Gene annotation
Transcriptome id Sobic.006G194900.1
Synonym Sb06g026760
Functional annotation invertase/pectin methylesterase inhibitor family protein, putative, expressed
UniProt C5YEN6
Pfam PF04043
Panther DB PTHR31080 PTHR31080:SF14
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0004857; enzyme inhibitor activity


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G46930 : Plant invertase/pectin methylesterase inhibitor superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os04g49730.1 : invertase/pectin methylesterase inhibitor family protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a010026
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.006G194900


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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20 Sobic.005G130900 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic006G194900 Sobic006G194900 Sobic004G316400 Sobic004G316400 Sobic006G194900--Sobic004G316400 Sobic005G064400 Sobic005G064400 Sobic006G194900--Sobic005G064400 Sobic002G352501 Sobic002G352501 Sobic006G194900--Sobic002G352501 Sobic010G129300 Sobic010G129300 Sobic006G194900--Sobic010G129300 Sobic006G007001 Sobic006G007001 Sobic006G194900--Sobic006G007001 Sobic008G188300 Sobic008G188300 Sobic006G194900--Sobic008G188300 Sobic004G309200 Sobic004G309200 Sobic006G194900--Sobic004G309200 Sobic002G352401 Sobic002G352401 Sobic006G194900--Sobic002G352401 Sobic005G081800 Sobic005G081800 Sobic006G194900--Sobic005G081800 Sobic004G316400--Sobic010G129300 Sobic004G316400--Sobic006G007001 Sobic004G316400--Sobic005G081800 Sobic004G316400--Sobic008G188300 Sobic004G316400--Sobic005G064400 Sobic004G029500 Sobic004G029500 Sobic004G316400--Sobic004G029500 Sobic002G095000 Sobic002G095000 Sobic004G316400--Sobic002G095000 Sobic002G058100 Sobic002G058100 Sobic004G316400--Sobic002G058100 Sobic006G006100 Sobic006G006100 Sobic004G316400--Sobic006G006100 Sobic005G064400--Sobic006G007001 Sobic005G064400--Sobic010G129300 Sobic005G064400--Sobic006G006100 Sobic005G064400--Sobic005G081800 Sobic005G064400--Sobic002G352401 Sobic005G064400--Sobic004G029500 Sobic005G064400--Sobic002G095000 Sobic005G064400--Sobic004G316400 Sobic005G064400--Sobic002G058100 Sobic005G179700 Sobic005G179700 Sobic002G352501--Sobic005G179700 Sobic005G200400 Sobic005G200400 Sobic002G352501--Sobic005G200400 Sobic005G027100 Sobic005G027100 Sobic002G352501--Sobic005G027100 Sobic002G352501--Sobic005G064400 Sobic002G352501--Sobic006G194900 Sobic006G144101 Sobic006G144101 Sobic002G352501--Sobic006G144101 Sobic002G345500 Sobic002G345500 Sobic002G352501--Sobic002G345500 Sobic002G352501--Sobic002G352401 Sobic004G090400 Sobic004G090400 Sobic002G352501--Sobic004G090400 Sobic010G129300--Sobic005G081800 Sobic010G129300--Sobic006G007001 Sobic010G129300--Sobic004G029500 Sobic010G129300--Sobic002G095000 Sobic010G129300--Sobic002G058100 Sobic010G191400 Sobic010G191400 Sobic010G129300--Sobic010G191400 Sobic010G129300--Sobic006G006100 Sobic010G129300--Sobic005G064400 Sobic006G006000 Sobic006G006000 Sobic010G129300--Sobic006G006000 Sobic006G007001--Sobic010G129300 Sobic006G007001--Sobic005G064400 Sobic006G007001--Sobic005G081800 Sobic006G007001--Sobic004G029500 Sobic006G007001--Sobic002G095000 Sobic006G007001--Sobic006G006100 Sobic006G007001--Sobic002G058100 Sobic006G007001--Sobic010G191400 Sobic006G007001--Sobic006G006000 Sobic008G188300--Sobic004G316400 Sobic005G153100 Sobic005G153100 Sobic008G188300--Sobic005G153100 Sobic008G188300--Sobic010G129300 Sobic008G188300--Sobic002G058100 Sobic005G154000 Sobic005G154000 Sobic008G188300--Sobic005G154000 Sobic005G027200 Sobic005G027200 Sobic008G188300--Sobic005G027200 Sobic002G399700 Sobic002G399700 Sobic008G188300--Sobic002G399700 Sobic001G312200 Sobic001G312200 Sobic008G188300--Sobic001G312200 Sobic008G188300--Sobic002G095000 Sobic004G309200--Sobic006G194900 Sobic004G309200--Sobic004G316400 Sobic004G309200--Sobic005G064400 Sobic004G309200--Sobic006G007001 Sobic004G309200--Sobic010G129300 Sobic004G309200--Sobic005G081800 Sobic004G309200--Sobic002G352401 Sobic004G309200--Sobic002G352501 Sobic004G309200--Sobic002G095000 Sobic002G352401--Sobic005G064400 Sobic002G352401--Sobic006G007001 Sobic002G352401--Sobic010G129300 Sobic002G352401--Sobic005G081800 Sobic002G352401--Sobic006G006100 Sobic002G352401--Sobic002G095000 Sobic002G352401--Sobic004G029500 Sobic002G352401--Sobic004G316400 Sobic002G352401--Sobic002G058100 Sobic005G081800--Sobic002G095000 Sobic005G081800--Sobic010G129300 Sobic005G081800--Sobic004G029500 Sobic005G081800--Sobic006G007001 Sobic005G081800--Sobic002G058100 Sobic005G081800--Sobic005G027200 Sobic005G081800--Sobic010G191400 Sobic005G081800--Sobic006G006100 Sobic005G081800--Sobic006G006000
Octagon: transcription factors


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