Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G130900.1
Synonym Sb05g019450
Functional annotation expressed protein
UniProt C5Y377
Pfam -
Panther DB PTHR33184 PTHR33184:SF3
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT4G32105 : Beta-1,3-N-Acetylglucosaminyltransferase family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os11g32070.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G080800 - -
2 Sobic.001G349600 cyclin, putative, expressed K18810: cyclin D1/2/4, plant
3 Sobic.010G191400 - -
4 Sobic.005G027200 GDSL-like lipase/acylhydrolase, putative, expressed -
5 Sobic.002G058100 thioredoxin, putative, expressed K03671: thioredoxin 1
6 Sobic.005G154000 thioredoxin reductase 2, putative, expressed K00384: trxB, thioredoxin reductase (NADPH)
7 Sobic.004G315900 DEFL74 - Defensin and Defensin-like DEFL family, expressed -
8 Sobic.002G058000 thioredoxin, putative, expressed K03671: thioredoxin 1
9 Sobic.006G006000 expressed protein -
10 Sobic.004G029500 - -
11 Sobic.002G399700 pectinesterase, putative, expressed -
12 Sobic.002G095000 DEFL72 - Defensin and Defensin-like DEFL family -
13 Sobic.007G041000 expressed protein -
14 Sobic.002G031200 LTPL33 - Protease inhibitor/seed storage/LTP family protein precursor, expressed -
15 Sobic.010G120100 expansin precursor, putative, expressed -
16 Sobic.005G081800 LTPL33 - Protease inhibitor/seed storage/LTP family protein precursor, expressed -
17 Sobic.010G129300 aspartic proteinase nepenthesin-2 precursor, putative, expressed -
18 Sobic.005G153100 - -
19 Sobic.006G006100 expressed protein -
20 Sobic.005G223300 DEFL16 - Defensin and Defensin-like DEFL family -


Gene co-expression network
sample Sobic005G130900 Sobic005G130900 Sobic005G080800 Sobic005G080800 Sobic005G130900--Sobic005G080800 Sobic001G349600 Sobic001G349600 Sobic005G130900--Sobic001G349600 Sobic010G191400 Sobic010G191400 Sobic005G130900--Sobic010G191400 Sobic005G027200 Sobic005G027200 Sobic005G130900--Sobic005G027200 Sobic002G058100 Sobic002G058100 Sobic005G130900--Sobic002G058100 Sobic005G154000 Sobic005G154000 Sobic005G130900--Sobic005G154000 Sobic004G315900 Sobic004G315900 Sobic005G130900--Sobic004G315900 Sobic002G058000 Sobic002G058000 Sobic005G130900--Sobic002G058000 Sobic006G006000 Sobic006G006000 Sobic005G130900--Sobic006G006000 Sobic005G080800--Sobic005G130900 Sobic005G080800--Sobic001G349600 Sobic005G080800--Sobic004G315900 Sobic005G080800--Sobic002G058000 Sobic005G080800--Sobic010G191400 Sobic005G080800--Sobic005G027200 Sobic005G080800--Sobic005G154000 Sobic002G399700 Sobic002G399700 Sobic005G080800--Sobic002G399700 Sobic005G080800--Sobic002G058100 Sobic001G349600--Sobic005G130900 Sobic001G349600--Sobic010G191400 Sobic001G349600--Sobic005G080800 Sobic001G349600--Sobic002G058100 Sobic001G349600--Sobic005G027200 Sobic004G029500 Sobic004G029500 Sobic001G349600--Sobic004G029500 Sobic001G349600--Sobic006G006000 Sobic002G095000 Sobic002G095000 Sobic001G349600--Sobic002G095000 Sobic001G349600--Sobic005G154000 Sobic010G191400--Sobic002G058100 Sobic010G191400--Sobic001G349600 Sobic010G191400--Sobic004G029500 Sobic010G191400--Sobic005G027200 Sobic010G191400--Sobic002G095000 Sobic010G191400--Sobic005G130900 Sobic010G191400--Sobic006G006000 Sobic010G191400--Sobic005G080800 Sobic005G081800 Sobic005G081800 Sobic010G191400--Sobic005G081800 Sobic005G027200--Sobic002G058100 Sobic005G027200--Sobic010G191400 Sobic005G027200--Sobic002G095000 Sobic005G027200--Sobic001G349600 Sobic005G027200--Sobic004G029500 Sobic005G027200--Sobic006G006000 Sobic005G027200--Sobic005G130900 Sobic005G027200--Sobic005G080800 Sobic005G027200--Sobic005G081800 Sobic002G058100--Sobic010G191400 Sobic002G058100--Sobic004G029500 Sobic002G058100--Sobic002G095000 Sobic002G058100--Sobic005G027200 Sobic002G058100--Sobic001G349600 Sobic002G058100--Sobic006G006000 Sobic002G058100--Sobic005G081800 Sobic010G129300 Sobic010G129300 Sobic002G058100--Sobic010G129300 Sobic002G058100--Sobic005G130900 Sobic005G154000--Sobic005G080800 Sobic005G154000--Sobic005G130900 Sobic005G154000--Sobic002G399700 Sobic005G154000--Sobic001G349600 Sobic005G154000--Sobic002G058000 Sobic005G154000--Sobic004G315900 Sobic005G154000--Sobic005G027200 Sobic005G154000--Sobic010G191400 Sobic005G154000--Sobic002G058100 Sobic004G315900--Sobic002G058000 Sobic002G031200 Sobic002G031200 Sobic004G315900--Sobic002G031200 Sobic010G120100 Sobic010G120100 Sobic004G315900--Sobic010G120100 Sobic004G315900--Sobic002G399700 Sobic004G315900--Sobic005G080800 Sobic005G223300 Sobic005G223300 Sobic004G315900--Sobic005G223300 Sobic004G315900--Sobic005G130900 Sobic005G189700 Sobic005G189700 Sobic004G315900--Sobic005G189700 Sobic004G315900--Sobic005G154000 Sobic002G058000--Sobic004G315900 Sobic002G058000--Sobic002G031200 Sobic002G058000--Sobic010G120100 Sobic002G058000--Sobic002G399700 Sobic002G058000--Sobic005G080800 Sobic002G058000--Sobic005G223300 Sobic002G058000--Sobic005G130900 Sobic005G153100 Sobic005G153100 Sobic002G058000--Sobic005G153100 Sobic002G058000--Sobic005G154000 Sobic006G006000--Sobic002G058100 Sobic006G006000--Sobic010G191400 Sobic006G006000--Sobic005G027200 Sobic006G006000--Sobic002G095000 Sobic006G006000--Sobic004G029500 Sobic006G006000--Sobic001G349600 Sobic006G006100 Sobic006G006100 Sobic006G006000--Sobic006G006100 Sobic006G006000--Sobic005G081800 Sobic006G006000--Sobic005G130900
Octagon: transcription factors


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