Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G064400.1
Synonym Sb05g005430
Functional annotation eukaryotic aspartyl protease domain containing protein, expressed
UniProt C5Y684
Pfam PF14543
Panther DB PTHR13683 PTHR13683:SF331
NCBI CDD KOG1339; Aspartyl protease
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0006508; proteolysis GO:0004190aspartic-type endopeptidase activity


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT4G33490 : Eukaryotic aspartyl protease family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os11g08100.1 : eukaryotic aspartyl protease domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley HORVU4Hr1G017390.8 , HORVU4Hr1G017390.9 , HORVU4Hr1G017390.7 , HORVU4Hr1G017390.5 , HORVU4Hr1G017390.2 , HORVU4Hr1G017390.3 , HORVU4Hr1G017390.1 , HORVU4Hr1G017390.14 , HORVU4Hr1G017390.10 , HORVU4Hr1G017390.13
Wheat TraesCS4D02G094200 , TraesCS4D02G094300 , TraesCS4A02G219600 , TraesCS4A02G219500
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.005G064400


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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20 Sobic.007G041000 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic005G064400 Sobic005G064400 Sobic006G007001 Sobic006G007001 Sobic005G064400--Sobic006G007001 Sobic010G129300 Sobic010G129300 Sobic005G064400--Sobic010G129300 Sobic006G006100 Sobic006G006100 Sobic005G064400--Sobic006G006100 Sobic005G081800 Sobic005G081800 Sobic005G064400--Sobic005G081800 Sobic002G352401 Sobic002G352401 Sobic005G064400--Sobic002G352401 Sobic004G029500 Sobic004G029500 Sobic005G064400--Sobic004G029500 Sobic002G095000 Sobic002G095000 Sobic005G064400--Sobic002G095000 Sobic004G316400 Sobic004G316400 Sobic005G064400--Sobic004G316400 Sobic002G058100 Sobic002G058100 Sobic005G064400--Sobic002G058100 Sobic006G007001--Sobic010G129300 Sobic006G007001--Sobic005G064400 Sobic006G007001--Sobic005G081800 Sobic006G007001--Sobic004G029500 Sobic006G007001--Sobic002G095000 Sobic006G007001--Sobic006G006100 Sobic006G007001--Sobic002G058100 Sobic010G191400 Sobic010G191400 Sobic006G007001--Sobic010G191400 Sobic006G006000 Sobic006G006000 Sobic006G007001--Sobic006G006000 Sobic010G129300--Sobic005G081800 Sobic010G129300--Sobic006G007001 Sobic010G129300--Sobic004G029500 Sobic010G129300--Sobic002G095000 Sobic010G129300--Sobic002G058100 Sobic010G129300--Sobic010G191400 Sobic010G129300--Sobic006G006100 Sobic010G129300--Sobic005G064400 Sobic010G129300--Sobic006G006000 Sobic006G006100--Sobic006G006000 Sobic006G006100--Sobic005G081800 Sobic006G006100--Sobic010G129300 Sobic006G006100--Sobic006G007001 Sobic006G006100--Sobic002G095000 Sobic006G006100--Sobic004G029500 Sobic006G006100--Sobic005G064400 Sobic006G006100--Sobic002G058100 Sobic006G006100--Sobic010G191400 Sobic005G081800--Sobic002G095000 Sobic005G081800--Sobic010G129300 Sobic005G081800--Sobic004G029500 Sobic005G081800--Sobic006G007001 Sobic005G081800--Sobic002G058100 Sobic005G027200 Sobic005G027200 Sobic005G081800--Sobic005G027200 Sobic005G081800--Sobic010G191400 Sobic005G081800--Sobic006G006100 Sobic005G081800--Sobic006G006000 Sobic002G352401--Sobic005G064400 Sobic002G352401--Sobic006G007001 Sobic002G352401--Sobic010G129300 Sobic002G352401--Sobic005G081800 Sobic002G352401--Sobic006G006100 Sobic002G352401--Sobic002G095000 Sobic002G352401--Sobic004G029500 Sobic002G352401--Sobic004G316400 Sobic002G352401--Sobic002G058100 Sobic004G029500--Sobic002G095000 Sobic004G029500--Sobic002G058100 Sobic004G029500--Sobic010G191400 Sobic004G029500--Sobic010G129300 Sobic004G029500--Sobic005G081800 Sobic004G029500--Sobic005G027200 Sobic004G029500--Sobic006G006000 Sobic001G349600 Sobic001G349600 Sobic004G029500--Sobic001G349600 Sobic004G029500--Sobic006G007001 Sobic002G095000--Sobic004G029500 Sobic002G095000--Sobic002G058100 Sobic002G095000--Sobic005G081800 Sobic002G095000--Sobic010G191400 Sobic002G095000--Sobic005G027200 Sobic002G095000--Sobic010G129300 Sobic002G095000--Sobic006G006000 Sobic002G095000--Sobic001G349600 Sobic002G095000--Sobic006G007001 Sobic004G316400--Sobic010G129300 Sobic004G316400--Sobic006G007001 Sobic004G316400--Sobic005G081800 Sobic008G188300 Sobic008G188300 Sobic004G316400--Sobic008G188300 Sobic004G316400--Sobic005G064400 Sobic004G316400--Sobic004G029500 Sobic004G316400--Sobic002G095000 Sobic004G316400--Sobic002G058100 Sobic004G316400--Sobic006G006100 Sobic002G058100--Sobic010G191400 Sobic002G058100--Sobic004G029500 Sobic002G058100--Sobic002G095000 Sobic002G058100--Sobic005G027200 Sobic002G058100--Sobic001G349600 Sobic002G058100--Sobic006G006000 Sobic002G058100--Sobic005G081800 Sobic002G058100--Sobic010G129300 Sobic005G130900 Sobic005G130900 Sobic002G058100--Sobic005G130900
Octagon: transcription factors


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