G096400 Sobic002G096400 Sobic005G064300 Sobic005G064300 Sobic002G096400--Sobic005G064300 Sobic008G181600 Sobic008G181600 Sobic002G096400--Sobic008G181600 Sobic001G345700 Sobic001G345700 Sobic002G096400--Sobic001G345700 Sobic001G345600 Sobic001G345600 Sobic002G096400--Sobic001G345600 Sobic005G152400 Sobic005G152400 Sobic002G096400--Sobic005G152400 Sobic001G312200 Sobic001G312200 Sobic002G096400--Sobic001G312200 Sobic002G332000 Sobic002G332000 Sobic002G096400--Sobic002G332000 Sobic008G122300 Sobic008G122300 Sobic002G096400--Sobic008G122300 Sobic005G131100 Sobic005G131100 Sobic002G096400--Sobic005G131100 Sobic005G064300--Sobic008G181600 Sobic005G064300--Sobic002G096400 Sobic005G064300--Sobic001G345700 Sobic010G039600 Sobic010G039600 Sobic005G064300--Sobic010G039600 Sobic005G064300--Sobic001G345600 Sobic005G064300--Sobic001G312200 Sobic005G064300--Sobic005G152400 Sobic005G064300--Sobic008G122300 Sobic005G064300--Sobic005G131100 Sobic008G181600--Sobic005G064300 Sobic008G181600--Sobic001G345700 Sobic008G181600--Sobic001G345600 Sobic008G181600--Sobic002G096400 Sobic008G181600--Sobic001G312200 Sobic008G181600--Sobic005G152400 Sobic008G181600--Sobic008G122300 Sobic008G181600--Sobic010G039600 Sobic008G181600--Sobic005G131100 Sobic001G345700--Sobic008G181600 Sobic001G345700--Sobic005G064300 Sobic001G345700--Sobic001G345600 Sobic001G345700--Sobic002G096400 Sobic001G345700--Sobic001G312200 Sobic001G345700--Sobic008G122300 Sobic001G345700--Sobic010G039600 Sobic001G345700--Sobic005G152400 Sobic001G345700--Sobic005G131100 Sobic001G345600--Sobic001G312200 Sobic001G345600--Sobic008G122300 Sobic001G345600--Sobic005G131100 Sobic001G345600--Sobic008G181600 Sobic001G345600--Sobic002G332000 Sobic001G345600--Sobic001G345700 Sobic005G153100 Sobic005G153100 Sobic001G345600--Sobic005G153100 Sobic001G505400 Sobic001G505400 Sobic001G345600--Sobic001G505400 Sobic005G080700 Sobic005G080700 Sobic001G345600--Sobic005G080700 Sobic005G152400--Sobic001G312200 Sobic005G152400--Sobic005G153100 Sobic005G152400--Sobic001G345600 Sobic004G015200 Sobic004G015200 Sobic005G152400--Sobic004G015200 Sobic002G399700 Sobic002G399700 Sobic005G152400--Sobic002G399700 Sobic005G152400--Sobic008G122300 Sobic008G188300 Sobic008G188300 Sobic005G152400--Sobic008G188300 Sobic005G152400--Sobic005G131100 Sobic005G152400--Sobic002G332000 Sobic001G312200--Sobic005G153100 Sobic001G312200--Sobic002G399700 Sobic001G312200--Sobic001G345600 Sobic001G312200--Sobic005G131100 Sobic001G312200--Sobic008G122300 Sobic002G058000 Sobic002G058000 Sobic001G312200--Sobic002G058000 Sobic001G312200--Sobic001G505400 Sobic001G312200--Sobic005G080700 Sobic002G031200 Sobic002G031200 Sobic001G312200--Sobic002G031200 Sobic010G121800 Sobic010G121800 Sobic002G332000--Sobic010G121800 Sobic008G143200 Sobic008G143200 Sobic002G332000--Sobic008G143200 Sobic002G332000--Sobic008G122300 Sobic002G332000--Sobic005G131100 Sobic002G103000 Sobic002G103000 Sobic002G332000--Sobic002G103000 Sobic001G200800 Sobic001G200800 Sobic002G332000--Sobic001G200800 Sobic001G209701 Sobic001G209701 Sobic002G332000--Sobic001G209701 Sobic008G122300--Sobic005G131100 Sobic008G122300--Sobic002G332000 Sobic008G122300--Sobic005G080700 Sobic001G341200 Sobic001G341200 Sobic008G122300--Sobic001G341200 Sobic008G122300--Sobic001G209701 Sobic005G131100--Sobic008G122300 Sobic005G131100--Sobic005G080700 Sobic005G131100--Sobic001G209701
Octagon: transcription factors


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