Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G142550.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1W0W3T3
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G107250 - -
2 Sobic.010G165925 - -
3 Sobic.001G369701 - -
4 Sobic.007G003250 - -
5 Sobic.010G180300 zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed -
6 Sobic.001G115200 - -
7 Sobic.005G019650 - -
8 Sobic.003G025500 ZOS8-02 - C2H2 zinc finger protein, expressed -
9 Sobic.010G236950 - -
10 Sobic.006G185150 - -
11 Sobic.006G024101 - -
12 Sobic.010G263051 - -
13 Sobic.008G135401 - -
14 Sobic.003G294550 - -
15 Sobic.006G196800 OsFBX177 - F-box domain containing protein, expressed -
16 Sobic.010G116200 bZIP transcription factor domain containing protein, expressed -
17 Sobic.001G519500 - -
18 Sobic.002G146701 - -
19 Sobic.006G007700 CAS1 domain-containing protein 1 precursor, putative, expressed -
20 Sobic.007G043050 - -


Gene co-expression network
sample Sobic002G142550 Sobic002G142550 Sobic005G107250 Sobic005G107250 Sobic002G142550--Sobic005G107250 Sobic010G165925 Sobic010G165925 Sobic002G142550--Sobic010G165925 Sobic001G369701 Sobic001G369701 Sobic002G142550--Sobic001G369701 Sobic007G003250 Sobic007G003250 Sobic002G142550--Sobic007G003250 Sobic010G180300 Sobic010G180300 Sobic002G142550--Sobic010G180300 Sobic001G115200 Sobic001G115200 Sobic002G142550--Sobic001G115200 Sobic005G019650 Sobic005G019650 Sobic002G142550--Sobic005G019650 Sobic003G025500 Sobic003G025500 Sobic002G142550--Sobic003G025500 Sobic010G236950 Sobic010G236950 Sobic002G142550--Sobic010G236950 Sobic005G107250--Sobic002G142550 Sobic005G107250--Sobic010G165925 Sobic005G107250--Sobic010G180300 Sobic005G107250--Sobic001G115200 Sobic005G107250--Sobic005G019650 Sobic005G107250--Sobic001G369701 Sobic005G107250--Sobic007G003250 Sobic006G185150 Sobic006G185150 Sobic005G107250--Sobic006G185150 Sobic006G024101 Sobic006G024101 Sobic005G107250--Sobic006G024101 Sobic010G165925--Sobic007G003250 Sobic010G165925--Sobic001G369701 Sobic010G165925--Sobic005G107250 Sobic010G165925--Sobic002G142550 Sobic006G196800 Sobic006G196800 Sobic010G165925--Sobic006G196800 Sobic010G165925--Sobic003G025500 Sobic010G165925--Sobic001G115200 Sobic010G165925--Sobic010G180300 Sobic010G263151 Sobic010G263151 Sobic010G165925--Sobic010G263151 Sobic001G369701--Sobic010G165925 Sobic001G369701--Sobic005G107250 Sobic001G369701--Sobic007G003250 Sobic001G369701--Sobic002G142550 Sobic006G007700 Sobic006G007700 Sobic001G369701--Sobic006G007700 Sobic001G519500 Sobic001G519500 Sobic001G369701--Sobic001G519500 Sobic001G369701--Sobic001G115200 Sobic007G043050 Sobic007G043050 Sobic001G369701--Sobic007G043050 Sobic001G369701--Sobic003G025500 Sobic007G003250--Sobic010G165925 Sobic007G003250--Sobic001G369701 Sobic007G003250--Sobic005G107250 Sobic007G003250--Sobic002G142550 Sobic007G003250--Sobic003G025500 Sobic007G003250--Sobic006G196800 Sobic007G003250--Sobic001G115200 Sobic007G003250--Sobic010G180300 Sobic007G003250--Sobic010G263151 Sobic010G180300--Sobic005G019650 Sobic010G180300--Sobic005G107250 Sobic010G180300--Sobic006G024101 Sobic010G180300--Sobic006G185150 Sobic010G180300--Sobic001G115200 Sobic003G294550 Sobic003G294550 Sobic010G180300--Sobic003G294550 Sobic008G135401 Sobic008G135401 Sobic010G180300--Sobic008G135401 Sobic010G180300--Sobic002G142550 Sobic010G263051 Sobic010G263051 Sobic010G180300--Sobic010G263051 Sobic001G115200--Sobic005G107250 Sobic001G115200--Sobic005G019650 Sobic001G115200--Sobic010G180300 Sobic001G115200--Sobic006G185150 Sobic001G115200--Sobic006G024101 Sobic001G115200--Sobic002G142550 Sobic001G115200--Sobic003G294550 Sobic001G115200--Sobic001G369701 Sobic001G115200--Sobic010G263051 Sobic005G019650--Sobic006G185150 Sobic005G019650--Sobic006G024101 Sobic005G019650--Sobic010G180300 Sobic005G019650--Sobic005G107250 Sobic005G019650--Sobic003G294550 Sobic005G019650--Sobic001G115200 Sobic005G019650--Sobic010G263051 Sobic005G019650--Sobic008G135401 Sobic004G300400 Sobic004G300400 Sobic005G019650--Sobic004G300400 Sobic003G025500--Sobic005G107250 Sobic003G025500--Sobic010G165925 Sobic003G025500--Sobic010G180300 Sobic003G025500--Sobic002G142550 Sobic003G025500--Sobic001G369701 Sobic003G025500--Sobic007G003250 Sobic003G025500--Sobic001G115200 Sobic003G025500--Sobic005G019650 Sobic003G025500--Sobic006G024101 Sobic010G236950--Sobic002G142550 Sobic010G236950--Sobic005G107250 Sobic010G236950--Sobic010G263051 Sobic010G236950--Sobic010G180300 Sobic010G236950--Sobic005G019650 Sobic010G236950--Sobic010G165925 Sobic010G236950--Sobic001G115200 Sobic010G236950--Sobic006G185150 Sobic010G236950--Sobic003G025500
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.