Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G154000.1,Sobic.005G154000.2
Synonym NTRA, ATNTRA, Sb05g021680, NTR2
Functional annotation thioredoxin reductase 2, putative, expressed
UniProt C5Y4F1 , A0A1B6PSQ1
Pfam PF00070
Panther DB PTHR22912 PTHR22912:SF183
NCBI CDD KOG0404; Thioredoxin reductase
KEGG Orthology K00384; trxB, thioredoxin reductase (NADPH)
Gene Ontology GO:0016491; oxidoreductase activity


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G17420 : NADPH-dependent thioredoxin reductase A
RAP-DB (Rice) LOC_Os02g48290.1 : thioredoxin reductase 2, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a042802 , Zm00025a034105 , Zm00025a021794
Brachypodium KQK18457
Barley HORVU7Hr1G046890.1 , HORVU7Hr1G046890.2 , HORVU7Hr1G046890.3 , HORVU7Hr1G046890.4 , HORVU6Hr1G070120.1 , HORVU6Hr1G070120.2 , HORVU6Hr1G070120.3
Wheat TraesCS7D02G229100 , TraesCS6B02G306300 , TraesCS6A02G278000 , TraesCS6A02G278000 , TraesCS7A02G225400 , TraesCS7A02G225400 , TraesCS6D02G258600 , TraesCS7B02G194200
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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20 Sobic.007G040400 - -


Gene co-expression network
sample Sobic005G154000 Sobic005G154000 Sobic005G080800 Sobic005G080800 Sobic005G154000--Sobic005G080800 Sobic005G130900 Sobic005G130900 Sobic005G154000--Sobic005G130900 Sobic002G399700 Sobic002G399700 Sobic005G154000--Sobic002G399700 Sobic001G349600 Sobic001G349600 Sobic005G154000--Sobic001G349600 Sobic002G058000 Sobic002G058000 Sobic005G154000--Sobic002G058000 Sobic004G315900 Sobic004G315900 Sobic005G154000--Sobic004G315900 Sobic005G027200 Sobic005G027200 Sobic005G154000--Sobic005G027200 Sobic010G191400 Sobic010G191400 Sobic005G154000--Sobic010G191400 Sobic002G058100 Sobic002G058100 Sobic005G154000--Sobic002G058100 Sobic005G080800--Sobic005G130900 Sobic005G080800--Sobic001G349600 Sobic005G080800--Sobic004G315900 Sobic005G080800--Sobic002G058000 Sobic005G080800--Sobic010G191400 Sobic005G080800--Sobic005G027200 Sobic005G080800--Sobic005G154000 Sobic005G080800--Sobic002G399700 Sobic005G080800--Sobic002G058100 Sobic005G130900--Sobic005G080800 Sobic005G130900--Sobic001G349600 Sobic005G130900--Sobic010G191400 Sobic005G130900--Sobic005G027200 Sobic005G130900--Sobic002G058100 Sobic005G130900--Sobic005G154000 Sobic005G130900--Sobic004G315900 Sobic005G130900--Sobic002G058000 Sobic006G006000 Sobic006G006000 Sobic005G130900--Sobic006G006000 Sobic005G153100 Sobic005G153100 Sobic002G399700--Sobic005G153100 Sobic002G399700--Sobic002G058000 Sobic002G399700--Sobic004G315900 Sobic002G399700--Sobic005G080800 Sobic002G399700--Sobic005G154000 Sobic002G031200 Sobic002G031200 Sobic002G399700--Sobic002G031200 Sobic010G120100 Sobic010G120100 Sobic002G399700--Sobic010G120100 Sobic002G399700--Sobic005G130900 Sobic005G223300 Sobic005G223300 Sobic002G399700--Sobic005G223300 Sobic001G349600--Sobic005G130900 Sobic001G349600--Sobic010G191400 Sobic001G349600--Sobic005G080800 Sobic001G349600--Sobic002G058100 Sobic001G349600--Sobic005G027200 Sobic004G029500 Sobic004G029500 Sobic001G349600--Sobic004G029500 Sobic001G349600--Sobic006G006000 Sobic002G095000 Sobic002G095000 Sobic001G349600--Sobic002G095000 Sobic001G349600--Sobic005G154000 Sobic002G058000--Sobic004G315900 Sobic002G058000--Sobic002G031200 Sobic002G058000--Sobic010G120100 Sobic002G058000--Sobic002G399700 Sobic002G058000--Sobic005G080800 Sobic002G058000--Sobic005G223300 Sobic002G058000--Sobic005G130900 Sobic002G058000--Sobic005G153100 Sobic002G058000--Sobic005G154000 Sobic004G315900--Sobic002G058000 Sobic004G315900--Sobic002G031200 Sobic004G315900--Sobic010G120100 Sobic004G315900--Sobic002G399700 Sobic004G315900--Sobic005G080800 Sobic004G315900--Sobic005G223300 Sobic004G315900--Sobic005G130900 Sobic005G189700 Sobic005G189700 Sobic004G315900--Sobic005G189700 Sobic004G315900--Sobic005G154000 Sobic005G027200--Sobic002G058100 Sobic005G027200--Sobic010G191400 Sobic005G027200--Sobic002G095000 Sobic005G027200--Sobic001G349600 Sobic005G027200--Sobic004G029500 Sobic005G027200--Sobic006G006000 Sobic005G027200--Sobic005G130900 Sobic005G027200--Sobic005G080800 Sobic005G081800 Sobic005G081800 Sobic005G027200--Sobic005G081800 Sobic010G191400--Sobic002G058100 Sobic010G191400--Sobic001G349600 Sobic010G191400--Sobic004G029500 Sobic010G191400--Sobic005G027200 Sobic010G191400--Sobic002G095000 Sobic010G191400--Sobic005G130900 Sobic010G191400--Sobic006G006000 Sobic010G191400--Sobic005G080800 Sobic010G191400--Sobic005G081800 Sobic002G058100--Sobic010G191400 Sobic002G058100--Sobic004G029500 Sobic002G058100--Sobic002G095000 Sobic002G058100--Sobic005G027200 Sobic002G058100--Sobic001G349600 Sobic002G058100--Sobic006G006000 Sobic002G058100--Sobic005G081800 Sobic010G129300 Sobic010G129300 Sobic002G058100--Sobic010G129300 Sobic002G058100--Sobic005G130900
Octagon: transcription factors


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