Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G027200.1
Synonym Sb05g002280
Functional annotation GDSL-like lipase/acylhydrolase, putative, expressed
UniProt C5Y446
Pfam PF00657
Panther DB PTHR22835 PTHR22835:SF241
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0016788; hydrolase activity, acting on ester bonds


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G27360 : GDSL-like Lipase/Acylhydrolase superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g46220.1 : GDSL-like lipase/acylhydrolase, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a004243
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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19 Sobic.005G064400 eukaryotic aspartyl protease domain containing protein, expressed -
20 Sobic.005G153100 - -


Gene co-expression network
sample Sobic005G027200 Sobic005G027200 Sobic002G058100 Sobic002G058100 Sobic005G027200--Sobic002G058100 Sobic010G191400 Sobic010G191400 Sobic005G027200--Sobic010G191400 Sobic002G095000 Sobic002G095000 Sobic005G027200--Sobic002G095000 Sobic001G349600 Sobic001G349600 Sobic005G027200--Sobic001G349600 Sobic004G029500 Sobic004G029500 Sobic005G027200--Sobic004G029500 Sobic006G006000 Sobic006G006000 Sobic005G027200--Sobic006G006000 Sobic005G130900 Sobic005G130900 Sobic005G027200--Sobic005G130900 Sobic005G080800 Sobic005G080800 Sobic005G027200--Sobic005G080800 Sobic005G081800 Sobic005G081800 Sobic005G027200--Sobic005G081800 Sobic002G058100--Sobic010G191400 Sobic002G058100--Sobic004G029500 Sobic002G058100--Sobic002G095000 Sobic002G058100--Sobic005G027200 Sobic002G058100--Sobic001G349600 Sobic002G058100--Sobic006G006000 Sobic002G058100--Sobic005G081800 Sobic010G129300 Sobic010G129300 Sobic002G058100--Sobic010G129300 Sobic002G058100--Sobic005G130900 Sobic010G191400--Sobic002G058100 Sobic010G191400--Sobic001G349600 Sobic010G191400--Sobic004G029500 Sobic010G191400--Sobic005G027200 Sobic010G191400--Sobic002G095000 Sobic010G191400--Sobic005G130900 Sobic010G191400--Sobic006G006000 Sobic010G191400--Sobic005G080800 Sobic010G191400--Sobic005G081800 Sobic002G095000--Sobic004G029500 Sobic002G095000--Sobic002G058100 Sobic002G095000--Sobic005G081800 Sobic002G095000--Sobic010G191400 Sobic002G095000--Sobic005G027200 Sobic002G095000--Sobic010G129300 Sobic002G095000--Sobic006G006000 Sobic002G095000--Sobic001G349600 Sobic006G007001 Sobic006G007001 Sobic002G095000--Sobic006G007001 Sobic001G349600--Sobic005G130900 Sobic001G349600--Sobic010G191400 Sobic001G349600--Sobic005G080800 Sobic001G349600--Sobic002G058100 Sobic001G349600--Sobic005G027200 Sobic001G349600--Sobic004G029500 Sobic001G349600--Sobic006G006000 Sobic001G349600--Sobic002G095000 Sobic005G154000 Sobic005G154000 Sobic001G349600--Sobic005G154000 Sobic004G029500--Sobic002G095000 Sobic004G029500--Sobic002G058100 Sobic004G029500--Sobic010G191400 Sobic004G029500--Sobic010G129300 Sobic004G029500--Sobic005G081800 Sobic004G029500--Sobic005G027200 Sobic004G029500--Sobic006G006000 Sobic004G029500--Sobic001G349600 Sobic004G029500--Sobic006G007001 Sobic006G006000--Sobic002G058100 Sobic006G006000--Sobic010G191400 Sobic006G006000--Sobic005G027200 Sobic006G006000--Sobic002G095000 Sobic006G006000--Sobic004G029500 Sobic006G006000--Sobic001G349600 Sobic006G006100 Sobic006G006100 Sobic006G006000--Sobic006G006100 Sobic006G006000--Sobic005G081800 Sobic006G006000--Sobic005G130900 Sobic005G130900--Sobic005G080800 Sobic005G130900--Sobic001G349600 Sobic005G130900--Sobic010G191400 Sobic005G130900--Sobic005G027200 Sobic005G130900--Sobic002G058100 Sobic005G130900--Sobic005G154000 Sobic004G315900 Sobic004G315900 Sobic005G130900--Sobic004G315900 Sobic002G058000 Sobic002G058000 Sobic005G130900--Sobic002G058000 Sobic005G130900--Sobic006G006000 Sobic005G080800--Sobic005G130900 Sobic005G080800--Sobic001G349600 Sobic005G080800--Sobic004G315900 Sobic005G080800--Sobic002G058000 Sobic005G080800--Sobic010G191400 Sobic005G080800--Sobic005G027200 Sobic005G080800--Sobic005G154000 Sobic002G399700 Sobic002G399700 Sobic005G080800--Sobic002G399700 Sobic005G080800--Sobic002G058100 Sobic005G081800--Sobic002G095000 Sobic005G081800--Sobic010G129300 Sobic005G081800--Sobic004G029500 Sobic005G081800--Sobic006G007001 Sobic005G081800--Sobic002G058100 Sobic005G081800--Sobic005G027200 Sobic005G081800--Sobic010G191400 Sobic005G081800--Sobic006G006100 Sobic005G081800--Sobic006G006000
Octagon: transcription factors


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