Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G312200.1
Synonym PDF2.3, LCR68
Functional annotation DEF3 - Defensin and Defensin-like DEFL family, expressed
UniProt A0A1B6QM63
Pfam PF00304
Panther DB PTHR33147
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G02130 : low-molecular-weight cysteine-rich 68
RAP-DB (Rice) LOC_Os02g41904.1 : DEF7 - Defensin and Defensin-like DEFL family, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G153100 - -
2 Sobic.002G399700 pectinesterase, putative, expressed -
3 Sobic.001G345600 zinc-binding protein, putative, expressed -
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7 Sobic.001G505400 expressed protein -
8 Sobic.005G080700 - -
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15 Sobic.005G189700 expressed protein -
16 Sobic.009G202700 zinc finger family protein, putative, expressed -
17 Sobic.005G152400 - -
18 Sobic.004G048500 - -
19 Sobic.005G147400 - -
20 Sobic.005G196400 DEF6 - Defensin and Defensin-like DEFL family, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic001G312200 Sobic001G312200 Sobic005G153100 Sobic005G153100 Sobic001G312200--Sobic005G153100 Sobic002G399700 Sobic002G399700 Sobic001G312200--Sobic002G399700 Sobic001G345600 Sobic001G345600 Sobic001G312200--Sobic001G345600 Sobic005G131100 Sobic005G131100 Sobic001G312200--Sobic005G131100 Sobic008G122300 Sobic008G122300 Sobic001G312200--Sobic008G122300 Sobic002G058000 Sobic002G058000 Sobic001G312200--Sobic002G058000 Sobic001G505400 Sobic001G505400 Sobic001G312200--Sobic001G505400 Sobic005G080700 Sobic005G080700 Sobic001G312200--Sobic005G080700 Sobic002G031200 Sobic002G031200 Sobic001G312200--Sobic002G031200 Sobic005G153100--Sobic002G399700 Sobic005G153100--Sobic001G312200 Sobic005G153100--Sobic002G058000 Sobic004G315900 Sobic004G315900 Sobic005G153100--Sobic004G315900 Sobic005G153100--Sobic002G031200 Sobic010G120100 Sobic010G120100 Sobic005G153100--Sobic010G120100 Sobic005G153100--Sobic001G505400 Sobic005G223300 Sobic005G223300 Sobic005G153100--Sobic005G223300 Sobic005G147400 Sobic005G147400 Sobic005G153100--Sobic005G147400 Sobic002G399700--Sobic005G153100 Sobic002G399700--Sobic002G058000 Sobic002G399700--Sobic004G315900 Sobic005G080800 Sobic005G080800 Sobic002G399700--Sobic005G080800 Sobic005G154000 Sobic005G154000 Sobic002G399700--Sobic005G154000 Sobic002G399700--Sobic002G031200 Sobic002G399700--Sobic010G120100 Sobic005G130900 Sobic005G130900 Sobic002G399700--Sobic005G130900 Sobic002G399700--Sobic005G223300 Sobic001G345600--Sobic001G312200 Sobic001G345600--Sobic008G122300 Sobic001G345600--Sobic005G131100 Sobic008G181600 Sobic008G181600 Sobic001G345600--Sobic008G181600 Sobic002G332000 Sobic002G332000 Sobic001G345600--Sobic002G332000 Sobic001G345700 Sobic001G345700 Sobic001G345600--Sobic001G345700 Sobic001G345600--Sobic005G153100 Sobic001G345600--Sobic001G505400 Sobic001G345600--Sobic005G080700 Sobic005G131100--Sobic008G122300 Sobic005G131100--Sobic005G080700 Sobic001G209701 Sobic001G209701 Sobic005G131100--Sobic001G209701 Sobic008G122300--Sobic005G131100 Sobic008G122300--Sobic002G332000 Sobic008G122300--Sobic005G080700 Sobic001G341200 Sobic001G341200 Sobic008G122300--Sobic001G341200 Sobic008G122300--Sobic001G209701 Sobic002G058000--Sobic004G315900 Sobic002G058000--Sobic002G031200 Sobic002G058000--Sobic010G120100 Sobic002G058000--Sobic002G399700 Sobic002G058000--Sobic005G080800 Sobic002G058000--Sobic005G223300 Sobic002G058000--Sobic005G130900 Sobic002G058000--Sobic005G153100 Sobic002G058000--Sobic005G154000 Sobic001G505400--Sobic005G080700 Sobic005G196400 Sobic005G196400 Sobic001G505400--Sobic005G196400 Sobic001G505400--Sobic005G147400 Sobic001G505400--Sobic005G223300 Sobic007G040400 Sobic007G040400 Sobic001G505400--Sobic007G040400 Sobic004G048500 Sobic004G048500 Sobic001G505400--Sobic004G048500 Sobic005G189700 Sobic005G189700 Sobic001G505400--Sobic005G189700 Sobic001G505400--Sobic001G209701 Sobic005G080700--Sobic004G048500 Sobic005G080700--Sobic005G223300 Sobic005G080700--Sobic001G505400 Sobic005G080700--Sobic005G189700 Sobic005G080700--Sobic001G209701 Sobic002G031200--Sobic010G120100 Sobic002G031200--Sobic005G223300 Sobic002G031200--Sobic004G315900 Sobic002G031200--Sobic002G058000 Sobic002G031200--Sobic005G189700 Sobic002G031200--Sobic005G080700 Sobic002G031200--Sobic004G048500 Sobic002G031200--Sobic002G399700 Sobic002G031200--Sobic001G505400
Octagon: transcription factors


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