Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G399700.1,Sobic.002G399700.2
Synonym Sb02g041430
Functional annotation pectinesterase, putative, expressed
UniProt A0A1B6QFX5 , A0A1B6QFX3
Pfam PF01095
Panther DB PTHR31321 PTHR31321:SF26
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0005618; cell wall


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G47280 : Pectin lyase-like superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os07g46190.1 : pectinesterase, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat TraesCS2B02G139500
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.002G399700


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G153100 - -
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20 Sobic.008G120200 - -


Gene co-expression network
sample Sobic002G399700 Sobic002G399700 Sobic005G153100 Sobic005G153100 Sobic002G399700--Sobic005G153100 Sobic002G058000 Sobic002G058000 Sobic002G399700--Sobic002G058000 Sobic004G315900 Sobic004G315900 Sobic002G399700--Sobic004G315900 Sobic005G080800 Sobic005G080800 Sobic002G399700--Sobic005G080800 Sobic005G154000 Sobic005G154000 Sobic002G399700--Sobic005G154000 Sobic002G031200 Sobic002G031200 Sobic002G399700--Sobic002G031200 Sobic010G120100 Sobic010G120100 Sobic002G399700--Sobic010G120100 Sobic005G130900 Sobic005G130900 Sobic002G399700--Sobic005G130900 Sobic005G223300 Sobic005G223300 Sobic002G399700--Sobic005G223300 Sobic005G153100--Sobic002G399700 Sobic001G312200 Sobic001G312200 Sobic005G153100--Sobic001G312200 Sobic005G153100--Sobic002G058000 Sobic005G153100--Sobic004G315900 Sobic005G153100--Sobic002G031200 Sobic005G153100--Sobic010G120100 Sobic001G505400 Sobic001G505400 Sobic005G153100--Sobic001G505400 Sobic005G153100--Sobic005G223300 Sobic005G147400 Sobic005G147400 Sobic005G153100--Sobic005G147400 Sobic002G058000--Sobic004G315900 Sobic002G058000--Sobic002G031200 Sobic002G058000--Sobic010G120100 Sobic002G058000--Sobic002G399700 Sobic002G058000--Sobic005G080800 Sobic002G058000--Sobic005G223300 Sobic002G058000--Sobic005G130900 Sobic002G058000--Sobic005G153100 Sobic002G058000--Sobic005G154000 Sobic004G315900--Sobic002G058000 Sobic004G315900--Sobic002G031200 Sobic004G315900--Sobic010G120100 Sobic004G315900--Sobic002G399700 Sobic004G315900--Sobic005G080800 Sobic004G315900--Sobic005G223300 Sobic004G315900--Sobic005G130900 Sobic005G189700 Sobic005G189700 Sobic004G315900--Sobic005G189700 Sobic004G315900--Sobic005G154000 Sobic005G080800--Sobic005G130900 Sobic001G349600 Sobic001G349600 Sobic005G080800--Sobic001G349600 Sobic005G080800--Sobic004G315900 Sobic005G080800--Sobic002G058000 Sobic010G191400 Sobic010G191400 Sobic005G080800--Sobic010G191400 Sobic005G027200 Sobic005G027200 Sobic005G080800--Sobic005G027200 Sobic005G080800--Sobic005G154000 Sobic005G080800--Sobic002G399700 Sobic002G058100 Sobic002G058100 Sobic005G080800--Sobic002G058100 Sobic005G154000--Sobic005G080800 Sobic005G154000--Sobic005G130900 Sobic005G154000--Sobic002G399700 Sobic005G154000--Sobic001G349600 Sobic005G154000--Sobic002G058000 Sobic005G154000--Sobic004G315900 Sobic005G154000--Sobic005G027200 Sobic005G154000--Sobic010G191400 Sobic005G154000--Sobic002G058100 Sobic002G031200--Sobic010G120100 Sobic002G031200--Sobic005G223300 Sobic002G031200--Sobic004G315900 Sobic002G031200--Sobic002G058000 Sobic002G031200--Sobic005G189700 Sobic005G080700 Sobic005G080700 Sobic002G031200--Sobic005G080700 Sobic004G048500 Sobic004G048500 Sobic002G031200--Sobic004G048500 Sobic002G031200--Sobic002G399700 Sobic002G031200--Sobic001G505400 Sobic010G120100--Sobic002G031200 Sobic010G120100--Sobic005G223300 Sobic010G120100--Sobic004G315900 Sobic010G120100--Sobic002G058000 Sobic010G120100--Sobic005G189700 Sobic010G120100--Sobic005G080700 Sobic010G120100--Sobic004G048500 Sobic010G120100--Sobic002G399700 Sobic010G120100--Sobic001G505400 Sobic005G130900--Sobic005G080800 Sobic005G130900--Sobic001G349600 Sobic005G130900--Sobic010G191400 Sobic005G130900--Sobic005G027200 Sobic005G130900--Sobic002G058100 Sobic005G130900--Sobic005G154000 Sobic005G130900--Sobic004G315900 Sobic005G130900--Sobic002G058000 Sobic006G006000 Sobic006G006000 Sobic005G130900--Sobic006G006000 Sobic005G223300--Sobic010G120100 Sobic005G223300--Sobic002G031200 Sobic005G223300--Sobic005G080700 Sobic005G223300--Sobic005G189700 Sobic005G223300--Sobic004G048500 Sobic005G223300--Sobic001G505400 Sobic005G223300--Sobic002G058000 Sobic005G223300--Sobic004G315900 Sobic005G223300--Sobic005G147400
Octagon: transcription factors


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